| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 614,601:1 | +A | 5.8% | coding (649/888 nt) | ispA ← | farnesyl diphosphate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 614,601 | 1 | . | A | 5.8% | 487.6 / 22.1 | 120 | coding (649/888 nt) | ispA | farnesyl diphosphate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (60/53); new base A (2/5); total (62/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.61e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.36e-01 | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCCTGCTGGTCCAGCT > NC_002947/614452‑614750 | gcgcAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGc > 1:1806257/1‑150 (MQ=255)gcgcAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGc > 1:1579105/1‑150 (MQ=255) gcAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑Ca > 1:2102202/1‑150 (MQ=255) gcAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑Ca > 2:699876/1‑150 (MQ=255) gcAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑Ca < 1:1587329/150‑1 (MQ=255) gcAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCCCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑Ca > 2:171956/1‑150 (MQ=255) cAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAg < 1:1342561/150‑1 (MQ=255) ttCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCACAGGc > 2:1348820/1‑150 (MQ=255) gATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAAt > 1:2323806/1‑150 (MQ=255) gATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCGGGAATGC‑CAGGCCAAt < 1:195250/150‑1 (MQ=255) aTTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATg > 1:853659/1‑150 (MQ=255) aTAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑Ca > 2:785742/1‑137 (MQ=255) aTAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑Ca < 1:785742/137‑1 (MQ=255) aTAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCtg > 2:1452734/1‑150 (MQ=255) aTAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCACGAAGTGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCtg > 1:65922/1‑150 (MQ=255) tAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCtgt < 1:2324056/150‑1 (MQ=255) gCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCTGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCa < 1:1393969/150‑1 (MQ=255) gCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCACAGGCCATTGGCCtggca < 1:1348820/150‑4 (MQ=255) gCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCACAGGCCATTGGCCtggca < 2:1128586/150‑4 (MQ=255) gCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATgg < 1:1424573/142‑1 (MQ=255) gCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATgg > 2:1424573/1‑142 (MQ=255) ggcggcTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCtg > 2:2310108/1‑141 (MQ=255) gcggcTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCACTCGACTGTGccgcagtt > 2:517225/1‑143 (MQ=255) ggcTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGc > 1:2251515/1‑128 (MQ=255) ggcTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGc < 2:2251515/128‑1 (MQ=255) ctacccggCCCTGCTGGGCCTGGAAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATaa < 1:1052448/137‑1 (MQ=255) ctacccggCCCTGCTGGGCCTGGAAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATaa > 2:1052448/7‑143 (MQ=255) cTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCa < 2:169625/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGc < 1:971321/132‑1 (MQ=255) tacccggCCCTGCTGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAg > 2:1565837/6‑150 (MQ=255) tCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAgg < 2:2102202/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCCACTTGGCTTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAggg < 2:65922/150‑1 (MQ=255) ccggCCCTGCTGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGc > 1:310337/3‑150 (MQ=255) cAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGc < 1:1866217/129‑1 (MQ=255) cAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGc > 2:1866217/1‑129 (MQ=255) aGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAAt > 1:950521/1‑125 (MQ=255) aGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAAt < 2:950521/125‑1 (MQ=255) gCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCa < 2:967366/143‑1 (MQ=255) ccAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAg < 2:1368765/142‑1 (MQ=255) ccAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAg > 1:1368765/1‑142 (MQ=255) ccAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTATGCACCTTGAAGTTTGCAAAAGGTAGCGGTGTAGATCTTAACGTCGAGGATGTAGTCCTGCAACTGCAATGC‑AGAGCGAATGATGTGTGCATAATTTTGTAGGGcttata > 2:1007248/1‑145 (MQ=255) cagcagGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAg > 2:1266964/1‑150 (MQ=255) ccGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCg > 1:1677634/1‑150 (MQ=255) ggTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGtt < 1:699876/150‑1 (MQ=255) gTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTc < 1:1565837/150‑1 (MQ=255) gTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCATCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCa > 2:1906688/1‑150 (MQ=255) gTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCtgtg < 1:850866/112‑1 (MQ=255) gTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCtgtg > 2:850866/1‑112 (MQ=255) tCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCAc > 1:356841/1‑150 (MQ=255) ggTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACgg < 2:1677634/150‑1 (MQ=255) tCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACtt > 2:1373758/1‑150 (MQ=255) aCGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCACAGGCCatt < 1:948214/94‑3 (MQ=255) aCGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGCACAGGCCatt > 2:948214/1‑92 (MQ=255) aCGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGc > 1:2113666/1‑117 (MQ=255) aCGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGc < 2:2113666/117‑1 (MQ=255) aCGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCACAAGTTTGCa < 1:1099237/113‑1 (MQ=255) aCGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCACAAGTTTGCa > 2:1099237/1‑113 (MQ=255) gTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGcc < 2:1579105/150‑1 (MQ=255) tCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCg > 2:1797645/1‑150 (MQ=255) tCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCg > 2:1257848/1‑150 (MQ=255) gCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAgg > 1:2142581/1‑150 (MQ=255) cTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTa > 1:1599188/1‑150 (MQ=255) tGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCAAAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACg < 2:860482/150‑1 (MQ=255) 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tttCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGc > 2:1328946/1‑117 (MQ=255) tttCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGc < 1:1328946/117‑1 (MQ=255) aCGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCgg > 2:1070229/1‑150 (MQ=255) cGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGt < 1:1007248/150‑1 (MQ=255) cgcggATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAACTTCACCGGTCCGCAACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCa < 1:171956/147‑1 (MQ=255) ggATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGc > 1:1917298/1‑111 (MQ=255) ggATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGc < 2:1917298/111‑1 (MQ=255) tcgtcCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCAt > 2:2172182/1‑143 (MQ=255) gtcCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAgcgc < 1:231110/120‑1 (MQ=255) gtcCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAgcgc < 2:190981/120‑1 (MQ=255) gtcCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAgcgc > 2:231110/1‑120 (MQ=255) tcCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTg > 1:669435/1‑137 (MQ=255) tcCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTg < 2:669435/137‑1 (MQ=255) ccTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAgcg > 2:2389835/1‑150 (MQ=255) cTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTACAgcgc > 1:33992/1‑150 (MQ=255) aCCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCctgc > 2:5401/1‑150 (MQ=255) cTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTTCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAAGGCGCCGAGGCGTAAGCTGGCTTCGGTGAGCGCGCCTGTCGTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCctgctg > 1:1967309/1‑150 (MQ=255) cTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCctgctg < 1:1070229/150‑1 (MQ=255) cTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCctgctg < 1:2184487/150‑1 (MQ=255) tGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCCTGCTgg < 1:1257848/150‑1 (MQ=255) c‑cAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGaa < 2:653794/127‑1 (MQ=255) c‑cAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGaa > 1:653794/1‑127 (MQ=255) c‑cAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCCTGCTGGTCCAGCt > 1:1898868/1‑150 (MQ=255) c‑cAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTAGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCgg < 1:1631550/119‑1 (MQ=255) c‑cAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTAGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCgg > 2:1631550/1‑119 (MQ=255) | GCGCAGTTCGATTGCATAGGCTTTGGCGGCTTCCAGGCCCAGCAGGGCCGGGTAGGTCGGTTTGTCACGCGCTATGTCTGCACCTTGGCGTTTGCCCAAGGTAGCAGTGTCGCTTTCCACGTCGAGGATGTCGTCCTGCACCTGGAATGC‑CAGGCCAATGGCCTGTGCATAAGTTTGCAGGGCATCCAGCTGCACCGGTTCGGCACGGGCACTTGCCAGGGCGCCGAGGCGTACGCTGGCTTCGATCAGCGCGCCGGTCTTGTGCCGGTGCATGAACTCCAGCGCCTGCTGGTCCAGCT > NC_002947/614452‑614750 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |