New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1351554 = | 81 (0.910) | 8 (0.100) | 6/232 | NT | 9.8% | coding (237/1251 nt) | nrdB | ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit beta |
? | NC_002947 | 1351579 = | 71 (0.850) | coding (212/1251 nt) | nrdB | ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit beta |
TGTCGGCGGTCATGTTGACCTCTTGCGGCATCCAGTGGTTGGCGCAGCCGTCCAGGTACTTCTGCCAGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGAGTCAGAAGCGGTGGCCGCACGGGCCTCCAGGGCGGCGGCACCACCGGCGCTGTCGAGCTTGTCGAG > NC_002947/1351406‑1351703 | tGTCGGCGGTCATGTTGACCTCTTGCGGCATCCAGTGGTTGGCGCAGCCGTCCAGGTACTTCTGCCAGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCggg < 2:2121432/150‑1 (MQ=255) cgcaggccgctgccgccgccaccctcgacaagctcgacagcgccggtggtgccgccgccctggaggcccgtgcggccaccgcttctgactccgaagccgtcaaacgtgccaaggctgccctcgacgccctcgacgttgccgaaggcctgg > 1:2136964‑M1/149‑150 (MQ=255) cgcaggccgctgccgccgccaccctcgacaagctcgacagcgccggtggtgccgccgccctggaggcccgtgcggccaccgcttctgactccgaagccgtcaaacgtgccaaggctgccctcgacgccctcgacgttgccgaaggcctgg > 2:956104‑M1/149‑150 (MQ=255) cgcaggccgctgccgccgccaccctcgacaagctcgacagcgccggtggtgccgccgccctggaggcccgtgcggccaccgcttctgactccgaagccgtcaaacgtgccaaggctgccctcgacgccctcgacgttgccgaaggcctgg > 1:1637392‑M1/149‑150 (MQ=255) aggccgctgccgccgccaccctcgacaagctcgacagcgccggtggtgccgccgccctggaggcccgtgcggccaccgcttctgactccgaagccgtcaaacgtgccaaggctgccctcgacgccctcgacgttgccgaaggcctGGCCg < 1:448313‑M1/5‑1 (MQ=255) ggccgctgccgccgccaccctcgacaagctcgacagcgccggtggtgccgccgccctggaggcccgtgcggccaccgcttctgactccgaagccgtcaaacgtgccaaggctgccctcgacgccctcgacgttgccgaaggcctGGCCga > 1:1019897‑M1/145‑150 (MQ=255) gccgctgccgccgccaccctcgacaagctcgacagcgccggtggtgccgccgccctggaggcccgtgcggccaccgcttctgactccgaagccgtcaaacgtgccaaggctgccctcgacgccctcgacgttgccgaaggcctGGCCgag < 1:99473‑M1/7‑1 (MQ=255) gatcctcttGCCCTCTTTCTGCATCCAGTGGTTGGCGCAGCCGTCCAGGTACTTCTGCCAGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCgagga < 2:517469/143‑1 (MQ=255) tCATGTTGACCTCTTGCGGCATCCAGTGGTTGGCGCAGCCGTCCAGGTACTTCTGCCAGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGc < 2:422988/150‑1 (MQ=255) tCATGTTGACCTCTTGCGGCATCCAGTGGTTGGCGCAGCCGTCCAGGTACTTCTGCCAGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGc > 2:1125432/1‑150 (MQ=255) gTTGACCTCTTGCGGCATCCAGTGGTTGGCGCAGCCGTCCAGGTACTTCTGCCAGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCgaggagagatc > 1:517469/1‑145 (MQ=255) gTTGACCTCTTGCGGCATCCAGTGGTTGGCGCAGCCGTCCAGGTACTTCTGCCAGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTc < 1:1913648/150‑1 (MQ=255) ccTCTTGCGGCATCCAGTGGTTGGCGCAGCCGTCCAGGTACTTCTGCCAGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCt < 2:1239905/150‑1 (MQ=255) ctctTGCGGCATCCAGTGGTTGGCGCAGCCGTCCAGGTACTTCTGCCAGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGATCTTCATGGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTc > 2:1398681/1‑150 (MQ=255) tctTGCGGCATCCAGTGGTTGGCGCAGCCGTCCAGGTACTTCTGCCTAGTAGAGGCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCg < 1:149343/150‑1 (MQ=255) ttGCGGCATCCAGTGGTTGGCGCAGCCGTCCAGGTACTTCTGCCAGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGc > 1:1962537/1‑150 (MQ=255) cctcgacaagctcgacagcgccggtggtgccgccgccctggaggcccgtgcggccaccgcttctgactccgaagccgtcaaacgtgccaaggctgccctcgacgccctcgacgttgccgaaggcctg < 2:1502274‑M1/1‑1 (MQ=255) cctcgacaagctcgacagcgccggtggtgccgccgccctggaggcccgtgcggccaccgcttctgactccgaagccgtcaaacgtgccaaggctgccctcgacgccctcgacgttgccgaaggcctg > 1:1502274‑M1/127‑127 (MQ=255) cctcgacaagctcgacagcgccggtggtgccgccgccctggaggcccgtgcggccaccgcttctgactccgaagccgtcaaacgtgccaaggctgccctcgacgccctcgacgttgccgaaggcctGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGc < 2:801469‑M1/24‑1 (MQ=255) cctcgacaagctcgacagcgccggtggtgccgccgccctggaggcccgtgcggccaccgcttctgactccgaagccgtcaaacgtgccaaggctgccctcgacgccctcgacgttgccgaaggcctGGCCGAG‑‑‑CCTTCCAGCTCGGCCAg > 1:1524868‑M1/127‑150 (MQ=255) cgacaagctcgacagcgccggtggtgccgccgccctggcggcccgtgcggccaccgcttctgactccgaagccgtcaaacgtgccaaggctgccctcgacgccctcgacgttgccgaaggccgGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAg > 2:2043136‑M1/124‑150 (MQ=255) cgacaagctcgacagcgccggtggtgccgccgccctggaggcccgtgcggccaccgcttctgactccgaagccgtcaaacgtgccaaggctgccctcgacgccctcgacgttgccgaaggcctGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAg > 1:801469‑M1/124‑150 (MQ=255) cGGCATCCAGTGGTTGGCGCAGCCGTCCAGGTACTTCTGCCAGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAg < 1:80162/150‑1 (MQ=255) cAGTGGTTGGCGCAGCCGTCCAGGTACTTCTGCCAGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCg < 2:1895770/150‑1 (MQ=255) 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cTGCCAGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAAcgtcgagg > 2:2036801/1‑133 (MQ=255) cTGCCAGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAAcgtcgagg < 1:2036801/133‑1 (MQ=255) tGCCAGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTg < 1:1890321/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGc > 2:1189901/1‑150 (MQ=255) aGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAg < 2:2277168/100‑1 (MQ=255) aGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAg > 1:2277168/1‑100 (MQ=255) 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ccaaggctgccctcgacgccctcgacgttgccgaaggcctGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCgg > 2:1773326‑M1/41‑63 (MQ=255) ccaaggctgccctcgacgccctcgacgttgccgaaggcctGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCgg < 1:1773326‑M1/23‑1 (MQ=255) gcgGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGa < 1:488334/123‑1 (MQ=255) gcgGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGa > 2:488334/1‑123 (MQ=255) cgGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGTCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGAGTCAGAAGCGGTGGCCGCACGGGCCTcc < 2:329848/150‑1 (MQ=255) aTGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGTAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGAGt < 1:1852776/112‑1 (MQ=255) aTGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGAGt > 2:1852776/1‑112 (MQ=255) tGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTc < 2:222278/58‑1 (MQ=255) tGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTc > 1:222278/1‑58 (MQ=255) tGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGAGTCAGAAGCGGTGGCCGCACGGGCCTCCAGGGCGGCGGcac > 2:99473/1‑150 (MQ=255) gcTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGAGTCAGAAGCGGTGGCCGCACGGGCCTCCAGGGCGGCGGcaccac > 2:1582865/1‑150 (MQ=255) aTCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGCCGGCTTAGGAGGCATAAGCGGTGGCCGCACGGGCCTCCAGGGCGGCGGCACCACCGGCGCt > 1:285952/1‑150 (MQ=255) aTCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGAGTCAGAAGCGGTgg > 1:1649825/1‑113 (MQ=255) aTCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGAGTCAGAAGCGGTgc < 2:1649825/113‑2 (MQ=255) aTCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGAGTCAGAAGCGGTGGCCGCACGGGCCTCCAGGGCGGCGGCACCACCGGCGCt < 2:1368759/150‑1 (MQ=255) aTCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGAGTCAGAAGCGGTGGCCGCACGGGCCTCCAGCGCGGCGGCACCACCGGCGCt < 1:1125432/150‑1 (MQ=255) tCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGAGTCAGAAGCGGTGGCCGCACGGGCCTCCAGGGCGGCGGcac > 2:354056/1‑139 (MQ=255) tCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGAGTCAGAAGCGGTGGCCGCACGGGCCTCCAGGGCGGCGGcac < 1:354056/139‑1 (MQ=255) gACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGAGTCAGAAGCGGTGGCCGCACGGGCCTCCAGGGCGGCGGCACCACCGGCGCTGTc > 2:639213/1‑150 (MQ=255) aCTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGAGTCAGAAGCGGTGGCCGCACGGGCCTCCAGGGCGGCGGCACCACCGGCGCTGTCg > 1:440565/1‑150 (MQ=255) tGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGAGTCAGAAGCGGTGGCCGGACGGGGCTCCAGGGCGGCGGCACCACCGGCGCTGTCGAg > 1:737329/1‑150 (MQ=255) cAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGAc < 2:307969/82‑1 (MQ=255) cAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGAc > 1:307969/1‑82 (MQ=255) cAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGAGTCAGAAGCGGTGGCCGCACGGGCCTCCAGGGCGGCGGCACCACCGGCGCTGTCGAGCt > 2:448313/1‑150 (MQ=255) aCGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGTCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAATGCAGCCTTGGTACGTTTGACGTCTTCGGAGGCAGAAGCGGTGGCCGCACGGGCCTCCAGGGCGGCGGCACCACCGGCGCTGTCGAGCTTg < 1:938516/150‑1 (MQ=255) GGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGAGTCAGAAGCGGTGGCCGCACGGGCCTCCAGGGCGGCGGCACCACCGGCGCTGTCGAGCTTGTCGAg > 1:639213‑M1/1‑150 (MQ=255) | TGTCGGCGGTCATGTTGACCTCTTGCGGCATCCAGTGGTTGGCGCAGCCGTCCAGGTACTTCTGCCAGGCCCAGTCGTACTTGAACGGTACCAGTTGGTTGAGGTCGGCGCGGCAGTTGATCATGCGCTTTTCATCGACTGCAACGCGGGCCGAGGAGCCTTCCAGCTCGGCCAGGCCTTCGGCAACGTCGAGGGCGTCGAGGGCAGCCTTGGCACGTTTGACGGCTTCGGAGTCAGAAGCGGTGGCCGCACGGGCCTCCAGGGCGGCGGCACCACCGGCGCTGTCGAGCTTGTCGAG > NC_002947/1351406‑1351703 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |