New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2295818 = | 77 (0.870) | 17 (0.240) | 12/198 | NT | 21.8% | intergenic (+21/+112) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
? | NC_002947 | 2295903 = | 60 (0.840) | intergenic (+106/+27) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
TCGGTCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCA > NC_002947/2295669‑2295983 | tgatgcgccagtttgccggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgt < 1:1457707‑M1/1‑1 (MQ=255) tgatgcgccagtttgccggggtcgaaccccagttgttcgccgaggcggcttatccccgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgt > 1:1110410‑M1/150‑150 (MQ=255) tCGGTCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCtt < 2:904364/150‑1 (MQ=255) tCGGTCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGATCCGATCACTGAGAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCtt < 2:674463/150‑1 (MQ=255) ggcgccagtttgccggggtggcacccacgtggttcggggaggcggcttatccgcgtgtgcggaggtggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgtgtg > 2:306290‑M1/147‑150 (MQ=255) gTCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTtgtg < 1:2216476/150‑1 (MQ=255) gccagtttgccggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGa < 2:14911‑M1/7‑1 (MQ=255) gaccgtttgccggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGa < 2:602567‑M1/7‑1 (MQ=255) aCTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGc < 2:968130/150‑1 (MQ=255) gtttgccggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCgg > 1:756910‑M1/140‑150 (MQ=255) tttgccggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCggg < 2:956663‑M1/12‑1 (MQ=255) ccAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTTTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGc > 2:1059050/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGc < 1:561030/150‑1 (MQ=255) aGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCAt > 1:956663/1‑150 (MQ=255) cggggtcgaaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGcgggccaga < 2:2351428‑M1/17‑5 (MQ=255) ccatgccGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCAt < 2:2230726/141‑1 (MQ=255) ccatgccGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaa > 1:2381272/1‑150 (MQ=255) ccatgccGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATAAGCCATGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGAGCATGACCGCGaa > 1:24157/1‑150 (MQ=255) aaccgcagtggttcgccgaggcggcttatccgcgtgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCgg > 1:972795‑M1/126‑136 (MQ=255) cGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCgg < 1:1625551/150‑1 (MQ=255) agcagcAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCaga < 2:741977/150‑1 (MQ=255) gcaAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTTTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCg < 1:1059050/150‑1 (MQ=255) caAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGGTCCAACTAGTACCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCgg > 2:64164/1‑150 (MQ=255) 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acaGCTACACCGAGCAGCACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTAGGAACGCGCATGAACGCGAGCTCCGCCAGATCCTTTTCCATCCACCGCGGTg > 2:1229973/1‑150 (MQ=255) tgtgcggagctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGccc < 1:1796160‑M1/59‑1 (MQ=255) cacCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCGTCCACCGCGGTGCCCGc > 1:1896169/1‑148 (MQ=255) cacCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGc < 2:1896169/148‑1 (MQ=255) cacCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCtt > 1:1555981/1‑150 (MQ=255) cGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGcgaagc > 2:706848/1‑145 (MQ=255) cGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTcgc > 2:378238/1‑150 (MQ=255) ctggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtcctTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCgg > 2:1746709‑M1/83‑150 (MQ=255) aGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTTTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCgg < 2:1886425/150‑1 (MQ=255) tggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCggg > 2:607185‑M1/82‑150 (MQ=255) ggctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGc > 1:14911‑M1/81‑150 (MQ=255) ctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCAt > 1:2343987‑M1/79‑150 (MQ=255) ggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtcctTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGc > 2:859912‑M1/77‑150 (MQ=255) ggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGc > 2:1796160‑M1/77‑150 (MQ=255) ggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGc > 1:602567‑M1/77‑150 (MQ=255) 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cgcCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACg > 1:2053439‑M2/1‑149 (MQ=255) ccAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACgga < 2:2407855‑M2/150‑4 (MQ=255) aaTTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACggacc < 1:1364876‑M2/150‑6 (MQ=255) ttCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAt < 1:378238/150‑1 (MQ=255) tgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacataggtcctTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAt‑gtg > 1:1123294‑M1/54‑150 (MQ=255) aTGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCcaca > 1:1395357/1‑137 (MQ=255) aTGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCcaca < 2:1395357/137‑1 (MQ=255) ttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCgg > 1:1829978‑M1/52‑119 (MQ=255) aaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGccc < 2:1337294‑M1/19‑1 (MQ=255) aggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgt > 1:155597‑M1/48‑48 (MQ=255) aggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgt < 2:155597‑M1/1‑1 (MQ=255) cccTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGc < 1:1283821/103‑1 (MQ=255) cccTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGc > 2:1283821/1‑103 (MQ=255) cccTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCg > 2:257984/1‑150 (MQ=255) cccTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCg < 2:1100772/150‑1 (MQ=255) ccTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGa > 2:827237/1‑150 (MQ=255) gCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGGCCTTGTGGGAGCGTGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGACATCTACCGTGGTGCCCGCTTCGCGGGCTTGCCCGTGCCCACAGTGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAAt > 1:2177949/1‑150 (MQ=37) aGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAg < 2:1539379/150‑1 (MQ=255) caccaccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGc < 2:1450434/89‑1 (MQ=255) accaccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGc > 2:889661/1‑48 (MQ=255) accaccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGc < 1:889661/48‑1 (MQ=255) ccaccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTACTTGTGGGTGTGGTTATTCTGGCTAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGa < 1:1738882/150‑1 (MQ=37) caccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGc < 1:1691610/86‑1 (MQ=255) caccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGc > 2:1691610/1‑86 (MQ=255) caccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGAc < 1:1490930/150‑1 (MQ=255) caccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCT‑CCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGAcc > 1:859815/1‑150 (MQ=255) ccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCa < 2:1364876/150‑1 (MQ=255) cacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGAccca > 2:1631907/1‑148 (MQ=255) aacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCggg > 1:1275650‑M1/25‑93 (MQ=255) tCTGGCTGGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGc < 2:1149500/150‑1 (MQ=255) ggCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCCTCCAAAGCCGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCtt < 1:760836/150‑1 (MQ=38) ggCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCtt < 1:1921822/150‑1 (MQ=255) cTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGa < 1:2407855/150‑1 (MQ=255) ttGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCGACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGaa < 1:1293336/150‑1 (MQ=255) ttGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGaa < 2:2391775/150‑1 (MQ=255) gtgAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCAACCATACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGc < 2:2392859/150‑1 (MQ=255) aGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTcc < 1:847916/150‑1 (MQ=255) gTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCTATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGa > 2:341227/1‑150 (MQ=255) gTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAt > 2:821694/1‑99 (MQ=255) gTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAt < 1:821694/99‑1 (MQ=255) tCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACggacctcacacaagccagatcagtggtggtgcttgccactcagggccgcatggaaattgg < 2:808406‑M2/150‑61 (MQ=255) tCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGaa < 1:257984/150‑1 (MQ=255) ccTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGGGGTCCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAag < 1:64164/150‑1 (MQ=255) ccTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGaa < 2:1771741/149‑1 (MQ=255) ccTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGaa > 1:1771741/1‑149 (MQ=255) cTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGATCCGGTGCCATGCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCCT‑GTGCAGCCCGAAGCACACGCATCTGACCATGATTGCCTTGCACAGCTTCGAagc > 2:1171123/1‑150 (MQ=21) cTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAagc > 2:590591/1‑150 (MQ=255) ttGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGCACACGGGCAGAGCCGGTGCCATGCACCGCGTTGACCGATTCGCGGGCATGCGAG‑TGGGAAACCTTCTCTTCGCTTGGTCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACACCTCCGAagcc > 1:2351428/1‑150 (MQ=9) ttGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTg < 1:1194799/130‑1 (MQ=255) ttGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTg > 2:1194799/1‑130 (MQ=255) ttGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTccagcca < 2:404766/150‑1 (MQ=21) | TCGGTCGTACTGCCAGCGCATGCCCATGCCGACAGCAGCAAGGCTTCTGCCACCCACAGCTACACCGAGCAGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAT‑GTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCA > NC_002947/2295669‑2295983 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |