| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 624,433:1 | +A | 7.8% | coding (477/702 nt) | PP_0537 ← | transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 624,433 | 1 | . | A | 7.8% | 293.1 / 19.1 | 77 | coding (477/702 nt) | PP_0537 | transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (42/29); new base A (3/3); total (45/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.98e-01 | |||||||||||
AGCAGCGGTGTAGCGTTCGACCGTGTAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGTGCTTGCTGCCCACCG > NC_002947/624286‑624578 | ggcagcGGTGTAGCGTTCGACCGTGTAGTTGCGTCGTTCATGGCTTTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑cc < 2:2322994/149‑1 (MQ=255) aGCGTTCGACCGTGTAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGG‑‑CATGACCCAGGtggtcga < 2:1755112/150‑7 (MQ=255) cGTTCGACCGTGTAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGcc < 1:860/150‑1 (MQ=255) gTTCGACCGTGTAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCa > 1:935864/1‑150 (MQ=255) cGTGTAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGc > 2:1732687/1‑150 (MQ=255) tgtAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCtt > 2:1614988/1‑150 (MQ=255) gtAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGGGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGt > 2:159623/1‑131 (MQ=255) gtAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGGGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGt < 1:159623/131‑1 (MQ=255) aGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCa < 1:222791/150‑1 (MQ=255) ggcgcCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTTGTGCGGGCCAAGACTGAGCTTGTTTACCCTGACCAAGCCGCCTTCCATCACGGCCTATGTTTCCCCCGCTACC‑TTTGGGTGCATG‑CGTACGTCGGTGGTCAGGGTAGCTTGCAGCg < 2:276528/149‑1 (MQ=255) gcgcCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCtt < 2:591028/143‑1 (MQ=255) gcgcCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCtt > 1:591028/1‑143 (MQ=255) cGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATCGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATc > 2:685757/1‑150 (MQ=255) gTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAACGGAATCAg > 1:1652361/1‑150 (MQ=255) aTGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCgg > 2:1368297/1‑150 (MQ=255) gtgCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCAt < 2:1218102/150‑1 (MQ=255) cAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCa > 1:879938/1‑128 (MQ=255) cAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCa < 2:879938/128‑1 (MQ=255) aGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGG‑‑CATGACCCAGGt < 1:290259/106‑1 (MQ=255) aGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGG‑‑CATGACCCAGGt > 2:290259/1‑106 (MQ=255) ggTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTc < 2:455226/99‑1 (MQ=255) ggTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTc > 1:455226/1‑99 (MQ=255) gtCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCAt > 2:1971888/1‑150 (MQ=255) gTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAg < 2:1865822/114‑1 (MQ=255) gTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAg > 1:1865822/1‑114 (MQ=255) gCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGACATTGCCAGGCa < 1:623083/150‑1 (MQ=255) gCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTAAAAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCa < 1:634784/150‑1 (MQ=255) cAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGa > 2:2085091/1‑150 (MQ=255) cAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGa > 1:1809262/1‑150 (MQ=255) gACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCAtt > 2:1148220/1‑137 (MQ=255) gACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCAtt < 1:1148220/137‑1 (MQ=255) tGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGt > 2:1983924/1‑150 (MQ=255) gAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGtt < 1:1983924/150‑1 (MQ=255) ggTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGAtt < 1:1271769/143‑1 (MQ=255) ggTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGAtt > 2:1271769/1‑143 (MQ=255) gttgttTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAggg < 1:1002749/86‑1 (MQ=255) gttgttTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAggg > 2:1002749/1‑86 (MQ=255) gttgttTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGcc > 2:863582/1‑150 (MQ=255) tttACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGCCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCt > 1:2143620/1‑150 (MQ=255) tttACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGAAGCGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCt < 1:906143/150‑1 (MQ=255) ccTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTg < 2:1530836/122‑1 (MQ=255) ccTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGcac > 1:970702/1‑150 (MQ=255) ccTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGcac > 1:2107721/1‑150 (MQ=255) ccTGAGCATGCCGTTTTGCAGAAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTg > 1:1530836/1‑122 (MQ=255) cTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGcaca > 1:851698/1‑150 (MQ=255) tGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCacac > 1:2359371/1‑150 (MQ=255) aTGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAg < 1:1732687/150‑1 (MQ=255) gCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGcc > 2:1639583/1‑150 (MQ=255) cGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGcccc > 2:66998/1‑149 (MQ=255) tttGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCa < 1:1368297/150‑1 (MQ=255) tGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAgg < 1:1614988/150‑1 (MQ=255) agcagGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGc > 1:1804360/1‑139 (MQ=255) agcagGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGc < 2:1804360/139‑1 (MQ=255) gcagGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑GGTG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCtt > 1:314213/1‑150 (MQ=255) agGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTGAAGGGCttgg < 2:2107721/150‑3 (MQ=255) gCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCGTGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGcc > 2:1964175/1‑150 (MQ=255) gCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGTGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGcc > 2:1817194/1‑150 (MQ=255) gCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGcc > 1:105057/1‑150 (MQ=255) aTAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCgg > 2:1564040/1‑150 (MQ=255) gTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAg < 2:851698/150‑1 (MQ=255) tttCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAgc > 1:942918/1‑150 (MQ=255) ccTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCg < 2:2149256/138‑1 (MQ=255) ccTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCg > 1:2149256/1‑138 (MQ=255) ccTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGt > 2:1112037/1‑150 (MQ=255) tCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGtgc > 2:2084110/1‑150 (MQ=255) tCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGggc > 2:1081844/1‑150 (MQ=255) atcgaccTGGG‑‑CATGACCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCTTCGCTTCGGAGAGTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCCTTTCACGCCAATGGCAGGtgctt > 1:1955613/5‑150 (MQ=255) tcgaccTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGtgcttg > 2:1325397/4‑150 (MQ=255) caccTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGtgcttgct < 2:647965/150‑1 (MQ=255) accTGGG‑‑CATGACCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCtttt < 1:1046341/126‑1 (MQ=255) accTGGG‑‑CATGACCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGAGCtttt > 2:1046341/1‑126 (MQ=255) cTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGc < 2:222594/110‑1 (MQ=255) cTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGc > 1:222594/1‑110 (MQ=255) ggT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGc < 2:1940308/89‑1 (MQ=255) ggT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGc > 1:1940308/1‑89 (MQ=255) t‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGTGCTTGCTGCCCACCg < 1:1325397/150‑1 (MQ=255) tG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCaa < 2:1062072/124‑1 (MQ=255) tG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCaa > 1:1062072/1‑124 (MQ=255) | AGCAGCGGTGTAGCGTTCGACCGTGTAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGT‑CATG‑CCCAGGTCGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGTGCTTGCTGCCCACCG > NC_002947/624286‑624578 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |