| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,802,115 | Δ1 bp | 5.0% | coding (2057/3525 nt) | dnaEA → | DNA polymerase III subunit alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,802,115 | 0 | T | . | 5.0% | 316.0 / 10.0 | 99 | coding (2057/3525 nt) | dnaEA | DNA polymerase III subunit alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/50); new base . (2/3); total (46/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.49e-01 | |||||||||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GTTGCGTTGTTCCGCCCGGGCCCGCTGCAATCGGGCATGGTGGACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATGGCCAAGCAGCGCGGTGGTTTCATCGAAGGTTGCGTGGCCA > NC_002947/1801967‑1802264 | ttgttCCGCCCGGGCCCGCTGCAATCGGGCATGGTGGACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTAc > 1:589151/1‑150 (MQ=255) ttgttCCGCCCGGGCCCGCTGCAATCGGGCATGGTGGACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTAc > 2:647712/1‑150 (MQ=255) ttCCGCCCGGGCCCGCTGCAATCGGGCATGGTGGACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAg < 1:1072753/150‑1 (MQ=255) ccGCCCGGGCCCGCTGCAATCGGGCATGGTGGACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCatcatc > 1:460740/1‑139 (MQ=255) ccGCCCGGGCCCGCTGCAATCGGGCATGGTGGACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCatcatc < 2:460740/139‑1 (MQ=255) cGCCCGGGCCCGCTGCAATCGGGCATGGTGGACGACTTCATCAACCGCCCGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGaa > 2:1791419/1‑150 (MQ=255) cccGGGCCCGCTGCAATCGGGCATGGTGGACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACa < 1:1184571/150‑1 (MQ=255) ccGGGCCCGCTGCAATCGGGCATGGTGGACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAg < 2:906601/150‑1 (MQ=255) gggCCCGCTGCAATCGGGCATGGTGGACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑t < 2:211531/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTGCAATCGGGCATGGTGGACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGa < 1:993847/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTGCAATCGGGCATGGTGGACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGa < 2:275722/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTGCAATCGGGCATGGTGGACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCA‑CCTGTTCCTGGTACAggatga < 2:619014/150‑5 (MQ=255) gCTGCAATCGGGCATGGTGGACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCatcatc > 1:492667/1‑127 (MQ=255) gCTGCAATCGGGCATGGTGGACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCatcatc < 2:492667/127‑1 (MQ=255) cAATCGGGCATGGTGGACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATc < 2:1060675/150‑1 (MQ=255) aaTCGGGCATGGTGGACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCg > 1:2106283/1‑150 (MQ=255) ggtggACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGAt < 1:811969/150‑1 (MQ=255) tggACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATgg > 2:2152747/1‑150 (MQ=255) cgacTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCAACAACCCACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAgg < 2:214498/150‑1 (MQ=255) gacTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGt > 2:1511363/1‑150 (MQ=255) gacTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGt > 2:1275749/1‑150 (MQ=255) ttCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCA‑CCTGTTCCTGGTACAGGATGATGc > 1:473415/1‑124 (MQ=38) atcaACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATAcc < 1:2152747/150‑1 (MQ=255) tcaACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACGCGCACTCAGACGACCAGTACGAAGGCGTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATAccc > 2:1381632/1‑150 (MQ=255) tcaACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATAccc > 1:763369/1‑150 (MQ=255) tcaACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCCGGTAAAGAAAAAAGCGAGCTGGACCAGAAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTGATAccc > 1:285342/1‑150 (MQ=255) aaCCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGACACGG‑GGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTg > 1:633937/1‑150 (MQ=255) aaCCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTg < 1:1751796/150‑1 (MQ=255) aCCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTgg < 2:869342/150‑1 (MQ=255) aaGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAg > 2:2269887/1‑133 (MQ=255) aaGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAg < 1:2269887/133‑1 (MQ=255) aaGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGgc > 1:2094324/1‑150 (MQ=255) aaGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGgc > 1:313591/1‑150 (MQ=255) gCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGgcgc < 2:763369/150‑1 (MQ=255) aaCGGCCGCGCAGAGCTGGCCTACCCGCATTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAAGATG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGcc < 2:336909/149‑1 (MQ=255) cGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGa < 1:2154256/150‑1 (MQ=255) cgcgCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGCGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACAtg < 2:1953331/150‑1 (MQ=255) gcCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACAtgctg > 1:316594/1‑150 (MQ=255) gcCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACAtgctg > 2:218057/1‑150 (MQ=255) gccaGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACAtgctgc > 2:1693283/4‑150 (MQ=255) cGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTgcg > 1:765897/1‑150 (MQ=255) aGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGcc > 1:1693828/1‑150 (MQ=255) cTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGcctg < 1:1275749/150‑3 (MQ=255) cTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCgg < 2:2390424/150‑1 (MQ=255) tGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCA‑CCTGTTCCTGGTACAggatga < 2:1610440/90‑5 (MQ=37) tGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCA‑CCTGTTCCTGGTACAggatga > 1:1610440/1‑86 (MQ=37) gCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGcc > 1:1082137/1‑150 (MQ=255) ccTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCa > 2:2383135/1‑150 (MQ=255) cTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACa > 2:985422/1‑134 (MQ=255) cTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACa < 1:985422/134‑1 (MQ=255) aCCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCACGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATgg < 1:623366/150‑1 (MQ=255) ccGCACTCTGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGt > 1:1241739/1‑150 (MQ=255) ccGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAGGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAg < 1:895715/106‑1 (MQ=255) ccGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAGGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAg > 2:895715/1‑106 (MQ=255) ccGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGGTGCGCCGGGCCATGGGt > 1:735042/1‑150 (MQ=255) ccGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCTCTGGGt > 1:185294/1‑150 (MQ=255) cGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGa > 1:712529/1‑127 (MQ=255) gCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATg < 1:168396/82‑1 (MQ=255) gCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATg > 2:168396/1‑82 (MQ=255) gCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTaa > 1:234980/1‑150 (MQ=255) cGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGAt < 1:907360/93‑1 (MQ=255) cGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGAt > 2:907360/1‑93 (MQ=255) tACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGccc < 1:1791419/150‑1 (MQ=255) ccAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGgcgc < 2:134856/111‑1 (MQ=255) ccAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGgcgc > 1:134856/1‑111 (MQ=255) ccAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATgg > 1:1399586/1‑134 (MQ=255) ccAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATgg < 2:1399586/134‑1 (MQ=255) ccAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGa > 1:638166/1‑150 (MQ=255) cAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAg < 1:1511363/150‑1 (MQ=255) cAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAg < 1:218057/150‑1 (MQ=255) 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cGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATGGCCAAGCAGcgcg > 1:581940/1‑150 (MQ=255) gTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATGGCCAAGCAGCGCggt < 1:2120283/150‑1 (MQ=255) gTACGGCCGCCAACCTACGGCATCATCCCGTACCAAGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGACATGGCCAAGCAGCGCggt < 1:195399/150‑1 (MQ=255) tACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATGGCCAAGCAGCGCggtg < 2:1693828/150‑1 (MQ=255) tACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATGGCCAAGCAGCGCggtg < 2:754859/150‑1 (MQ=255) tGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGaaaaa > 1:2116782/1‑118 (MQ=255) tGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGaaaaa < 2:2116782/118‑1 (MQ=255) tGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATGGCCAAGCAGCGCGGTGGtt < 2:474222/150‑1 (MQ=255) gcgcCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATGGCCAAGCAGCGCGGTGGTTTc > 1:416983/1‑150 (MQ=255) cgcCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATGGCCAAGCAGCGCGGTGGTTTCa < 2:842890/150‑1 (MQ=255) ccAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATGGCCAAGCAGCGCGGTGGTTTCATc > 2:528190/1‑150 (MQ=255) aCCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATGGCCAAGCAGCGCGGTGGTTTCATCGaa < 2:313591/150‑1 (MQ=255) aCCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATGGCCAAGCAGCGCGGTGGTTTCATCGaa < 2:581940/150‑1 (MQ=255) atcCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATg > 2:42843/1‑111 (MQ=255) atcCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATg < 1:42843/111‑1 (MQ=255) atcCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATGGCCAAGCAGCGCggtggt < 2:1937185/129‑1 (MQ=255) atcCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATGGCCAAGCAGCGCGGTGGTTTCATCGAAGGTTGCGTGGcc < 1:1693283/150‑1 (MQ=255) atcCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGACATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATGGCCAAGCAGCGCGGTGGTTTCATCGAAGGTTGCGTGGcc > 2:1883298/1‑150 (MQ=255) tcCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGGCCAGGTGATTGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATGGCCAAGCAGCGCGGTGGTTTCATCGAAGGTTGCGTGGCca > 1:54129/1‑150 (MQ=255) tcCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATGGCCAAGCAGCGCGGTGGTTTCATCGAAGGTTGCGTGGCca > 2:226967/1‑150 (MQ=255) | GTTGCGTTGTTCCGCCCGGGCCCGCTGCAATCGGGCATGGTGGACGACTTCATCAACCGCAAGCACGGCCGCGCCGAGCTGGCCTACCCGCACTCCGACTACCAGTACGAAGGCCTCAAGCCGGTACTGGCGCCAACCTACGGCATCATCCTGTACCAGGAACAGG‑TGATGCAGATCGCCCAGGTGATGGCAGGTTATACCCTGGGTGGCGCCGACATGCTGCGCCGGGCCATGGGTAAGAAAAAGCCCGAGGAAATGGCCAAGCAGCGCGGTGGTTTCATCGAAGGTTGCGTGGCCA > NC_002947/1801967‑1802264 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |