New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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ACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTGG > NC_002947/1129241‑1129534 | aCCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCcgtcgt > 1:698815/1‑150 (MQ=255) aCCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGGGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCCTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCcgtcgt > 2:1414704/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTg > 2:1367402/1‑150 (MQ=255) 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ctctGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTggccagagcgaggccgacgcgctcgctgcgctcaaggccatcgctggcaaga > 1:2362915‑M2/1‑29 (MQ=255) ctctGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGTCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGCCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAAt < 2:753717/150‑1 (MQ=255) tctGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTggccagagcgaggccgacgcgctcgctgcgctcaaggccatcgctggcaagaaccagctgttcaaaagctacatcggccagggctactacaacacc > 1:522706‑M2/1‑28 (MQ=255) tctGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTggccagagcgaggccgacgcgctcgctgcgctcaaggccatcgctggcaagaaccagctgttcaaaagctacatcggccagggctactacaacacc < 2:522706‑M2/124‑97 (MQ=255) tGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGATTCGAAGCCCAGTGAAGCGCGGCTGAGCGGTACGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCg > 1:1143193/1‑150 (MQ=255) tGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGc < 1:1379487/140‑1 (MQ=255) tGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGc > 2:1379487/1‑140 (MQ=255) tGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCg < 2:1035748/150‑1 (MQ=255) gCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGtt < 2:601439/150‑1 (MQ=255) gCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCGGTGGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGtt < 2:1189607/150‑1 (MQ=255) ccGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTg < 1:2009831/150‑1 (MQ=255) cgtcgtGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTgg > 2:1592290/1‑150 (MQ=255) cgtcgtGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGCCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTgg > 2:1023468/1‑150 (MQ=255) | ACCAGGCCGGGTTTTCCAGCAGGTTGCGCAGGATCGGTGCCGGAGTGTGGGTGTTGTAGTAGCCCTGGCCGATGTAGCTTTTGAACAGCTGGTTCTTGCCAGCGATGGCCTTGAGCGCAGCGAGCGCGTCGGCCTCGCTCTGGCCGTCGTGCGAGCCAAGCACGCTGGTACCTTTGATGCTGTCGGGGATGACCGCAGCGGTCATGGCGTCCAGCGAGTCGAAGCCCAGTGCAGTGAGCATGGCCTGTTCGTCAGCGGCGCGCGGGCCTATGTGACGGGCGATGAATTCGTTGG > NC_002947/1129241‑1129534 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |