New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 3164984 = | 104 (1.170) | 5 (0.060) | 5/234 | NT | 5.1% | coding (452/1083 nt) | PP_2779 | putative Beta‑ketoacyl synthase |
? | NC_002947 | 3164999 = | 89 (1.060) | coding (467/1083 nt) | PP_2779 | putative Beta‑ketoacyl synthase |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
AAGTGGATGGCCCCAGTTCGTGCTGGGATGCAGTGCAGGCCATCGGCGCACAACCGGCAGATCTGTTGGCGCAATTCTTTGCCCACACACCGCCGCTGCATGCGCTGATGATGCTCAACAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCCATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCCGTCGTCGTCAGTAGCAGTCCGAACATCACCCCGGCGTTGT > NC_002947/3164837‑3165133 | cgtcacgcaggtacaacgccggggtgatgttcggactgctactgacgacgacggcagcatcggcacggccttcgctcagatgggcagcggcctccatcaaagcatccagccccgcattgccctgggagcaaaaaccacccatgggccCCt > 1:1656725‑M1/148‑150 (MQ=255) gtcacgcaggtacaacgccggggtgatgttcggactgctactgacgacgacggcagcatcggcacggccttcgctcagatgggcagcggcctccatcaaagcatccagccccgcattgccctgggagcaaaaaccacccatgggccCCtt > 1:1597061‑M1/147‑150 (MQ=255) gTGGATGGCCCCAGTTCGTGCTGGGATGCAGTGCAGGCCATCGGCGCACAACCGGCAGATCTGTTGGCGCAATTCTTTGCCCACACACCGCCGCTGCATGCGCTGATGATGCTCAACAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTg < 2:1311514/150‑1 (MQ=255) gATGGCCCCAGTTCGTGCTGGGATGCAGTGCAGGCCATCGGCGCACAACCGGCAGATCTGTTGGCGCAATTCTTTGCCCACACACCGCCGCTGCATGCGCTGATGATGCTCAACAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGt > 1:1627059/1‑150 (MQ=255) aTGGCCCCAGTTCGTGCTGGGATGCAGTGCAGGCCATCGGCGCACAACCGGCAGATCTGTTGGCGCAATTCTTTGCCCACACACCGCCGCTGCATGCGCTGATGATGCTCAACAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGtt < 1:679459/150‑1 (MQ=255) aTGGCCCCAGTTCGTGCTGGGATGCAGTGCAGGCCATCGGCGCACAACCGGCAGATCTGTTGGCGCAATTCTTTGCCCACACACCGCCGCTGCATGCGCTGATGATGCTCAACAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGtt > 2:2034584/1‑150 (MQ=255) gCCCCAGTTCGTGCTGGGATGCAGTGCAGGCCATCGGCGCACAACCGGCAGATCTGTTGGCGCAATTCTTTGCCCACACACCGCCGCTGCATGCGCTGATGATGCTCAACAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCa > 2:174608/1‑150 (MQ=255) ccccAGTTCGTGCTGGGATGCAGTGCAGGCCATCGGCGCACAACCGGCAGATCTGTTGGCGGAATTCTTTGCCCACACACCGCCGCTGCATGCGCTGATGATGCTCAACAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCaa > 2:239694/1‑150 (MQ=255) ccccAGTTCGTGCTGGGATGCAGTGCAGGCCATCGGCGCACAACCGGCAGATCTGTTGGCGCAATTCTTTGCCCACACACCGCCGCTGCATGCGCTGATGATGCTCAACAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCaa < 1:1438477/150‑1 (MQ=255) ccccAGTTCGTGCTGGGATGCAGTGCAGGCCATCGGCGCACAACCGGCAGATCTGTTGGCGCAATTCTTTGCCCACACACCGCCGCTGCATGCGCTGATGATGCTCAACAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCaa > 1:1734819/1‑150 (MQ=255) ccccAGTTCGTGCTGGGATGCAGTGCAGGCCATCGGCGCACAACCGGCAGATCTGTTGGCGCAATTCTTTGCCCACACACCGCCGCTGCATGCGCTGATGATGCTCAACAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCaa > 2:39315/1‑150 (MQ=255) cccAGTTCGTGCTGGGATGCAGTGCAGGCCATCGGCGCACAACCGGCAGATCTGTTGGCGCAATTCTTTGCCCACACACCGCCGCTGCATGCGCTGATGATGCTCAACAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAg > 2:1799292/1‑150 (MQ=255) cccAGTTCGTGCTGGGATGCAGTGCAGGCCATCGGCGCACAACCGGCAGATCTGTTGGCGCAATTCTTTGCCCACACACCGCCGCTGCATGCGCTGATGATGCTCAACAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAg > 1:123005/1‑150 (MQ=255) cccAGATCGTGCTGGGATGCAGTGCAGGCCAGCGGCGCACAACCGGCAGATCTGTTGGCGCAATTCTTTGCCCACACACCGCCGCTGCATGCGCTGATGATGCTCAACAGCAGCTTCACGTCCCACTCGGCTTAGGCCTTGCGTTGCAAg > 2:1130922/1‑150 (MQ=255) aaacgccggggtgatgttcggactgctactgacgacgacggcagcatcggcacggccttcgctcagatgggcagcggcctccatcaaagcatccagccccgcattgccctgggagcaaaaaccacccatgggccCCTTGc < 2:2021371‑M1/6‑1 (MQ=255) aaacgccggggtgatgttcggactgctactgacgacgacggcagcatcggcacggccttcgctcagatgggcagcggcctccatcaaagcatccagccccgcattgccctgggagcaaaaaccacccatgggccCCTTGc > 1:2021371‑M1/135‑140 (MQ=255) gcggggATGCAGTGCAGGCCATCGGCGCACAACCGGCAGATCTGTTGGCGCAATTCTTTGCCCACACACCGCCGCTGCATGCGCTGATGATGCTCAACAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATgg < 1:668239/147‑1 (MQ=255) gCTGGGATGCAGTGCAGGCCATCGGCGCACAACCGGCAGATCTGTTGGCGCAATTCTTTGCCCACACACCGCCGCTGCATGCGCTGATGATGCTCAACAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATgg < 2:624152/150‑1 (MQ=255) 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atgCTCAACAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGggt < 2:1541031/63‑1 (MQ=255) atgCTCAACAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGggt > 1:1541031/1‑63 (MQ=255) atgCTCAACAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCCATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCcgtc < 2:5033/150‑1 (MQ=255) tCAACAGCAGCGTCATAGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCCATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCcgtcgtcg > 1:2315326/1‑150 (MQ=255) aCAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCTTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCCATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCCGTCGTCGTCa < 1:2329557/150‑1 (MQ=255) aCAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCCATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCCGTCGTCGTCa < 1:1175216/150‑1 (MQ=255) gcagcGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCCATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCCGTCGTCGTCAGTa < 1:391957/150‑1 (MQ=255) cagcGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCCATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCCGTCGTCGTCAGTa > 2:1482562/1‑149 (MQ=255) cagcGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCCATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCCGTCGTCGTCAGTa < 1:1482562/149‑1 (MQ=255) tCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCCATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCCGTCGTCGTCa > 1:1069807/1‑141 (MQ=255) tCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCCATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCCGTCGTCGTCa < 2:1069807/141‑1 (MQ=255) aaaaaccacccatgggccCCTTGCAACGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCCATCTGAg < 1:1905363‑M1/88‑1 (MQ=255) aaaaaccacccatgggccCCTTGCAACGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCCATCTGAg > 2:1905363‑M1/19‑106 (MQ=255) ggCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCCATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCCGTCGTCGTCAGTAGCAGTCCGaa < 2:2160800/150‑1 (MQ=255) aaaaccacccatgggccCCTTGCAACGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGcc > 2:2067903‑M1/18‑97 (MQ=255) aaaaccacccatgggccCCTTGCAACGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGcc < 1:2067903‑M1/80‑1 (MQ=255) gCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCCATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCCGTCGTCGTCAGTAGCAGTCCGAAc > 1:1543350/1‑150 (MQ=255) ccACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCCATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCCGTCGTCGTCAGTAGCAGTCCGAACAt < 2:2315326/150‑1 (MQ=255) aCGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGTCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCCATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCCGTCGTCGTCAGTAGCAGTCCGAACATCa < 2:682329/150‑1 (MQ=255) atgggccCCTTGCAACGCAAGG‑‑CCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCAATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCCGTCGTCGTCAGTAGCAGTCCGAACATCACCCCGGc < 2:1724365‑M1/143‑1 (MQ=255) cTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCCATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCCGTCGTCGTCAGTAGCAGTCCGAACATCACCCCgg > 2:1432569/1‑150 (MQ=255) CCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGGGGCTGCCCATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCCGTCGTCGTCAGTATCAGTCCGAACATCACCCCGGCGTTGt < 1:353684‑M1/150‑1 (MQ=255) CCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTAGCAGGGCAATGCGGGGCCACCTTCGTTGATGAATTCCGCTGCCCATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCCGTCGTCGTCAGTAGCAGTCCGAACATCACCCCGGCGTTGt < 1:297049‑M1/150‑1 (MQ=255) | AAGTGGATGGCCCCAGTTCGTGCTGGGATGCAGTGCAGGCCATCGGCGCACAACCGGCAGATCTGTTGGCGCAATTCTTTGCCCACACACCGCCGCTGCATGCGCTGATGATGCTCAACAGCAGCGTCATGGCCCACGCGGCTGAGGCCTTGCGTTGCAAGGGGCCCATGGGTGGTTTTTGCTCCCAGGGCAATGCGGGGCTGGATGCTTTGATGGAGGCCGCTGCCCATCTGAGCGAAGGCCGTGCCGATGCTGCCGTCGTCGTCAGTAGCAGTCCGAACATCACCCCGGCGTTGT > NC_002947/3164837‑3165133 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |