| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1544501 = | 79 (0.890) | 15 (0.220) | 19/186 | NT | 26.9% | intergenic (+18/+96) | mdfA/ampG | multidrug MFS transporter/muropeptide permease AmpG |
| ? | NC_002947 | 1544577 = | 22 (0.330) | intergenic (+94/+20) | mdfA/ampG | multidrug MFS transporter/muropeptide permease AmpG | |||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
CTGGCGATGATTGGCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGG > NC_002947/1544352‑1544649 | cacgacttcttcctgatcacggcgctgctgggggtgcctacgctgatcctgatcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgcctgtgctg < 2:1639037‑M1/1‑1 (MQ=255) ggCGATGATTGGCGCCGGTGCCAGCTGGCTGATTTTTGCCCTGGCGGCGGGGGGGGCGGGGGCGTTGGGGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCGGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGggccggc < 2:299621/150‑1 (MQ=255) cgacttcttcctgatcacggcgctgctgggggtgcctacgctgatcctgatcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgcctgtgctGGc > 1:435370‑M1/148‑150 (MQ=255) cttcctgatcacggcgctgctgggggtgcctacgctgatcctgatcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgcctgtgctGGCCTCTTc > 1:237320‑M1/142‑150 (MQ=255) ttcctgatcacggcgctgctgggggtgcctacgctgatcctgatcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgcctgtgctGGCCTCTTcg < 2:1897190‑M1/10‑1 (MQ=255) ttcctgatcacggcgctgctgggggtgcctacgctgatcctgatcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgccggggccGGCCTCTTcg < 2:1446784‑M1/10‑1 (MQ=255) ttGCCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGCCCTGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGCCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTcgc < 1:634430/150‑1 (MQ=255) ggCGCCGGGGCCAATTTCCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGTGGCGTTGGAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCgg < 2:2284837/150‑1 (MQ=255) ctgatcacggcgctgctgggggtgcctacgctgatcctgatcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgcctgtgctGGCCTCTTCGCgg < 1:592292‑M1/13‑1 (MQ=255) ctgatcacggcgctgctgggggtgcctacgctgatcctgatcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgcctgtgctGGCCTCTTCGCgg > 2:1313651‑M1/138‑150 (MQ=255) gcgcCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCgg < 1:171115/149‑1 (MQ=255) gcCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCTGTGCTGGCCTCTTCGCGGGTa > 1:887068/1‑150 (MQ=255) ggTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCGGGCGGCGGGGTTGGCGGGGGCGTTGGCGTTTTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAc < 1:26365/150‑1 (MQ=255) acggcgctgctgggggtgcctacgctgatcctgatcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgcctgtgctGGCCTCTTCGCGGGTAAAc > 1:1897190‑M1/132‑150 (MQ=255) tGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAccc > 2:914912/1‑150 (MQ=255) ggcgctgctgggggtgcctacgctgatcctgatcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgcctgtgctGGCCTCTTCGCGGGTAAAccc > 1:857170‑M1/130‑150 (MQ=255) gcgctgctgggggtgcctacgctgatcctgatcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgcctgtgctGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCg < 2:2335456‑M1/22‑1 (MQ=255) cAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCt > 1:1800693/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGCTGCATTTTGACCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTTCCGGGGCCGGCCTCTTCTCGGGGAAACCCGCt > 2:1540997/1‑150 (MQ=255) cAGATTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGGTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTTGGGAGGGGTCTGTAGCTCGATAATCGGTAGTGCCGGGAGCGGCCTGTGCTCGGGTAAACCCACt > 1:488536/1‑150 (MQ=255) ctgctgggggtgcctacgctgatcctgatcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgcctgtgctGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:2305697‑M1/25‑1 (MQ=255) tgggggtgcctacgctgatcctgatcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgcctgtgctGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTac < 1:2330847‑M1/29‑1 (MQ=255) tgcATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTacacc > 2:969702/1‑149 (MQ=255) gcATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCgg < 2:1756917/130‑1 (MQ=255) cATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAgg > 1:2058828/1‑150 (MQ=255) cATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAgc > 2:2293084/1‑149 (MQ=255) ttttGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGgc > 2:1152588/1‑150 (MQ=255) ttttGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGgc < 1:1039797/150‑1 (MQ=255) tacgctgatcctgatcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgcctgtgctGGCCTCTTCGCgg < 2:118000‑M1/13‑1 (MQ=255) tacgctgatcctgatcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgcctgtgctGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 1:977004‑M1/112‑139 (MQ=255) ccTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGgcagcgcc > 1:1610763/1‑150 (MQ=255) ccTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGAGGCCCGCCTCTTCGCAGGTGAACCCGCTCCTACACATAgccgcgcg > 1:711205/1‑149 (MQ=255) tGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGgccgcgccgc < 1:1976695/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGgccgcgccgc < 2:316086/150‑1 (MQ=255) gggggcggGGGGGGCGGGGGCTTTGGCGCGGTGGCCGCTGTGGTTGGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGCAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCt < 1:1046804/147‑1 (MQ=255) ggcggcGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTTTACGCTCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCt < 1:1872275/150‑1 (MQ=255) ggcggcGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCt < 1:1145522/150‑1 (MQ=255) ggcggcGGGGCGGGCGGGGGCGTGGGGGCTGTGGCGGCGGTGGTTGGTGGTGGGTGGGCGGCTTGGGGAGGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCt < 2:136530/150‑1 (MQ=38) gatcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgcctgtgctGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAg > 1:2375615‑M1/100‑150 (MQ=255) gatcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgcctgtgctGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAg > 2:1435303‑M1/100‑150 (MQ=255) gatcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgccggggccGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAg > 1:1446784‑M1/100‑150 (MQ=255) atcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgcctgtgctg < 1:1133334‑M1/1‑1 (MQ=255) atcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgcctgtgctg > 2:1133334‑M1/99‑99 (MQ=255) tcgccctgcagtggcatcaggaagccgggcgggggacgccggtggcggacgaccactcggtggctgagaggaactcaatctttgtattgaccacccgGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGa > 1:2100834‑M1/98‑150 (MQ=255) gggTGGCGGGGGCGTGGGCGCTGTGGCCGCTGACGTTTGCTGTTGGGGTGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGa < 1:1965488/150‑1 (MQ=38) 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actcggtggctgagcggccctgaagctttgtattgcctgtgctGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAg < 1:1160115‑M1/51‑1 (MQ=255) tGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGc < 1:1357266/97‑1 (MQ=255) tGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTAc < 2:1301528/105‑1 (MQ=255) tGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTAc > 1:1301528/1‑105 (MQ=255) gAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGc > 2:1564632/1‑123 (MQ=255) gAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGc < 1:1564632/123‑1 (MQ=255) ggggCTGTAGCTCGATAATCGGTGTTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCAcc > 1:2122937/1‑150 (MQ=255) ggggCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTGCTACACAGGGCCGCGCCGTTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCAcc < 2:1370134/150‑1 (MQ=255) ggCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTacac < 2:401643/64‑1 (MQ=255) gCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAggg < 2:1297607/134‑1 (MQ=255) gCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAggg > 1:1297607/1‑134 (MQ=255) tGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTTGCGGGTACACCGGCTCCTACACAGGGCAGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTg > 1:2353979/1‑150 (MQ=255) tGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTg > 2:1586195/1‑150 (MQ=255) gCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTa > 2:2348296/1‑88 (MQ=255) gCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTa < 1:2348296/88‑1 (MQ=255) cTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAagag < 2:447948/98‑1 (MQ=255) cTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAagag > 1:447948/1‑98 (MQ=255) gATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTg > 1:1304396/1‑142 (MQ=255) gATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTg < 2:1304396/142‑1 (MQ=255) ttgcctgtgctGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGt > 2:1697481‑M1/12‑60 (MQ=255) ttgcctgtgctGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGt < 1:1697481‑M1/49‑1 (MQ=255) tgtgctGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGgccgcgccgc < 2:1680168‑M1/44‑1 (MQ=255) tgtgctGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGgccgcgccgc > 1:1680168‑M1/7‑50 (MQ=255) cggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGAAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCgg > 2:252275/1‑150 (MQ=255) GGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGt > 1:399211‑M1/1‑119 (MQ=255) | CTGGCGATGATTGGCGCCGGTGCCAGCTTGCTGCATTTTGCCCTGGCGGCGGGGGTGGCGGGGGCGTTGGCGCTGTGGCCGCTGTGGTTTGTGGTGGGTGGGCGGCCTGGGGAAGGGGCTGTAGCTCGATAATCGGTATTGCCGGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGCCGCGCCGCTTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGCACAGGCAATACAAAGCTTCAGGGCCGCTCAGCCACCGAGTGGTCGTCCGCCACCGGCGTCCCCCGCCCGG > NC_002947/1544352‑1544649 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |