| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 1050145 = | 106 (1.200) | 6 (0.070) | 5/232 | NT | 5.8% | coding (711/1098 nt) | PP_0908 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 1050184 = | 94 (1.130) | coding (672/1098 nt) | PP_0908 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAGGTTCATCTCGACA > NC_002947/1050000‑1050292 | gtaGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCGCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCGCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGc < 2:290887/148‑1 (MQ=255) caacggcggtatccgtaccgaggccgaaagccgtgtcgagatgaacctcgacgccatgcaaccgagcctggtgctgatgcagcgcgacggcaccctgctgagcaaggaaaccctggcccagcagctgaacagcgtgcgacacCTGGCAgg < 2:733300‑M1/8‑1 (MQ=255) cGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAggcgg < 1:1462048/150‑1 (MQ=255) tgGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATg > 1:1765672/1‑150 (MQ=255) gATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGt > 1:42084/1‑150 (MQ=255) gCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATAGTGcaa > 2:1941495/1‑148 (MQ=255) aCGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGGGTGATCGCCAGCAGCTCGGCCGTTTCCTCGGCCCCGCGCATTGACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCg > 1:2339933/1‑150 (MQ=255) cTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTg < 2:42084/150‑1 (MQ=255) ttGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTgg > 2:1754863/1‑150 (MQ=255) tGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGc < 2:1445193/150‑1 (MQ=255) tGCGGGGTATTGGGCGCTGGCTTGCAGTTGGCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTGGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGATCTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCGATCGCTGGc < 2:27967/150‑1 (MQ=255) tATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGt < 2:677007/131‑1 (MQ=255) tATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGt > 1:677007/1‑131 (MQ=255) aTTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCa > 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ttGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCAt > 2:169598/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCAt < 1:1472663/150‑1 (MQ=255) ttGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCAt > 1:2210843/1‑150 (MQ=255) cGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGa > 2:2014541/1‑103 (MQ=255) cGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATctgc < 2:905359/150‑1 (MQ=255) gCTCCGTTACTGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGGTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTTCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATctgct > 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aGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAg > 1:2106830/1‑96 (MQ=255) aGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAg < 2:2106830/96‑1 (MQ=255) aGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTg < 2:2339933/150‑1 (MQ=255) tttCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAgg > 2:1098136/1‑95 (MQ=255) tttCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAgg < 1:1098136/95‑1 (MQ=255) tttCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCa < 2:479177/150‑1 (MQ=255) cATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATctgctgag < 2:1935293/87‑3 (MQ=255) cATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATctgctgag > 1:1935293/1‑85 (MQ=255) aTCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCgg > 1:1085135/1‑141 (MQ=255) aTCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCgg < 2:1085135/141‑1 (MQ=255) tCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCg < 2:1765672/150‑1 (MQ=255) cGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGt < 1:364430/37‑1 (MQ=255) cGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGt > 2:364430/1‑37 (MQ=255) ggCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTc < 1:1993814/150‑1 (MQ=255) aTCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTTCTTg < 1:362298/94‑1 (MQ=255) aTCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAg > 1:580866/1‑150 (MQ=255) tCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAgg < 2:2001708/150‑1 (MQ=255) gCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAGGtt > 2:1558138/1‑150 (MQ=255) gCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGAGTCGAGGtt < 2:1011598/150‑1 (MQ=255) cccATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAGGTTc < 2:1178394/150‑1 (MQ=255) cATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAGGTTCAt > 2:2024112/1‑150 (MQ=255) gAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCACCGGTTCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAGGTTCAtctc < 1:1044357/150‑1 (MQ=255) tgctgGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAGGTTCATCTCGaca > 1:2068796/1‑150 (MQ=255) | GCAGCTCGCTGTGGATGGCAACGCTTGCGGTGTATTGGGCCATGGCTTGCAGTTGCCGCTCCGGTACCGGGAAGGCCTTGAATGGCTCGCCCGGGCGCTTGATCGCCAGCAGCTCGGCAGTTTCATCGGCATCGCCCATGAACTGCTGGCAGGCGGCGATGGTGCCATCGCTGGCCACTGCCAGGTGTCGCACGCTGTTCATCTGCTGGGCCAGGGTTTCCTTGCTCAGCAGGGTGCCGTCGCGCTGCATCAGCACCAGGCTCGGTTGCATGGCGTCGAGGTTCATCTCGACA > NC_002947/1050000‑1050292 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |