| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | 862709 = | 77 (0.910) | coding (759/906 nt) | yfcH | NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain‑containing protein | |||||
CCAGGTCGCCCTGATTGATTTTCTCTTGCAGCACAAGGATGCCAGCGGTCCTTATAATGCCTGCGCGCCGGAGCCTGTGCGCAACCGTGAGTTTGCCAGGCGACTGGGCCGCGCCCTGCATCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCACCTTCCGCTTCAACGATCTGCAATCGGCGCTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACA > NC_002947/862562‑862858 | ccAGGTCGCCCTGATTGATTTTCTCTTGCAGCACAAGGATGCCAGCGGTCCTTATAATGCCTGCGCGCCGGAGCCTGTGCGCAACCGTGAGTTTGCCAGGCGACTGGGCCGCGCCCTGCATCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCAtt > 2:210891/1‑150 (MQ=255) cAGGTCGCCCTGATTGATTTTCTCGTGCAGCACAAGGATGCCAGCGGTCCTTATAATGCCTGCGCTCCGGAGCCTGTGCGCAACCGTGAGTTTGCCAGGCGACTGGGCCGCGCCCTGCATCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATtg < 2:1572222/150‑1 (MQ=255) aGGTCGCCCTTATTGATTTTCTCTTGCAGCACAAGGATGCCAGCGGTCCTTATAATGCCTGCGCGCCGGAGCCTGTGCGCAACCGTGAGTTTGCCAGGCGACTGGGCCGCGCCCTGCATCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATtgc < 1:103911/150‑1 (MQ=255) gTCGCCCTGATTGATTTTCTCTTGCAGCACAAGGATGCCAGCGGTCCTTATAATGCCTGCGCGCCGGAGCCTGTGCGCAACCGTGAGTTTGCCAGGCGACTGGGCCGCGCCCTGCATCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATtgctg > 1:822078/1‑150 (MQ=255) ccTGATTGATTTTCTCTTGCAGCACAAGGATGCCAGCGGTCCTTATAATGCCTGCGCGCCGGAGCCTGTGCGCAACCGTGAGTTTGCCAGGCGACTGGGCCGCGCCCTGCATCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCaa > 1:1139715/1‑150 (MQ=255) tgattgatTTTCTCTTGCAGCACAAGGATGCCAGCGGTCCTTATAATGCCTGCGCGCCGGAGCCTGTGCGCAACCGTGAGTTTGCCAGGCGACTGGGCCGCGCCCTGCATCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAgg < 1:1100673/150‑1 (MQ=255) tgattTTCTCTTGCAGCACAAGGATGCCAGCGGTCCTTATAATGCCTGCGCGCCGGAGCCTGTGCGCAACCGTGAGTTTGCCAGGCGACTGGGCCGCGCCCTGCATCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCgg < 1:154583/150‑1 (MQ=255) gattTTCTCTTGCAGCACAAGGATGCCAGCGGTCCTTATAATGCCTGCGCGCCGGAGCCTGTGCGCAACCGTGAGTTTGCCAGGCGACTGGGCCGCGCCCTGCATCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCggg < 1:2385992/150‑1 (MQ=255) ttCTCTTGCAGCACAAGGATGCCAGCGGTCCTTATAATGCCTGCGCGCCGGAGCCTGTGCGCAACCGTGAGTTTGCCAGGCGACTGGGCCGCGCCCTGCATCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTg > 1:334289/1‑150 (MQ=255) tctcTTGCAGCACAAGGATGCCAGCGGTCCTTATAATGCCTGCGCGCCGGAGCCTGTGCGCAACCGTGAGTTTGCCAGGCGACTGGGCCGCGCCCTGCATCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCCGCTCAAGTCCGGGCTTgg < 2:1420040/150‑1 (MQ=255) ctctTGCAGCACAAGGATGCCAGCGGTCCTTATAATGCCTGCGCGCCGGAGCCTGTGCGCAACCGTGAGTTTGCCAGGCGACTGGGCCGCGCCCTGCATCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGc < 2:2180167/150‑1 (MQ=255) ctctTGCAGCACAAGGATGCCAGCGGTCCTTATAATGCCTGCGCGCCGGAGCCTGTGCGCAACCGTGAGTTTGCCAGGCGACTGGGCCGCGCCCTGCATCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGc > 1:598580/1‑150 (MQ=255) ctctTGCAGCACAAGGATGCCAGCGGTCCTTATAATGCCTGCGCGCCGGAGCCTGTGCGCAACCGTGAGTTTGCCAGGCGACTGGGCCGCGCCCTGCATCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGc > 1:1005917/1‑150 (MQ=255) 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cggCATCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCACCTTCCGCTTCAACGATCTGCAATCg > 1:1985655/3‑150 (MQ=255) agggcgcggccggcGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCACCTTCCGCTTCAACGATCTGCAATCg < 1:854074/144‑1 (MQ=255) gCATCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCACCTTc < 2:1367369/127‑1 (MQ=255) gCATCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCACGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCACCTTc > 1:1367369/1‑127 (MQ=255) aTCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCACCTTCCGCTTCAACGATCTGCAATCGgcgc < 1:1614315/150‑1 (MQ=255) aTCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCACCTTCCGCTTCAACGATCTGCAATCGgcgc < 2:822078/150‑1 (MQ=255) tCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCACCTTCCGCTTCAACGATCTGCAATCGGCGCt > 1:1081177/1‑150 (MQ=255) ggccggcGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGAGGGCGCGCCAAATACAATTACTGAACCA‑CGGCTTGACGTTCCCGGTCGAAGATGTGCAATCGGCGCTgg > 2:873635/1‑150 (MQ=255) gccggcactggcaacagcgccggcCTTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCACCTTCCGCTTCAACGATCTGCAATCGGCGCTGGa > 1:76883‑M2/25‑150 (MQ=255) CCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCACCTTCCGCTTCAACGATCTGCAATCGGCGCTGGAc < 1:234240‑M1/150‑1 (MQ=255) cggcactggcaacagcgccggcATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTtgc < 1:1162739‑M2/41‑1 (MQ=255) cggcactggcaacagcgccggcATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTtgc > 2:1162739‑M2/23‑63 (MQ=255) GCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCACCTTCCGCTTCAACGATCTGCAATCGGCGCTGGACAAc > 1:402671‑M1/1‑150 (MQ=255) gcTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCACCTTCCGCTTCAACGATCTGCAATCGGCGCTGGACAACCt < 2:234240/150‑1 (MQ=255) gTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCACCTTCCGCTTCAACGATCTGCAATCGGCGCTGGACAACCTGTc < 2:116745/150‑1 (MQ=255) ccAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCAcc > 1:1423668/1‑105 (MQ=255) ccAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCAcc < 2:1423668/105‑1 (MQ=255) ccAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCACCTTCCGCTTCAACGATCTGCAATCGGCGCTGGACAAc > 1:1048316/1‑141 (MQ=255) ccAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCACCTTCCGCTTCAACGATCTGCAATCGGCGCTGGACAAc < 2:1048316/141‑1 (MQ=255) cAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGACCCACAGC‑GCAAGTTCTGCTTCAACGATCTTCAATCGGCGCTGGACAACCTGTCCAGTc > 2:64479/1‑150 (MQ=255) aTTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCACCTTCCGCTTCAACGATCTGCAATCGGCGCTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACa > 2:1694600/1‑150 (MQ=255) | CCAGGTCGCCCTGATTGATTTTCTCTTGCAGCACAAGGATGCCAGCGGTCCTTATAATGCCTGCGCGCCGGAGCCTGTGCGCAACCGTGAGTTTGCCAGGCGACTGGGCCGCGCCCTGCATCGGCCGGCGCTGTTGCCAGTGCCGGCATTGCTGCTCAAGGCCGGGCTTGGCGAGATGTCCACCTTGCTGCTGGGAGGCCAGCGGGCGCGCCCGGTACGCTTGCTGGAAGC‑CGGCTTCACCTTCCGCTTCAACGATCTGCAATCGGCGCTGGACAACCTGTCCAGTCGCCTCTGACA > NC_002947/862562‑862858 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |