| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GAAGTGCTGGGCCTGGCTGTGGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTTGCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATCGCCGCCCAGGCCGTTACCCAGGTTGGCTTC > NC_002947/912922‑913218 | gAAGTGCTGGGCCTGGCTGTGGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGccca > 2:779166/1‑150 (MQ=255) aaGTGCTGGGCCTGGCTGTGGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGcccac < 1:1475453/150‑1 (MQ=255) cTGGGCCTGGCTGTGGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAg < 2:984655/150‑1 (MQ=255) tGGGCCTGGCTGTGGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAgg < 1:1538428/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCTGTGGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTTGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGc < 1:1044794/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCTGTGGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGc > 1:411134/1‑150 (MQ=255) ccTGGCTGTGGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCg < 2:399294/150‑1 (MQ=255) cTGGCTGTGGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCgg < 1:1654163/150‑1 (MQ=255) cTGGCTGTGGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCgg < 2:1629738/150‑1 (MQ=255) gCTGTGGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGtt < 2:1819896/150‑1 (MQ=255) tgtgGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGCCAGTGGCATTGAACACGTGGTGGAGCATGCCGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTCACGGCCCGCGCACACACGGAGCGGCTTGc > 2:695089/1‑150 (MQ=255) tgtgGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTTGc < 2:1349820/150‑1 (MQ=255) tgGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTTGCCa < 2:1362773/150‑1 (MQ=255) ccTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTTGCCAGCACGGt > 1:2122392/1‑150 (MQ=255) ccTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGACTAGATGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTTGCCAGCACGGt > 1:2372505/1‑150 (MQ=255) cTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTTGCCAGCACGGTg > 1:2032910/1‑150 (MQ=255) cTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTTGCCAGCACGGTg > 1:2208108/1‑150 (MQ=255) cGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTTGCCa > 2:1375549/1‑138 (MQ=255) 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cccgcccACCCAAGGTGCGGGGTGCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATCGCCGCCCAGGCCATTACCCAGGTTg < 2:411134/150‑1 (MQ=255) ccgcgcccaccttgctggcaacccgcaccttgtgtgggcgggcctgcagggccagatcgcgactgaaccaactgacgccctgctcgcccgcagacaccaccacgtgttcaacgccactgtccagcaggcgcttggcggcagcgcgctgtt > 2:1206950‑M1/1‑6 (MQ=255) ccgcccACCCAAGGTGCGGGTTGCCAGCACGGTGGgggcgggcctgcagggccagatcgcgactgaaccaactgacgccctgctcgcccgcagacaccaccacgtgttcaacgccactgtccagcaggcgc > 2:1585128‑M2/1‑35 (MQ=255) ccgcccACCCAAGGTGCGGGTTGCCAGCACGGTGGgggcgggcctgcagggccagatcgcgactgaaccaactgacgccctgctcgcccgcagacaccaccacgtgttcaacgccactgtccagcaggcgc < 1:1585128‑M2/131‑97 (MQ=255) ccgcccACCCAAGGTGCGGGTTGCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCtg < 1:891674/52‑1 (MQ=255) ccgcccACCCAAGGTGCGGGTTGCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCtg > 2:891674/1‑52 (MQ=255) gcccccaccgtgctggcaacccgcaccttgggtgggcgggcctgcagggccagatcgcgactgaaccaactgacgccctgctcgcccgcagacaccaccacgtgttcaacgccactgtccggcaggcgcttggcggcagcgcgctgttgc < 2:1916612‑M1/150‑147 (MQ=255) gcccccaccgtgctggcaacccgcaccttgggtgggcgggcctgcagggccagatcgcgactgaaccaactgacgccctgctcgcccgcagacaccaccacgtgttcaacgccactgtccagcaggcgcttggcggcagcgcgctgttgc < 2:639207‑M1/150‑147 (MQ=255) gcccccaccgtgctggcaacccgcaccttgggtgggcgggcctgcagggccagatcgcgactgaaccaactgacgccctgctcgcccgcagacaccaccacgtgttcaacgccactgtccagcaggcgcttggcggcagcgcgctgttgc < 2:858634‑M1/150‑147 (MQ=255) cccacccaAGGTGCGGGTTGCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATCGCCGCCCAGGc > 2:574761/1‑132 (MQ=255) cccacccaAGGTGCGGGTTGCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATCGCCGCCCAGGc < 1:574761/132‑1 (MQ=255) ccacccaAGGTGCGGGTTGCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATCGCCGCCCAGGCCGTTACCCAGGTTGGCTTc < 1:1193731/150‑1 (MQ=255) | GAAGTGCTGGGCCTGGCTGTGGATAACCTGACGCAACAGCGCGCTGCCGCCAAGCGCCTGCTGGACAGTGGCGTTGAACACGTGGTGGTGTCTGCGGGCGAGCAGGGCGTCAGTTGGTTCAGTCGCGATCTGGCCCTGCAGGCCCGCCCACCCAAGGTGCGGGTTGCCAGCACGGTGGGGGCGGGGGATTCGCTGGTGGCCGGCATGGTCCACGGCCTGCTGCTGGCCGAGGCGCCTGCGCAGACGTTGACCCGGGCCACTGCCATCGCCGCCCAGGCCGTTACCCAGGTTGGCTTC > NC_002947/912922‑913218 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |