| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 205046 = | NA (NA) | 18 (0.210) | 9/238 | NT | 16.7% | coding (10552/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
| ? | NC_002947 | 213074 = | 93 (1.050) | coding (18580/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein | |||||
TTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTTGCAGTGCCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTgtgg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/205192‑205046‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGGCACTGCCACCGTCACTGCCCCGGACAATGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGAAGGCGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTGACCGAC > NC_002947/213074‑213226 TTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTTGCAGTGCCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGCCGGGTGTGCCGTCGCTTAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTG > 2:394975/1‑150TTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTTGCAGTGCCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTG > 2:709940/1‑150TTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTTGCAGTGCCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTG > 1:779025/1‑150TTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTTGCAGTGCCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTG < 1:1534374/150‑1TTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTTGCAGTGCCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACGGTGAGGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTG < 1:1066815/150‑1TTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTTGCAGTGCCCACGGTGCCGTCGGACGCAAACCTGATGACGGTTTTGCCTTTGCTCAGCGTGAACGTCAAT‑GCACTGTG < 2:1836533/150‑1TTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGAAGTTCCGCCCAGTCACGGTTGCAGTGCCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTG > 2:2133901/1‑150 TCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTTGCAGTGCCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGG > 1:232899/1‑150 ACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTTGCAGTGCCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTG > 1:1079544/1‑125 ACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTTGCAGTGCCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTG < 2:1079544/125‑1 CAGTACCCACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGGGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGGGTACTGCCACTGTCACTGCCCCGGATAACGTCTACGTCGGCAGCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCtac > 2:351585/1‑147 CCACGGTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGA > 2:1688395/1‑150 CACGGTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGGGCACTGCCACCGTCACTGCCCCGGACAATGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGAA > 2:577741/1‑150 CACGGTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCACTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGGGCACTGCTACCGTCACTGTCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGga > 1:790062/1‑148 CACGGTGCCATTAGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGGGTACTGCCACTGTCACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAA > 1:630453/1‑150 ACGGTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTG < 2:481392/68‑1 ACGGTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTG > 1:481392/1‑68 GGTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGGGCACTGCCACCGTCACTGCCCCGGACAATGT < 1:2250939/98‑1 GGTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGGGCACTGCCACCGTCACTGCCCCGGACAATGT > 2:2250939/1‑98 GTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGGGCACTGCTACCGTCACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGgcggcg > 2:1778032/1‑144 GTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGGGCACTGCCACCGTCACTGCCCCGGACAATGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGAT > 1:1063915/1‑133 GTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGGGCACTGCCACCGTCACTGCCCCGGACAATGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGAT < 2:1063915/133‑1 TGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTG < 1:1829180/64‑1 TGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTG > 2:1829180/1‑64 GTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCACTCAGCGTGAAGGTCAATGGCACCGTGGGCACTGCTACCGTCACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGGAGGTGCGGA > 2:2389245/1‑150 GGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCTCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCTACCGTTGAAGGTGCGGACGTT < 1:1688395/150‑1 CCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGGGCACTGCTACCGTCACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGGCGGCGCGGATGTTGG < 1:1778032/150‑1 CGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCACTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGGGCACTGCTACCGTCACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGGAGGTGCGGACGTCGGt > 1:2336012/1‑149 TGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGG < 2:1220572/47‑1 TGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGG > 1:1220572/1‑47 GATGACGGTTTTGCCGTCACTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGGGCACTGCTACCGTCACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGGAGGTGCGGACGTCGGTAAGTTCGAG < 2:2336012/150‑1 ATGACGGTTTTGCCGTCACTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGGGCACTGCTACCGTCACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCAACGACCCTGTCGTGA < 2:1363056/105‑1 ATGACGGTTTTGCCGTCACTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTGTGGGCACTGCTACCGTCACTGCCCCGGACAACGTCTACGTCGGCACCAACGACCCTGTCGTGA > 1:1363056/1‑105 AAGGTCAAC‑GCACTGTGGGCACTGCCACCGTCACTGCCCCGGACAATGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGAAGGCGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCA < 1:577741/150‑1 GTGGGCACTGCCACCGTCACTGCCCCGGACAATGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGAAGGCGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTGACC < 2:2114219/150‑1 TGGGCACTGCCACCGTCACTGCCCCGGACAATGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGATGAAGGCGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTGACCG > 1:2242361/1‑150 GGCACTGCCACCGTCACTGCCCCGGACAATGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGAAGGCGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTGACCGAC < 2:1384873/150‑1 TTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTACCGACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTTGCAGTGCCCACGGTGCCGTTGGCCGGCACGGTGATGACGGTTTTGCCGTCGCTCAGCGTGAAGGTCAAT‑GCACTgtgg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/205192‑205046‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTGGGCACTGCCACCGTCACTGCCCCGGACAATGTCTACGTCGGTACCAACGACCCTGTCGTGATGTCGATCGCAACCGTTGAAGGCGCGGACGTTGGCAAGTTCGAGCAACTGACGCTGGACAAGACGCCGGTCAGCACGTCGGTGACCGAC > NC_002947/213074‑213226 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |