| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1114899 | 82 (0.930) | 20 (0.280) | 16/196 | NT | 21.1% | intergenic (‑88/+91) | rlmF/valS | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F/valine‑‑tRNA ligase |
| ? | NC_002947 | = 1114925 | 84 (1.190) | intergenic (‑114/+65) | rlmF/valS | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F/valine‑‑tRNA ligase | |||||
Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
GGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGAC > NC_002947/1114750‑1115047 | gggAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGA < 2:1555719‑M1/150‑1 (MQ=255) gAAGTCGTAGAGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGGGGGTTTGGTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACaggagg > 2:759613/1‑150 (MQ=255) aaGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAggg < 2:899963/150‑1 (MQ=255) aaGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAggg > 2:1249454/1‑150 (MQ=255) cGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGgc < 2:702200/150‑1 (MQ=255) gcccTGGGGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCTCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGa < 2:1034654/149‑1 (MQ=255) cccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGaa > 1:1815599/1‑150 (MQ=255) ccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaa > 2:735571‑M1/1‑134 (MQ=255) ccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAg < 2:2292563/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAgg > 2:1436920/1‑150 (MQ=255) gtggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaag > 2:140865‑M1/1‑130 (MQ=255) gtggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaag < 1:140865‑M1/147‑18 (MQ=255) ggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGgc < 1:2210257/150‑1 (MQ=255) cGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCCGCTGTACGGCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccac < 1:662781‑M1/150‑25 (MQ=255) ggTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGcc > 1:835040/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGGCACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcc < 2:2182980‑M1/150‑30 (MQ=255) gcgGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGACTTGTGCGCAGCCCTTTTGCGACAAAAAGACGCTAAGAGAAGAGGTTTGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctg < 1:539997‑M2/150‑6 (MQ=255) gcgGGTGCAGGGTGGGTTCGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGAGGGGCCGTGAAGGTTGGCGCCGtcctg < 2:1794214‑M2/150‑6 (MQ=255) cgGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGTACGCCCCTTTCGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgt < 2:1902766‑M1/150‑33 (MQ=255) gggTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtg > 2:835040‑M2/1‑143 (MQ=255) aGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcg > 1:1434847‑M2/1‑137 (MQ=255) gtTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgt < 1:735571‑M1/150‑47 (MQ=255) ttCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgc < 1:1940713‑M2/150‑26 (MQ=255) ttCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgc < 1:545237‑M2/150‑26 (MQ=255) ttCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGAGCAGCCGTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGCGGGTCGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgggggagcggccttgtgttgc < 1:2178847‑M2/150‑26 (MQ=255) gggTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGaaa > 1:86188/1‑150 (MQ=255) tCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGgcgc < 1:1249161/116‑1 (MQ=255) tCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAggg > 1:709995/1‑150 (MQ=255) aTGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAcggcgccaaccttcaaggcgccac < 1:1106169‑M1/114‑25 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cacaGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagcca > 1:777164‑M1/1‑7 (MQ=255) cacaGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcgaaagggctgcgcagcagcccca < 1:1559077‑M2/81‑49 (MQ=255) cacaGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCACGCCGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGtt < 1:66491/150‑1 (MQ=255) gcgcgacggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtataaggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcacccg > 1:695654‑M1/5‑6 (MQ=255) acaGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggcctt > 2:1297788‑M1/1‑6 (MQ=255) acaGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcgaaaggggcgtacagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcacccg < 2:1902766‑M2/150‑119 (MQ=255) acaGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcacccg < 1:855628‑M2/150‑119 (MQ=255) acaGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggct < 1:2171619‑M2/66‑35 (MQ=255) acaGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTg > 2:578917/1‑147 (MQ=255) caGGAcggcgccaaccttcacggcccctccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacgaacccaccctgcacccgc < 2:1794214‑M1/150‑146 (MQ=255) caGGAcggcgccaaccttcaaggcgccaccctcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcacccgc < 2:406554‑M1/150‑146 (MQ=255) caGGAcggcgccaaccttcaaggcgcaaacctcttctcttagcgtctttttgtcgcaaaagggctgcgcacaagtcccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcacccgc < 1:539997‑M1/150‑146 (MQ=255) caGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggc < 1:830586‑M2/108‑78 (MQ=255) caGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCg < 1:745847/150‑1 (MQ=255) ggaggGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgccgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctggacactgccatgaccccgaacaaacccaccctgcaccagcgc < 2:2182980‑M2/150‑122 (MQ=255) gaggGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctgga > 1:840538‑M2/1‑28 (MQ=255) gaggGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgtgtcgcaaaagggctgcgcagcagccccagggtcttcaagccaccgctcgtatagggctgga < 2:840538‑M2/109‑82 (MQ=255) gaggGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGtcctgtgggagcggccttgt < 2:1403955‑M2/48‑21 (MQ=255) gaggGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGAc > 1:434500/1‑150 (MQ=255) | GGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGCGCCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGAAGTTGGCCAGGGCCTGTTCGGAC > NC_002947/1114750‑1115047 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |