New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 807806 | 68 (0.770) | 5 (0.060) | 5/240 | NT | 7.0% | coding (231/708 nt) | PP_0694 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 807830 | 67 (0.780) | coding (207/708 nt) | PP_0694 | hypothetical protein |
GTACTTGTCCAGCAGCGAGGGCAGTTCGTCGCGACCGATGCTGCCACCGTCGAGCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCTGGGCGTACAGCTCAGGGTCGCGCCGGCTGACGTGGAAGC > NC_002947/807683‑807975 | gTACTTGTCCAGCAGCGAGGGCAGTTCGTCGCGACCGATGCTGCCACCGTCGAGCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGgc > 1:69265‑M2/1‑148 (MQ=255) cTTGTCCAGCAGCGAGGGCAGTTCGTCGCGACCGATGCTGCCACCGTCGAGCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGt > 2:1259874/1‑150 (MQ=255) ttGTCCAGCAGCGAGGGCAGTTCGTCGCGACCGATGCTGCCACCGTCGAGCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTc > 2:1304805/1‑150 (MQ=255) cagcagCGAGGGCAGTTCGTCGCGACCGATGCTGCCACCGTCGAGCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTc > 1:1982102/1‑150 (MQ=255) gggCAGTTCGTCGCGACCGATGCTGCCACCGTCGAGCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGaa > 1:500393/1‑150 (MQ=255) gggCAGTTCGTCGCGACCGATGCTGCCACCGTCGAGCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGaa < 2:500393/150‑1 (MQ=255) gggCAGTTCGTCGCGACCGATGCTGCCACCGTCGAGCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGCCGGACATGACCgccgcgca < 1:618390/150‑8 (MQ=255) ggCAGTTCGTCGCGACCGATGCTGCCACCGTCGAGCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAag < 2:1203638/150‑1 (MQ=255) ttCGTCGCGACCGATGCTGCCACCGTCGAGCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAgtagta < 2:161669/150‑1 (MQ=255) tcgCGACCTAGGCTGCCCTCGTCCGGCACGGCCATCGGGTCGCGGGCCGGCTGAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTCAACAGCGACAGGCGCTTTGAGATCTTGTTGACCTCCGCGGCGGTCATGTCCAGGACGATGTAGTCGaac < 2:1147917/150‑2 (MQ=255) gACCGATGCTGCCACCGTCGAGCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCAc < 2:1194213/150‑1 (MQ=255) tgcCACCGTCGAGCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGc > 1:2378455/1‑150 (MQ=255) cACCGTCGAGCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACg < 1:165251/139‑1 (MQ=255) cACCGTCGAGCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACg > 2:165251/1‑139 (MQ=255) cACCGTCGAGCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGcaca > 2:855853/1‑150 (MQ=255) cGTCGAGCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCa > 1:2399350/1‑150 (MQ=255) gAGCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTc < 1:654314/150‑1 (MQ=255) gCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGca < 1:1775975/139‑1 (MQ=255) gCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGca > 2:1775975/1‑139 (MQ=255) aCGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAg < 2:1751332/150‑1 (MQ=255) ggCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGcac > 1:1112338/1‑136 (MQ=255) ggCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGcac < 2:1112338/136‑1 (MQ=255) ggCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGcc > 1:2040609/1‑150 (MQ=255) tCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGAACAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAggg > 1:1770992/1‑150 (MQ=255) ggTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCt < 2:1333474/150‑1 (MQ=255) tCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTg < 1:2066687/150‑1 (MQ=255) cgcgGCCCTGGTCAACAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGa < 2:1868440/150‑1 (MQ=255) cccTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAgg < 1:1304805/150‑1 (MQ=255) cccTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAgg < 1:1093325/150‑1 (MQ=255) cTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGt < 1:219263/150‑1 (MQ=255) tGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTg < 1:1278386/150‑1 (MQ=255) aGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTc < 1:889466/78‑1 (MQ=255) aGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTc > 2:889466/1‑78 (MQ=255) cAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCCTGTTCGTCAAGAAGTAGTAGAAACCACCGGTCTGACCTACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTaat > 1:162790/1‑148 (MQ=255) gTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTc < 2:1186786/150‑1 (MQ=255) gTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTc < 2:891609/150‑1 (MQ=255) tCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTc < 1:18347/63‑1 (MQ=255) tCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTc > 2:18347/1‑63 (MQ=255) gACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGaa < 2:1510195/150‑1 (MQ=255) gACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGaa < 2:1774333/150‑1 (MQ=255) gACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGaa > 2:1060700/1‑150 (MQ=255) ccAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAgg < 1:1053712/128‑1 (MQ=255) ccAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAgg > 2:1053712/1‑128 (MQ=255) aGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTc < 2:590160/150‑1 (MQ=255) aGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTc < 1:1942059/150‑1 (MQ=255) gATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGa < 1:1060700/150‑1 (MQ=255) aGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCt < 2:2378455/150‑1 (MQ=255) ggTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGgcgcctgtcgctgttcaccttcatcctggtcgagcaccttgctgaccagggccgcgacccgatggccgtg > 1:1633091‑M2/1‑43 (MQ=255) ggTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGgcgcctgtcgctgttcaccttcatcctggtcgagcaccttgctgaccagggccgcgacccgatggccgtg < 2:1633091‑M2/113‑71 (MQ=255) ggTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCTg > 2:1893510/1‑150 (MQ=255) gTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAag < 2:2174647/63‑1 (MQ=255) gTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAag > 1:2174647/1‑63 (MQ=255) gAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCTGGGc > 2:290445/1‑150 (MQ=255) aaCAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCTGGGCg < 2:1164980/150‑1 (MQ=255) cAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGgcgcctgtcgctgttcaccttcatcctggtcgagcaccttgctgacca > 2:1917986‑M2/1‑37 (MQ=255) cAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGgcgcctgtcgctgttcaccttcatcctggtcgagcaccttgctgacca < 1:1917986‑M2/85‑49 (MQ=255) cAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTAACGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCTGGGCGTa > 2:1639858/1‑150 (MQ=255) aGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCTGGGCGTAc > 1:1780745/1‑150 (MQ=255) cGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGCCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCTGGGCGTACAg < 1:507729/150‑1 (MQ=255) atgctcggcgcTGTCGTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCTGGGCGTACAGCTCa < 2:2067523/143‑1 (MQ=255) gcTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGgcgcctgtcgctgttcaccttcatcctggtcgagcaccttgctgaccagggccgcgacccgatggccgtgctcgacggtggcagcatcggtcgcgacgaactgccctcgctgctggacaagtac < 2:1360776‑M2/150‑125 (MQ=255) cTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTAc > 1:108963/1‑109 (MQ=255) cTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTAc < 2:108963/109‑1 (MQ=255) cTGCGCGGTCGTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCTGGGCGTACAGCTCAGGGTc < 1:855853/150‑1 (MQ=255) ccgGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCTGGGCGTACAGCTCAGGGTCgcgc < 1:145816/149‑1 (MQ=255) cgGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTc > 1:2334472/1‑109 (MQ=255) cgGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTc < 2:2334472/109‑1 (MQ=255) ttgttgACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCTGGGCGTACAGCTCAGGGTCGCGCCGGCTg > 2:1363170/1‑150 (MQ=255) tggttgACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAATAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCGTGAACAGGGTGCGGTACTGGTGTTGGAGGTTCGACAGCGGGGCGTAGAGCGCAGGGTCGCGCCGGcgg > 1:1028332/3‑148 (MQ=255) gttgACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGaa < 2:2301860/69‑1 (MQ=255) gttgACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGaa > 1:2301860/1‑69 (MQ=255) gttgACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCTGGGCGTACAGCTCAGGGTCGCGCCGGCTGAc < 1:290445/150‑1 (MQ=255) gttgACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCTGGGCGTACAGCTCAGGGTCGCGCCGGCTGAc < 1:2111189/150‑1 (MQ=255) tgACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCTGGGCGTACAGCTCAGGGTCGCGCCGGCTGACGt < 1:391075/150‑1 (MQ=255) gtGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGACGAAGTAGAAACCACGCGTATCGCACACCAGATCGAAACGCAGGGACGTGAGCAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCGGGGCGTGCAGCTTAGAGGCGCGCCGGCTGGCgatgaa > 2:813613/2‑145 (MQ=255) tGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCTGGGCGTACAGCTCAGGGTCGCGCCGGCTGACGTGGAAg > 2:1739210/1‑150 (MQ=255) tGCGCGGCGGTCATGTCCGGCAAGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGGCCCCCAGTGCGAAGCCCAGGGCGTTGAACAGGGTGCGGTACTGGCCCTGCAAGTTCGAACGCTGGGCGTACAGCTCAGGGGCGCGCCGGCTGACGTgccac > 2:659539/1‑146 (MQ=255) gcgcGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCTGGGCGTACAGCTCAGGGTCGCGCCGGCTGACGTGGAAGc < 2:1780745/150‑1 (MQ=255) gcggcgGTCATGTCCGGCATGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTc < 1:418042/102‑1 (MQ=255) gcggcgGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTgg < 2:170603/96‑1 (MQ=255) gcggcgGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTgg > 1:170603/1‑96 (MQ=255) gcggcgGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTc > 2:418042/1‑102 (MQ=255) | GTACTTGTCCAGCAGCGAGGGCAGTTCGTCGCGACCGATGCTGCCACCGTCGAGCACGGCCATCGGGTCGCGGCCCTGGTCAGCAAGGTGCTCGACCAGGATGAAGGTGAACAGCGACAGGCGCTGCGCGGTCTTGTTGACCTGCGCGGCGGTCATGTCCGGCACGAAGTAGTAGAAACCACGGGTATCGCACACCAGTTCGAAGCCCAGGGCCTTGAACAGGGTGCGGTACTGGTCCTGGAAGTTCGACAGCTGGGCGTACAGCTCAGGGTCGCGCCGGCTGACGTGGAAGC > NC_002947/807683‑807975 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |