New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1086483 = | 74 (0.840) | 4 (0.050) | 4/240 | NT | 5.1% | intergenic (+9/+49) | tldD/PP_0941 | microcin B17 maturation protease/ribosome associated protein |
? | NC_002947 | 1086526 = | 76 (0.880) | intergenic (+52/+6) | tldD/PP_0941 | microcin B17 maturation protease/ribosome associated protein |
TAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGG > NC_002947/1086377‑1086673 | tAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCa < 2:784016/150‑1 (MQ=255) tAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCa < 2:1637921/150‑1 (MQ=255) ggAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGt < 1:2063659/150‑1 (MQ=255) aaCGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCTGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATCCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTcc < 2:462735/150‑1 (MQ=255) gcacgagaaggcgcgaaacaagccgcctgccgccgcgcgcaaggtgttcaagtacatccgcgacctcgacgagttgcagcgcgggttgcgctgacggactGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCa > 2:169124‑M1/101‑144 (MQ=255) gcacgagaaggcgcgaaacaagccgcctgccgccgcgcgcaaggtgttcaagtacatccgcgacctcgacgagttgcagcgcgggttgcgctgacggactGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCa < 1:169124‑M1/44‑1 (MQ=255) tGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCa < 2:424133/150‑1 (MQ=255) ggACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAAcc > 2:959168/1‑150 (MQ=255) gACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAAccc > 2:464871/1‑150 (MQ=255) aGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGc > 1:185686/1‑150 (MQ=255) tCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCaa > 1:1566206/1‑150 (MQ=255) ccGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCa > 2:2019279/1‑126 (MQ=255) ccGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCa < 1:2019279/126‑1 (MQ=255) ggTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGa < 2:185686/150‑1 (MQ=255) gTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGCAGGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTcgcg > 1:1138905/1‑150 (MQ=255) gCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGt > 2:419406/1‑150 (MQ=255) ccTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACtt < 1:345720/150‑1 (MQ=255) ccTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACtt < 2:1702568/150‑1 (MQ=255) tACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACtt < 2:1003178/148‑1 (MQ=255) tACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACtt > 1:1003178/1‑148 (MQ=255) tACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGa > 2:1861275/1‑150 (MQ=255) aCCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGaa < 1:345579/150‑1 (MQ=255) cTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGt > 2:2026135/1‑97 (MQ=255) cTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGt < 1:2026135/97‑1 (MQ=255) ttGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGa < 1:2396264/137‑1 (MQ=255) ttGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGa > 2:2396264/1‑137 (MQ=255) ttGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTAGCGGATGTACTTGAacac > 1:1007139/1‑150 (MQ=255) aaaCTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCtt < 1:251624/150‑1 (MQ=255) aaCTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTg < 1:1861275/150‑1 (MQ=255) cTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTgcg > 1:251862/1‑150 (MQ=255) tGGGTGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCATCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTgcgc > 1:1070959/1‑150 (MQ=255) aTGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGcgcgcg > 2:2023074/1‑150 (MQ=255) tGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAgc > 1:2371498/1‑93 (MQ=255) tGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAgc < 2:2371498/93‑1 (MQ=255) aTTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCggcggc > 2:2374686/1‑150 (MQ=255) ttACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGaa > 1:1826145/1‑131 (MQ=255) 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tGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAggcggc < 1:167926/150‑1 (MQ=255) gCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTg > 1:60284/1‑150 (MQ=255) ggTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTg < 2:959752/127‑1 (MQ=255) ggTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTg > 1:959752/1‑127 (MQ=255) tACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGCCCCTTGCAGGAGCGGGGACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCTACAGCTCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTc < 1:419406/150‑1 (MQ=255) tACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGGGCCGGGAGGCTTCTTGTTTc > 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2:1070224/1‑148 (MQ=255) aCGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAgct > 1:9088/1‑150 (MQ=255) gTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAgctgc < 2:2301098/150‑1 (MQ=255) cGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGTCTCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTgg < 1:1033855/150‑1 (MQ=255) gCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTa < 2:2063768/141‑1 (MQ=255) gCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTa > 1:2063768/1‑141 (MQ=255) ccACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGACCACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGTCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGCcggtc > 2:960365/1‑150 (MQ=255) ccACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCagcgagc < 2:1990581/134‑1 (MQ=255) ccACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCagcgagc > 1:1990581/1‑134 (MQ=255) cacaGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCAGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGcggtcg > 2:194840/1‑150 (MQ=255) acaGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGa < 2:799603/54‑1 (MQ=255) acaGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGa > 1:799603/1‑54 (MQ=255) acaGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGcggtcgg > 1:1391432/1‑150 (MQ=255) caGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGcggtcggt > 1:1212326/1‑150 (MQ=255) aGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGgtg > 2:2123873/1‑150 (MQ=255) ccccAGTCCGTCAGTGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCgg < 2:2346145/150‑1 (MQ=255) ccccAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCgg > 2:1488280/1‑150 (MQ=255) ccAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCgggg < 2:9088‑M2/148‑1 (MQ=255) aGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGcggtcg < 2:1594649/139‑1 (MQ=255) aGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGcggtcg > 1:1594649/1‑139 (MQ=255) | TAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCACAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAGCTGCTGGCGGTCGGTGTCGGGG > NC_002947/1086377‑1086673 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |