New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 156028 = | 108 (1.220) | 8 (0.090) | 6/238 | NT | 7.5% | coding (348/798 nt) | ygdQ | transport protein |
? | NC_002947 | 156056 = | 93 (1.090) | coding (320/798 nt) | ygdQ | transport protein |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CCGGTACGTGGGAAACCATGCCCACAGCGGTGATCACCGAGTCCAGCGAGAACACGATGTCGATGATGGCGATCTGGATGATGGTGTAGAAGA‑ACTTGCCACCTGCGCCTTTGGGCTCCTCTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAGGTAATCGACAGCAGCAGCAT > NC_002947/155880‑156171 | ccGGTACGTGGGAAACCATGCCCACAGCGGTGATCACCGAGTCCAGCGAGAACACGATGTCGATGATGGCGATCTGGATGATGGTGTAGAAGA‑ACTTGCCACCTGCGCCTTTGGGCTCCTCTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGt < 2:1902172/150‑1 (MQ=255) tcggcctggccctggccatggtcacccgtatcatgctgctgctgtcgattacctgggtcatgcgcctcaccgccgacctgttcgtggtctttggccaaggcatctccgggcgtgacctgatcctgttcttcggtggcctgttcctgctgt > 1:2078480‑M1/149‑150 (MQ=255) tcggcctggccctggccatggtcacccgtatcatgctgctgctgtcgattacctgggtcatgcgcctcaccgccgacctgttcgtggtctttggccaaggcacctccgggcgtgccctgatcctgttcttcggtggcctgtccctgctgt > 1:1919756‑M1/149‑150 (MQ=255) 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gAAACCATGCCCACAGCGGTGATCACCGAGTCCAGCGAGAACACGATGTCGATGATGGCGATCTGGATGATGGTGTAGAAGA‑ACTTGCCACCTGCGCCTTTGGGCTCCTCTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATctct < 2:1369530/150‑1 (MQ=255) gAAACCATGCCCACAGCGGTGATCACCGAGTCCAGCGAGAACACGATGTCGATGATGGCGATCTGGATGATGGTGTAGAAGA‑ACTCGCCACCTGCGCCTTTGGGCTCCTCTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGAt > 1:348409/1‑146 (MQ=255) cccATGCCCACAGCGGTGATCACCGAGTCCAGCGAGAACACGATGTCGATGATGGCGATCTGGATGATGGTGTAGAAGA‑ACTTGCCACCTGCGCCTTTGGGCTCCTCTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGCCCGTGGTAGATCTCTTGc < 2:1549228/149‑1 (MQ=255) aTGCCCACAGCGGTGATCACCGAGTCCAGCGAGAACACGATGTCGATGATGGCGATCTGGATGATGGTGTAGAAGA‑ACTTGCCACCTGCGCCTTTGGGCTCCTCTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAg < 2:1427831/150‑1 (MQ=255) tGCCCACAGCGGTGATCACCGAGTCCAGCGGGAACACGATGTCGATGATGGCGATCTGGATGATGGTGTAGAAGA‑ACTTGCCACCTGCGCCTTTGGGCTCCTCTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTgg > 1:1435854/1‑134 (MQ=255) 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aCGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAg < 1:554954/150‑1 (MQ=255) cGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTc < 2:117785/50‑1 (MQ=255) cGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTc > 1:117785/1‑50 (MQ=255) cGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGTTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAgg < 2:224666/150‑1 (MQ=255) gttcttcggtggcctgttcctgctGTGGAAGAGCTCGCAAGAGATCTACCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCt < 1:2318102‑M1/79‑1 (MQ=255) ctcGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAGGTAAt < 2:102595/150‑1 (MQ=255) gTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAGGTAATc < 1:2157482/148‑1 (MQ=255) tCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGACCAGGTCGGCGGTGCGGCGCATGACCCAGGTCATCGAc > 2:9310/1‑150 (MQ=255) tCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCACTTCCGAGCTCTTCCACAGCAAGAGCAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAGGTAATCGAc > 1:910145/1‑150 (MQ=255) cTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAGGTAATCGAcag > 1:187934/1‑150 (MQ=255) cTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAGGTAATCGAcag > 1:1313696/1‑150 (MQ=255) tCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGaa > 1:2333187/1‑110 (MQ=255) tCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGaa < 2:2333187/110‑1 (MQ=255) tCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAGGTAATCGAcagc > 1:1837490/1‑150 (MQ=255) tCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAg < 1:383212/132‑1 (MQ=255) cAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAGGTAATCGACAGCAGCAGCAt < 1:463647/150‑1 (MQ=255) cAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAGGTAATCGACAGCAGCAGCAt < 1:1928520/150‑1 (MQ=255) aGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGAt < 2:1561269/80‑1 (MQ=255) aGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGAt > 1:1561269/1‑80 (MQ=255) ccGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACa > 2:1844106/1‑55 (MQ=255) ccGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACa < 1:1844106/55‑1 (MQ=255) | CCGGTACGTGGGAAACCATGCCCACAGCGGTGATCACCGAGTCCAGCGAGAACACGATGTCGATGATGGCGATCTGGATGATGGTGTAGAAGA‑ACTTGCCACCTGCGCCTTTGGGCTCCTCTACGTTCTCGTCCTCGCCTTCCAGACCGTGGTAGATCTCTTGCGAGCTCTTCCACAGCAGGAACAGGCCACCGAAGAACAGGATCAGGTCACGCCCGGAGATGCCTTGGCCAAAGACCACGAACAGGTCGGCGGTGAGGCGCATGACCCAGGTAATCGACAGCAGCAGCAT > NC_002947/155880‑156171 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |