New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2505513 = | 79 (0.890) | 8 (0.090) | 7/236 | NT | 9.4% | coding (70/1107 nt) | PP_2199 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2505545 = | 78 (0.920) | coding (102/1107 nt) | PP_2199 | hypothetical protein |
AAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCTGATGGACCAGTTCCACCAGTGTCTGCGCATACCGAG > NC_002947/2505364‑2505658 | aaGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGccc > 2:1815034/1‑150 (MQ=255) cgaggccatgaagtgatgaaagtgctggcgccggctcggtatgcgcagacactggtggaactggtccatcagccaggtcttgccgcgcccgaccgggccccagaggtagaggccctgggtggggcggccctgctcaagggactggaagCa < 2:37133‑M1/2‑1 (MQ=255) gATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGCCCCTGCCCAgg < 2:1611133/150‑1 (MQ=255) ggccatgaagtgatgaaagtgctggcgccggctcggtatgcgcagacactggtggaactggtccatcagccaggtcttgccgcgcccgaccgggccccagaggtagaggccctgggtggggcggccctgctcaagggactggaagCAGGc > 1:1256273‑M1/146‑150 (MQ=255) ggccatgaagtgatgaaagtgctggcgccggctcggtatgcgcagacactggtggaactggtccatcagccaggtcttgccgcgcccgaccgggccccagaggtagaggccctgggtggggcggccctgctcaagggactggaagCAGGc < 2:794882‑M1/5‑1 (MQ=255) cgcgcTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCcgc < 1:699997/150‑1 (MQ=255) gcgcTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGcctcga > 2:1210849/1‑146 (MQ=255) tACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGcgtcgt > 2:484263/1‑150 (MQ=255) cTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGtcgtcg > 1:995056/1‑150 (MQ=255) tCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCCGCCCCCAAACCCCCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGa < 1:1328054/150‑1 (MQ=255) gtcagTCGGCCAGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAg > 2:1554213/5‑150 (MQ=255) gCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCa > 1:1574868/1‑150 (MQ=255) tggcgccggctcggtatgcgcagacactggtggaactggtccatcagccaggtcttgccgcgcccgaccgggccccagaggtagaggccctgggtggggcggccctgctcaagggactggaagCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCaa < 2:1396394‑M1/27‑1 (MQ=255) tGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGc < 1:114503/150‑1 (MQ=255) gcgccggctcggtatgcgcagacactggtggaactggtccatcagccaggtcttgccgcgcccgaccgggccccagaggtagaggccctgggtggggcggccctgctcaagggactggaagCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGc > 1:1396394‑M1/122‑150 (MQ=255) ccggctcggtatgcgcagacactggtggaactggtccatcagccaggtcttgccgcgcccgaccgggccccagaggtagaggccctgggtggggcggccctgctcaagggactggaagCa < 2:1099002‑M1/2‑1 (MQ=255) ccggctcggtatgcgcagacactggtggaactggtccatcagccaggtcttgccgcgcccgaccgggccccagaggtagaggccctgggtggggcggccctgctcaagggactggaagCa > 1:1099002‑M1/119‑120 (MQ=255) cTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTc < 2:1272240/150‑1 (MQ=255) gACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCa < 1:484263/150‑1 (MQ=255) gACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCa < 1:1815034/150‑1 (MQ=255) aCGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGcgtcgt < 2:492029/125‑1 (MQ=255) aCGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGcgtcgt > 1:492029/1‑125 (MQ=255) gcgcgcCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCCTCCAGTc < 1:1554213/150‑1 (MQ=255) tGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAg < 2:1574868/150‑1 (MQ=255) gccGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAg > 2:1650365/2‑150 (MQ=255) ccGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAgg > 1:2046005/1‑150 (MQ=255) ccGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAgg < 1:1650365/150‑1 (MQ=255) gggTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGgccg > 1:250043/1‑150 (MQ=255) ggTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTTGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGgccgc > 2:812352/1‑150 (MQ=255) aCAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCccca > 2:1372538/1‑150 (MQ=255) tggtccatcagccaggtcttgccgcgcccgaccgggccccagaggtagaggccctgggtggggcggccctgctcaagggactggaagCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCa < 2:532421‑M1/38‑1 (MQ=255) tggtccatcagccaggtcttgccgcgcccgaccgggccccagaggtagaggccctgggtggggcggccctgctcaagggactggaagCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCa > 1:532421‑M1/88‑125 (MQ=255) aGTCGGGTAGGATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCcccacc > 1:2178130/1‑150 (MQ=255) gTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCcccaccc > 1:7630/1‑150 (MQ=255) tCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCcccaccca < 2:995056/150‑1 (MQ=255) ggTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTccc > 1:237446/1‑125 (MQ=255) ggTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTccc < 2:237446/125‑1 (MQ=255) gAANGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCCAGAATCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCctc < 1:1834613/150‑1 (MQ=255) agccaggtcttgccgcgcccgaccgggccccagaggtagaggccctgggtggggcggccctgctcaagggactggaagCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCa < 1:240729‑M1/38‑1 (MQ=255) agccaggtcttgccgcgcccgaccgggccccagaggtagaggccctgggtggggcggccctgctcaagggactggaagCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCa > 2:240729‑M1/79‑116 (MQ=255) aaTGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAg < 1:326888/105‑1 (MQ=255) aaTGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAg > 2:326888/1‑105 (MQ=255) aaTGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCctct > 2:393800/1‑150 (MQ=255) cGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGccccagagg > 1:671918/1‑143 (MQ=255) cGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACct < 2:1739335/150‑1 (MQ=255) gCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACctct < 2:659057/150‑1 (MQ=255) gCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGcgt < 1:1994580/77‑1 (MQ=255) gCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGcgt > 2:1994580/1‑77 (MQ=255) gCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGc > 2:1809598/1‑150 (MQ=255) cccTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAggg < 2:370710/118‑1 (MQ=255) cccTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAggg > 1:370710/1‑118 (MQ=255) ccTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAgg < 2:658485/131‑1 (MQ=255) ccTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAgg > 1:658485/1‑131 (MQ=255) cTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAggg > 1:859869/1‑116 (MQ=255) cTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAggg < 2:859869/116‑1 (MQ=255) cccccAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCgg < 2:250043/150‑1 (MQ=255) ccccAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCG‑CCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGgc > 1:820214/1‑150 (MQ=255) cccAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTTGGTGCCTTGCAAGCATGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGgc > 1:169864/1‑150 (MQ=255) ccAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGccc > 1:1161245/1‑56 (MQ=255) ccAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGccc < 2:1161245/56‑1 (MQ=255) ccAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACctct > 2:1623702/1‑134 (MQ=255) ccAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACctct < 1:1623702/134‑1 (MQ=255) ccAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACGCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGCGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGgcg > 2:2290010/1‑150 (MQ=255) aaaCCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGcgcg < 1:1606649/150‑1 (MQ=255) cccagaggtagaggcccggggtggggcggccctgctcaagggactggaagCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCt > 1:2394730‑M1/51‑81 (MQ=255) cccagaggtagaggcccagggtggggcggccctgctcaagggactggaagCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCt < 2:2394730‑M1/31‑1 (MQ=255) ctctACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAg > 1:2172269/1‑150 (MQ=255) ctctACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCCCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAg > 2:607956/1‑150 (MQ=255) ctctACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACATTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGACCCGGTCGGGCGCGGCAAg > 2:1030350/1‑150 (MQ=255) tctACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCg < 1:37365/134‑1 (MQ=255) tctACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCg > 2:37365/1‑134 (MQ=255) ctACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGAc < 2:2172269/150‑1 (MQ=255) tACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGAcc > 2:782719/1‑150 (MQ=255) aCCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGAc < 1:36416/148‑1 (MQ=255) aCCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGAc > 2:36416/1‑148 (MQ=255) ccAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTg < 1:1372538/150‑1 (MQ=255) gCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCt > 1:1391587/1‑150 (MQ=255) aGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCTGAt < 2:2178130/150‑1 (MQ=255) gCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCTGATg < 2:1391587/150‑1 (MQ=255) aCTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCt < 1:829687/137‑1 (MQ=255) aCTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCt > 2:829687/1‑137 (MQ=255) aCTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCTGATGGACCAGTTc > 2:1929264/1‑150 (MQ=255) cTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCt > 1:992875/1‑136 (MQ=255) cTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCt < 2:992875/136‑1 (MQ=255) tCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCTGATGGACCAGTTcca > 2:647432/1‑150 (MQ=255) tCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCTGATGGACCAGTTcca > 1:454330/1‑150 (MQ=255) cGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCTGATGGACCAGTTccac < 1:701000/150‑1 (MQ=255) gggCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTTGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCTGATGGACCAGTTccacca < 1:812352/150‑1 (MQ=255) gggCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGt > 2:2151584/1‑111 (MQ=255) gggCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGt < 1:2151584/111‑1 (MQ=255) gCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCTGATGGACCAGTTCCACCAgt > 2:231285/1‑150 (MQ=255) ttGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCTGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTAGGGCGCGGCAAGACCTGGCTGATGGACCAGTTCCACCAGTGTCTgc < 1:2290010/150‑1 (MQ=255) ttGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCTGATGGACCAGTTCCACCAGTGTCTgc > 2:301092/1‑150 (MQ=255) ttGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCTGATGGACCAGTTCCACCAGTGTCTgc < 1:393800/150‑1 (MQ=255) aCCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCTGATGGACCAGTTCCACCAGTGTCTGCGCATAc > 1:794882/1‑150 (MQ=255) ccTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCTGATGGACCAGTTCCACCAGTGTCTGCGCATACCg > 1:2082809/1‑150 (MQ=255) cTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCTGATGGACCAGTTCCACCAGTGTCTGCGCATACCGa < 1:1317168/150‑1 (MQ=255) tGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCTGATGGACCAGTTCCACCAGTGTCTGCGCATACCGAg < 2:2046005/150‑1 (MQ=255) | AAGGATGGCGCGCTACTCAAGGTCGGCCTGGCCGACTGACGCGCGCCTGCACCGAGGGTGACAGTCGGGTAGAATGCGGCATGGCCCTCGACCCCCAAACCCTCTACCAGCAAGCCCTGAGCACTCGGGGCTACGTTGCTGACCCTGCCCAGGCCCGCGTCGTCGAGGCCTTGCAAGCCTGCTTCCAGTCCCTTGAGCAGGGCCGCCCCACCCAGGGCCTCTACCTCTGGGGCCCGGTCGGGCGCGGCAAGACCTGGCTGATGGACCAGTTCCACCAGTGTCTGCGCATACCGAG > NC_002947/2505364‑2505658 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |