| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,447,098:1 | +A | 5.5% | coding (444/1011 nt) | nagZ → | beta‑N‑acetylglucosaminidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,447,098 | 1 | . | A | 5.5% | 447.7 / 17.7 | 110 | coding (444/1011 nt) | nagZ | beta‑N‑acetylglucosaminidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (52/52); new base A (4/2); total (56/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.57e-01 | |||||||||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GTGCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCC > NC_002947/2446954‑2447247 | gTGCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTTGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCCGCTTGCAACTCGCCTGGCC‑Ggcgc > 2:245824/1‑150 (MQ=255)gTGCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑Ggcgc < 1:2187488/150‑1 (MQ=255)gTGCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑Ggcgc < 1:588403/150‑1 (MQ=255)gTGCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑Ggcgc > 2:2187488/1‑150 (MQ=255)gTGCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑Ggcgc > 2:156102/1‑150 (MQ=255) gCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGt < 2:820724/150‑1 (MQ=255) cGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCC‑GGCCAGGCGCGtt < 2:2292555/150‑1 (MQ=255) gctgATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGTC‑GGCGCGTTCATCCg > 2:1677016/1‑150 (MQ=255) gctgATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCg > 2:467185/1‑150 (MQ=255) ctgATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGt < 2:824556/150‑1 (MQ=255) aTGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATc > 1:1208670/1‑144 (MQ=255) aTGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATc < 2:1208670/144‑1 (MQ=255) gaaGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTTGGCAACCGCGCGGT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGGGTTCATCCGTGGCATGAATgc < 2:1061302/148‑1 (MQ=255) aGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATgcgg > 2:1829584/1‑150 (MQ=255) tGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGcggcgg < 2:1071346/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGcggcgg < 1:1677016/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGcggcgg < 1:467185/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGcggcgg < 1:115180/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGcggcgg < 1:1864113/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGTTGGCCTGCACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGcggcgg < 2:144270/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGCCCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTa > 2:1143506/1‑150 (MQ=255) tGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTCGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCgggga > 1:1034197/1‑148 (MQ=255) tGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTa < 1:1829584/150‑1 (MQ=255) ccTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCCCGACGCGGAACACCAGCGTAGCTCCGTGGTGGGTCACCGCGCGTTACACCAGTCACCCTCAG‑TTATATCGTATCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGACTGCGGCCGGCATGGCCGCCtg > 1:551678/1‑150 (MQ=255) ccTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCaa < 1:2071698/150‑1 (MQ=255) cTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAg > 2:618689/1‑150 (MQ=255) cTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAg > 2:996055/1‑150 (MQ=255) aGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCAt > 1:334160/1‑150 (MQ=255) gCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCAtt < 1:999007/150‑1 (MQ=255) gCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCAtt > 1:352999/1‑150 (MQ=255) cTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCAttt < 1:797221/150‑1 (MQ=255) tCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTcc > 2:1635249/1‑150 (MQ=255) cTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGACAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGAAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCgg > 2:1926243/1‑150 (MQ=255) tCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCggg < 1:2275134/150‑1 (MQ=255) tCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCggg > 2:147892/1‑150 (MQ=255) tCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGGAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGGGTT‑CGAGGGTGTCCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCggg < 2:455538/150‑1 (MQ=255) cGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGc > 1:839866/1‑150 (MQ=255) gTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTccc > 1:2112688/1‑143 (MQ=255) gTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTccc < 2:2112688/143‑1 (MQ=255) gTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCAt < 1:1802917/150‑1 (MQ=255) tCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCaa < 2:725702/130‑1 (MQ=255) tCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCaa > 1:725702/1‑130 (MQ=255) cGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTg < 1:92590/150‑1 (MQ=255) gACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTgg < 1:1716910/150‑1 (MQ=255) gACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTgg < 1:618689/150‑1 (MQ=255) cccgctacccccAGCGCAGCGCCGTGGTGGGCGGCCGCGCGTT‑CGATTGTCTCCCGCTGCTTCCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCATGGTATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTggg < 2:1034197/144‑1 (MQ=255) cTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCAt > 1:189948/1‑95 (MQ=255) cTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCAt < 2:189948/95‑1 (MQ=255) cTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGTGGCATGGCTGGGcc > 1:2298779/1‑150 (MQ=255) gACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGaa < 2:839866/150‑1 (MQ=255) caccaGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTgg < 1:996495/86‑1 (MQ=255) accaGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGTCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGaa < 1:1504967/146‑1 (MQ=255) ccaGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGa > 1:1512321/1‑150 (MQ=255) caGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCgg < 1:1575215/127‑1 (MQ=255) caGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCgg > 2:1575215/1‑127 (MQ=255) caGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGAt > 1:1164910/1‑150 (MQ=255) caGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGAt < 1:1615025/150‑1 (MQ=255) aGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGAtt > 2:2018760/1‑150 (MQ=255) gCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTc < 2:961742/150‑1 (MQ=255) cgcCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGCGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATCCATGCGGAGCGTCTGGCTCCCGCGCATAATCGTGTCCCCGCGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGt < 1:658307/150‑1 (MQ=255) tctgtggtgGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGACTCATTCCCTACACGCC‑GTTGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTg < 2:62830/147‑1 (MQ=255) tggtggGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGTTCTTCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCGCGTggaga > 1:62830/1‑147 (MQ=255) tggtggGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCa < 1:209016/150‑1 (MQ=255) gCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCa < 1:156102/150‑1 (MQ=255) cgcgcgTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACtgat > 1:1917968/1‑150 (MQ=255) gcgTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGaa > 1:322623/1‑150 (MQ=255) cgTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAAc < 2:1818456/150‑1 (MQ=255) cgTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAAc < 2:322623/150‑1 (MQ=255) gTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACg > 2:1555161/1‑150 (MQ=255) t‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGTGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCa < 1:966638/150‑1 (MQ=255) gAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCaa > 2:1670907/1‑83 (MQ=255) gAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCaa < 1:1670907/83‑1 (MQ=255) gAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGc > 1:1039961/1‑150 (MQ=255) gggTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCtgtg > 1:2392698/1‑77 (MQ=255) gTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGACTGCGACGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTgg > 1:668158/1‑150 (MQ=255) gACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGaa > 1:2087445/1‑150 (MQ=255) gACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGaa < 1:1944534/150‑1 (MQ=255) cccGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTgg > 2:1348006/1‑42 (MQ=255) ccGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTg > 1:1540006/1‑40 (MQ=255) ccGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTg < 2:1540006/40‑1 (MQ=255) ccGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTg < 2:1539740/40‑1 (MQ=255) ccGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTg > 1:1539740/1‑40 (MQ=255) ccGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTggg < 2:485113/97‑1 (MQ=255) ccGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACtga > 1:1069590/1‑131 (MQ=255) gatgaaCGCGCC‑GGCCAGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGCTGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGcc > 1:1467111/5‑150 (MQ=255) atgaaCGCGCC‑GGCCAGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCggg > 1:1172658/4‑78 (MQ=38) atgaaCGCGCC‑GGCCAGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCggg < 2:1172658/75‑1 (MQ=38) atgaaCGCGCC‑GGCCAGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCa > 1:1970434/4‑150 (MQ=255) gCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAg > 1:671539/1‑150 (MQ=255) aaCGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTc > 2:680068/1‑150 (MQ=255) aaCGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTc < 1:245824/150‑1 (MQ=255) aaCGCGCCGGCCA‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTc > 1:38712/1‑150 (MQ=255) aCGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTcc < 2:1102456/150‑1 (MQ=255) aCGCGCC‑GGCCAGGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTcc > 1:1185250/1‑150 (MQ=255) gcgcCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGa > 1:436632/1‑150 (MQ=255) cTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTg < 1:855368/99‑1 (MQ=255) cTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTg > 2:855368/1‑99 (MQ=255) tGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTgg > 2:2229736/1‑150 (MQ=255) cc‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGc > 2:28267/1‑150 (MQ=255) c‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGcc < 1:1018044/150‑1 (MQ=255) | GTGCGGCTGGCTGATGGCGACCGAGGTGCTGGCGGTTGGCCTGGACCTCAGCTTCGCTCCGGTGCTCGACCTGGACCACCAGCGTAGCGCCGTGGTGGGCAGCCGCGCGTT‑CGAGGGTGACCCGCTGCTTGCAACGCGCCTGGCC‑GGCGCGTTCATCCGTGGCATGAATGCGGCGGGTATGGCCGCCTGTGGCAAGCATTTCCCGGGGCATGGCTGGGCCGAAGCCGATTCGCACGTGGCCATCCCCACTGATGAACGCAGCCTGGAACAACTGCGCCAGTCCGACCTGGTGCC > NC_002947/2446954‑2447247 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |