| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 100443 = | 116 (1.310) | 8 (0.100) | 7/212 | NT | 7.2% | intergenic (‑35/+87) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 100525 = | 105 (1.380) | intergenic (‑117/+5) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein | |||||
ATTTTTCTCCTACAGCGCCGGCAACTACGTGAAGCTCAAGGACCAGCACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/100608‑100443‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgggcatgcccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGTAGCCAC > NC_002947/100525‑100672 ATTTTTCTCCTACAGCGCCGGCAACTACGTGAAGCTCAAGGACCAGCACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAG > 2:774151/1‑150ATTTTTCTCCTACAGCGCCGGCAACTACGTGAAGCTCAAGGACCAGCACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAG > 1:1414785/1‑150 TTTCTCCTACAGCGCCGGCAACTACGTGAAGCTCAAGGACCAGCACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGG < 1:726277/150‑1 TTTCTCCTACAGCGCCGGCAACTACGTGAAGCTCAAGGACCAGCACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGG < 1:141224/150‑1 TCTCCTACAGCGCCGGCAACTACGTTAAGCTCAAGGACCAGCACCTGGCCGAAGGCTACGATCAAACTGAAAGGCCGCATTCGCGGGCAGTCGCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGC < 1:901065/150‑1 CTACAGCGCCGGCAACTACGTGAAGCTCAAGGACCAGCACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGC < 2:1073902/150‑1 TACAGCGCCGGCAACTACGTGAAGCTCAAGGACCAGCACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATTACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCC > 1:2280669/1‑150 TACAGCGCCGGCAACTACGTGAAGCTCAAGGACCAGCACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCACCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCC > 1:1192296/1‑150 ACAGCGCCGGCAACTACGTGAAGCTCAAGGACCAGCACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCC > 2:1104465/1‑150 GCGCCGGCAACTACGTGAAGCTCAAGGACCAGCACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCG > 1:2075473/1‑150 GCGCCGGCAACTACGTGAAGCTCAAGGACCAGCACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCG > 1:120411/1‑150 GCCGGCAACTACGTGAAGCTCAAGGACCAGCACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAA < 2:266888/150‑1 GCTCAAGGACCAGCACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGG < 2:444752/120‑1 GCTCAAGGACCAGCACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGG > 1:444752/1‑120 CAGCACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGC < 2:257522/120‑1 CAGCACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGC > 1:257522/1‑120 CACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGG < 2:1239655/107‑1 CACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGG > 1:1239655/1‑107 TGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGG > 1:1578084/1‑77 TGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGG < 1:1399590/77‑1 TGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGG < 2:1578084/77‑1 TGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGG > 2:1399590/1‑77 CCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAA > 2:668393/1‑150 CCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGG < 2:28178/111‑1 CCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGG > 1:28178/1‑111 CCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTC > 2:643821/1‑120 CCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTC < 1:643821/120‑1 TGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTT > 1:2216702/1‑150 GAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTG < 2:2216702/150‑1 ACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACC < 1:668393/150‑1 CGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCAT < 2:2087222/150‑1 GGGAATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAAGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAACTGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATG < 2:725584/150‑1 GCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCA > 2:137735/1‑146 GCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCA < 1:137735/146‑1 CATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTAC < 1:2378718/150‑1 CATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTAC > 2:2378718/1‑150 CATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTAC < 1:448977/150‑1 ATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGA > 2:1441999/1‑60 ATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGA < 1:1441999/60‑1 TGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAG < 1:2258085/150‑1 CCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGTA > 1:1154669/1‑150 CCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGTA > 2:467078/1‑150 AATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGTAGCCAC < 1:1568042/150‑1 ATTTTTCTCCTACAGCGCCGGCAACTACGTGAAGCTCAAGGACCAGCACCTGGCCGAAGGCTACGATCAACCTGAATGACCGCATTCGCGGGCATGCCCGCCCCCGCAGGTTGAGTGGCCCCTTCAAGGCCTGCGCTTTACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/100608‑100443‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgggcatgcccgcgaaTGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGCGCTGTAGGAGAAAAATGCGCGCTCCTTGTCGTTCAGCAGCCGGGCCTGTTTCACCGGACTGCCCATGTACAGGTAGCCAC > NC_002947/100525‑100672 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |