| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 1811455 | 84 (0.950) | 7 (0.080) | 7/232 | NT | 7.6% | intergenic (+20/+108) | ispD/PP_1615 | 2‑C‑methyl‑D‑erythritol 4‑phosphate cytidylyltransferase/LysR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 1811537 | 91 (1.090) | intergenic (+102/+26) | ispD/PP_1615 | 2‑C‑methyl‑D‑erythritol 4‑phosphate cytidylyltransferase/LysR family transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
ACGAAGCCTCGGCCATCGAATGGTCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTT > NC_002947/1811308‑1811604 | acgaAGCCTCGGCCATCGAATGGTCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCttt > 1:295595/1‑150 (MQ=255) cgaAGCCTCGGCCATCGAATGGTCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCtttt < 2:2252594/150‑1 (MQ=255) ccTCGGCCATCGAATGGTCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCgg < 2:2100538/150‑1 (MQ=255) ccTCGGCCATCGAATGGTCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCgg < 2:535450/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCATCGAATGGTCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTcttcgcggg > 1:1126012‑M1/1‑141 (MQ=255) cTCGGCCATCGAATGGTCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCggg < 1:2151807/150‑1 (MQ=255) tCGGCCATCGAATGGTCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGt > 2:84612/1‑150 (MQ=255) ccATCGAATGGTCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAAc < 2:979775/150‑1 (MQ=255) tCGAATGGTCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCg > 2:1879746/1‑150 (MQ=255) aaTGGTCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 2:1593305/150‑1 (MQ=255) aaTGGTCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 2:757625/1‑150 (MQ=255) aaTGGTCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTc > 1:1707894/1‑150 (MQ=255) ggTCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTTTACCCGcgaaaa < 2:565920/150‑6 (MQ=255) tCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAATATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa > 2:2060341/1‑150 (MQ=255) tCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa > 1:2072334/1‑150 (MQ=255) cGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAt < 2:155590/150‑1 (MQ=255) tCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGa < 2:1707894/150‑1 (MQ=255) ccgcGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATc < 2:1665856/150‑1 (MQ=255) ccgcGGCTGGGGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATc < 1:894032/150‑1 (MQ=255) gcgGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGAtt < 2:1803855/143‑1 (MQ=255) gcgGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGAtt > 1:1803855/1‑143 (MQ=255) gcgGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTCGCCTTTTAGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCgg < 1:1261079/150‑1 (MQ=255) ggCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATACACGTCCGACCTCCAATACAGCTCCAATGGTTGCGCCAGCGCTGGCCTTGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCggtg < 1:2340804/150‑1 (MQ=255) tggtggAAGGGCGCGGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGtt < 1:495849/150‑1 (MQ=255) tggAAGGGCGCAGTGACAATATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGa < 1:2060341/150‑1 (MQ=255) aGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGAcaca < 1:1865776/150‑1 (MQ=255) tGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACcgtcgt > 2:1799572/1‑150 (MQ=255) acaacaTAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAg > 1:338500/1‑150 (MQ=255) 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ACGAAGCCTCGGCCATCGAATGGTCCGGTCAGGCGCCGCGGCTGGTGGAAGGGCGCAGTGACAACATAAAGGTGACCCGGCCCGAAGATCTCGAATGGTTGCGCCAGCGCTGGGCGGGTAAACGCTGAGCGTTCTCCTGGGCTGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAATGGATTGCATCGGTGGTTGGACACAGACCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACCAGCAGCACATCCCGTCAGCCGAAACGATACTCCGGCAACCCCGCCAACCCCTCCTT > NC_002947/1811308‑1811604 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |