New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1126618 | 65 (0.730) | 18 (0.250) | 12/204 | NT | 25.0% | intergenic (‑67/+83) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 1126634 | 54 (0.740) | intergenic (‑83/+67) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
AGCCCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1126451‑1126618 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgggtttacccgcgaatgcgATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCACACGGTCG < NC_002947/1126634‑1126488 AGCCCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCG < 1:1969689/150‑1 tcgctgCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTTAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGG < 2:2308303/144‑1 GCCCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGG < 1:516115/150‑1 GCCCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGG < 1:2251822/150‑1 GCCCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGG < 2:1725400/150‑1 CCCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGG < 1:1394409/150‑1 CCCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGG < 2:1725491/150‑1 CCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC > 2:2070661/1‑146 CCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGC < 1:2070661/146‑1 CTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTT > 2:975610/1‑150 TTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCG > 1:956199/1‑145 TTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCG < 2:956199/145‑1 GGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACC > 1:946935/1‑150 ccgatgCGCGCCGCTGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCC > 1:2217906/7‑150 GCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCC > 1:877398/1‑150 CAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCG > 1:37679/1‑150 AACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGGTTACCCGCG > 1:732526/1‑150 ACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTAAACCCGCGc < 1:49427/150‑2 CCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACAGTGTGGGAGGTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAA < 2:572563/150‑1 GCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGCTTACCCCCGAATG > 2:1051384/1‑150 GCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTGTATCCGCGGATGCG > 2:2375187/1‑150 CGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCA > 2:1175844/1‑147 CGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCA < 1:1175844/147‑1 TGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGG‑C‑GGGCTCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 2:232671/150‑1 caGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:115859/137‑1 caGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG > 2:115859/3‑139 GGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGC < 2:1087908/150‑1 AACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGC > 1:220595/1‑86 AACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGC < 2:220595/86‑1 TCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 2:132076/104‑1 TCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG > 1:132076/1‑104 TGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTC < 1:1826366/96‑1 TGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTC > 2:1826366/1‑96 ACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATT > 1:1180433/1‑93 ACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATT < 2:1180433/93‑1 TGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:960819/84‑1 TGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:961167/84‑1 TGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG > 2:960819/1‑84 TGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG > 2:961167/1‑84 CCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCC < 2:29363/46‑1 CCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCC < 2:27906/46‑1 CCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCC > 1:27906/1‑46 CCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCC > 1:29363/1‑46 ACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAAC > 2:674304/1‑72 ACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGGTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAAC < 1:674304/72‑1 GGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTC < 1:803512/99‑1 GGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTC > 2:803512/1‑99 GGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCA < 1:1744989/150‑1 GTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAG > 2:2147800/1‑150 GTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAG > 1:1154237/1‑150 GTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTACAG > 2:1337997/1‑150 ACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCC < 1:2147800/150‑1 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCA > 2:37679/1‑150 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCA > 2:721551/1‑150 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCA > 2:1272819/1‑150 CCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCA > 1:1340409/1‑150 CGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCAC > 2:877398/1‑150 CGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAACCCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCACAC < 1:205168/150‑1 GCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCACACGGTCG < 2:1104500/150‑1 GATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCACAC > 1:20534/1‑143 GATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCACAC < 2:20534/143‑1 AGCCCTTCGGCAAACCGCGCAGCGGCGCGCATCGGGCCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1126451‑1126618 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgggtttacccgcgaatgcgATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACAGGGCTCAATGTCCACCCAACAACCTGGCAGGAGGTCCACATGTCACTGAGCGTCTTCGACCTGTTCAAGATCGGCATCGGCCCCTCCAGCTCCCACACGGTCG < NC_002947/1126634‑1126488 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |