| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2656970 = | 85 (0.960) | 6 (0.070) | 6/240 | NT | 6.8% | coding (685/1341 nt) | pabB | aminodeoxychorismate synthase/para‑aminobenzoate synthase multi‑enzyme complex |
| ? | NC_002947 | 2657003 = | 82 (0.950) | coding (652/1341 nt) | pabB | aminodeoxychorismate synthase/para‑aminobenzoate synthase multi‑enzyme complex | |||||
GTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCA > NC_002947/2656821‑2657119 | gTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCgg > 1:1255918/1‑150 (MQ=255) ttGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCa < 1:1865697/150‑1 (MQ=255) ttGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCa > 1:1839417/1‑150 (MQ=255) ccggctgctcgcgccgatggccggtgacctggagccggagcaatacaaaaccgctttcgaccaggtacaacgctacatccaggccggtgactgctaccagatcaacctcacccaacgctttcgcgcaccctgccaaggcgatccatGGCa > 1:2158080‑M1/147‑150 (MQ=255) cgcCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGc < 1:498289/150‑1 (MQ=255) tCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGgcgc > 1:1108171/1‑150 (MQ=255) gTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAg < 2:385727/142‑1 (MQ=255) gTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAg > 1:385727/1‑142 (MQ=255) gTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCtacc < 2:1937202/150‑4 (MQ=255) gTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGt < 2:37033/150‑1 (MQ=255) ggCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAgg < 1:726569/150‑1 (MQ=255) gggTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTgg > 1:1034652/1‑143 (MQ=255) gggTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTgg < 2:1034652/143‑1 (MQ=255) ccTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATg > 1:117394/1‑150 (MQ=255) cTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATgg > 1:1306486/1‑150 (MQ=255) cTTGATCGGCCGGGGTTCCACCTGTCCCGGGCTGACGCGGCTTAGGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGCCGGGCACGCCTGACGCCGGGCCTCGTAGGCCCGctccgg > 2:612402/1‑145 (MQ=255) ttGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGa > 1:471373/1‑150 (MQ=255) ttGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGa < 1:2256423/150‑1 (MQ=255) gATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAgg > 1:1294983/1‑127 (MQ=255) gATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAgg < 2:1294983/127‑1 (MQ=255) tCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGc < 2:1295300/150‑1 (MQ=255) cGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGTGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGcc < 1:1089767/150‑1 (MQ=255) caatacaaaaccgctttcgaccaggtacaacgctacatccaggccggtgactgctaccagatcaacctcacccaacgctttcgcgcaccctgccaaggcgatccatGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCa > 2:1966144‑M1/107‑140 (MQ=255) caatacaaaaccgctttcgaccaggtacaacgctacatccaggccggtgactgctaccagatcaacctcacccaacgctttcgcgcaccctgccaaggcgatccatGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCa < 1:1966144‑M1/34‑1 (MQ=255) ccGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTg < 1:1985333/150‑1 (MQ=255) cGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTATTGGCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTgg < 1:328992/150‑1 (MQ=255) gggTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGc > 1:1431993/1‑150 (MQ=255) gggTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGc > 2:1437263/1‑150 (MQ=255) tttCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGcc < 2:666757/107‑1 (MQ=255) tttCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGcc > 1:666757/1‑107 (MQ=255) ggccctggcTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGaa > 2:1102028/1‑150 (MQ=255) ccctggcTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGaaa > 2:641330/1‑149 (MQ=255) ccctggcTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGaaa < 1:641330/149‑1 (MQ=255) gcTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGGCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTg < 1:877604/150‑1 (MQ=255) tacaacgctacatccaggccggtgactgctaccagatcaacctcacccaacgctttcgcgcaccctgccaaggcgatccatGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCAt < 1:916489‑M1/35‑1 (MQ=255) tacaacgctacatccaggccggtgactgctaccagatcaacctcacccaacgctttcgcgcaccctgccaaggcgatccatGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCAt > 2:916489‑M1/82‑116 (MQ=255) 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aGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCt < 2:2382688/150‑1 (MQ=255) aGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCt > 1:2312734/1‑150 (MQ=255) gcgcTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAATCGTTGGGTGAGGTTGATCTg < 2:1046368/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTg < 1:435247/150‑1 (MQ=255) gcgcTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTg < 1:194271/150‑1 (MQ=255) 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tAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGGGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGtt < 2:171363/150‑1 (MQ=255) gCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGtttt < 1:128476/150‑1 (MQ=255) cGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGt < 2:1108171/150‑1 (MQ=255) ggAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTa < 1:2374335/150‑1 (MQ=255) aaGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTgg > 2:1725780/1‑78 (MQ=255) aaGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTgg < 1:1725780/78‑1 (MQ=255) ggggTCGGGCAGGCCTGGCGCCGAGACTCTGAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTACGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTcc < 1:612402/150‑1 (MQ=255) ggggTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTgcg < 1:608467/63‑1 (MQ=255) ggggTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTgcg > 2:608467/1‑63 (MQ=255) ggggTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGAt > 1:192033/1‑110 (MQ=255) ggggTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGAt < 2:192033/110‑1 (MQ=255) ggggTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTcc < 2:1255918/150‑1 (MQ=255) ggggTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTcc > 1:1522963/1‑150 (MQ=255) ggggTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCCAAAGCGTTGGGGGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTcc > 2:577216/1‑150 (MQ=255) GGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCa > 2:282201‑M1/1‑150 (MQ=255) GGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCa < 2:2226143‑M1/150‑1 (MQ=255) GGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGCGTGCGCGAAAGCGTTGGGGGAGATTGATCTGGTAGCCGTCACCGGCCTGGATGTAGAGTTGTCCCTGGTCGAAAGCGGCATTGTATTGCTCCGGCTCCa < 2:112803‑M1/150‑1 (MQ=255) | GTCTTGCGCCGGGTCACTGGCGCGTGGGCGGGTGCCCTTGATCGGCCGGGTTTCCACCTGGCCCTGGCTGACGCGGATGAAGCGCTCGGGCGAAAAGCTCAGCAGGGTACTGCCGTCGGCCAGTTGCTGGTAGCCGGAGAAGGGGGTCGGGCAGGCCTGGCGCAGGGCCTGGTAGGCCCGCCATGGATCGCCTTGGCAGGGTGCGCGAAAGCGTTGGGTGAGGTTGATCTGGTAGCAGTCACCGGCCTGGATGTAGCGTTGTACCTGGTCGAAAGCGGTTTTGTATTGCTCCGGCTCCA > NC_002947/2656821‑2657119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |