New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3951494 = | 70 (0.790) | 7 (0.080) | 6/232 | NT | 9.9% | coding (447/666 nt) | PP_3487 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3951537 = | 62 (0.740) | coding (404/666 nt) | PP_3487 | hypothetical protein |
TGCGTCGAATGCTGCTCGGGACTCGGCAGGAACTGCCCTATACGGCCAAGCACCAGGTCGACATTGGCCTTGTCGCCGGTCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGACACGAAGGTCACCTGGGCGGCCAGCGCTGGCCCCATGGCCTCGCGCACCTCGCGCAGCTTGCGGGTGATCAACGGGCAGGCATCGGTGCAATGGGTGAAGATCACGTTGAGCATCACCACCTTG > NC_002947/3951390‑3951686 | ggcccgttgagcacccgcaagctgcgcgaggtgcccgaggccatggggccagcgctggccgcccaggtgaccttcgtgtcgatcagcagtgacccgctgaacgaCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCg > 1:1941926‑M1/105‑150 (MQ=255) tCGAATGCTGCTCGGGACTCGGCAGGAACTGCCCTATACGGCCAAGCACCAGGTCGACATTGGCCTTGTCGCCGGTCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTc > 1:2239678/1‑149 (MQ=255) tCGAATGCTGCTCGGGACTCGGCAGGAACTGCCCTATACGGCCAAGCACCAGGTCGACATTGGCCTTGTCGCCGGTCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTc < 2:2239678/149‑1 (MQ=255) cgttgatcacccgcaagctgcgcgaggtgcgcgaggccatggggccagcgctggccgcccaggtgaccttcgtgtcgatcagcagttacccgctgaacgaCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCa > 1:970902‑M1/101‑150 (MQ=255) aaTGCTGCTCGGGACTCGGCAGGAACTGCCCTATACGGCCAAGCACCAGGTCGACATTGGCCTTGTCGCCGGTCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCg < 1:1920816/150‑1 (MQ=255) gatcacccgcaagctgcgcgaggtgcgcgaggccatggggccagcgctggccgcccaggtgaccttcgtgtcgatcagcagtgacccgctgaacgaCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTc > 1:554455‑M1/97‑141 (MQ=255) gatcacccgcaagctgcgcgaggtgcgcgaggccatggggccagcgctggccgcccaggtgaccttcgtgtcgatcagcagtgacccgctgaacgaCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTc < 2:554455‑M1/45‑1 (MQ=255) gctCGGGACTCGGCAGGAACTGCCCTATACGGCCAAGCACCAGGTCGACATAGGCCTTGTCGCCGGTCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCAc > 2:1790848/1‑150 (MQ=255) ggACTCGGCAGGAACTGCCCTATACGGCCAAGCACCAGGTCGACATTGGCCTTGTCGCCGGTCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTTAGCACCTCGCGGGTGCAGTTCAGCGGGTCAgtgcta > 1:505169/1‑149 (MQ=255) tCGGCAGGAACTGCCCTATACGGCCAAGCACCAGGTCGACATTGGCCTTGTCGCCGGTCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCg > 2:1055670/1‑150 (MQ=255) tCGGCAGGAACTGCCCTATACGGCCAAGCACCAGGTCGACATTGGCCTTGTCGCCGGTCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCg > 2:1546770/1‑150 (MQ=255) cGGCAGGAACTGCTCTATACTGCCAAGCACCAGGTCGACATTGGCCTTGTCGCCGGTCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCACAACTTGGCGGCGAAAGGCTGTTGCTGCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGa < 2:84822/150‑1 (MQ=255) cGGCAGGAACTGCCCTATACGGCCAAGCACCAGGTCGACATTGGCCTTGTCGCCGGTCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGa < 2:940867/150‑1 (MQ=255) ggAACTGCCCTATACGGCCAAGCACCAGGTCGACATTGGCCTTGTCGCCGGTCAGGAACAGCCAGTTAGGCCGATACACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGACACGa > 2:2375034/1‑150 (MQ=255) agcTGCCCTATACGGCCAAGCACCAGGTCGACATTGGCCTTGTCGCCGGTCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGGACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGACACGAAg < 2:1675162/148‑1 (MQ=255) actacgcTATACAGCCAAGCACCACATCGACATCAGCCTTGTCGCCGGTCAGGAACATTCACTTTCGCCCATCCACCCCCTGTTTGGCGTCAAGCTCCTGCTGTCCCTCTTGGCGGTCTCGCAGCGGCTCACTGCTGATCGACACGAAgg < 2:505169/144‑1 (MQ=255) tataCGGCCAAGCACCAGGTCGACATTGGCCTTGTCGCCGGTCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTTGGGGGTGGCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGACACGAAGGGCACCTg > 1:1351608/1‑150 (MQ=255) tataCGGCCAAGCACCAGGTCGACATTGGCCTTGTCGCCGGTCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGACACGAAGGTCACCTg > 2:958254/1‑150 (MQ=255) 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1:1598046/150‑1 (MQ=255) gTCGCCGGTCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGACACGAAGGTCACCTGGGCGGCCAGCGCTGGCCCCATGGcctcgcgcac < 1:1546770/150‑1 (MQ=255) gCCGGTCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGACACGAAGGTCACCTGGGCGGCCAGCGCTGGCCCCATGGcctcgcgcacctc > 2:1417836/1‑150 (MQ=255) gCCGGTCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGACACGAAGGTCACCTGGGCGGCCAGCGCTGGCCCCATGGcctcgcgcacctc > 2:11919/1‑150 (MQ=255) tCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGACACGAAGGTCACCTGGGCGGCCAGCGCTGGCGCCATGGcctcgcgcacctcgcgca > 2:255184/1‑150 (MQ=255) tCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGACACGAAGGTCACCTGGGCGGCCAGCGCTGGCCCCATGGcctcgcgcacctcgcgca < 2:1174430/150‑1 (MQ=255) 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ccAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGACACGAAGGTCACCTGGGCGGCCAGCGCTGGCCCCATGGCCTCGCGCACCTCGCGCAGCTTGCGGGt > 2:678701/1‑150 (MQ=255) aGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGACACGAAGGTCACCTGGGCGGCCAGCGCTGGCCCCATGGCCTCGCGCACCTCGCGCAGCTTGCGGGTGa < 1:258233/150‑1 (MQ=255) gTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGaca > 1:2343171/1‑83 (MQ=255) gTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGaca < 2:2343171/83‑1 (MQ=255) ttCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGACACGAAGGTCACCTGGGCGGCCAGCGCTGGCCCCATGGCCTCGCGCACCTCGCGCAGCTTGCGGGTGATc < 1:1459330/150‑1 (MQ=255) tgaacgacacccccgaggcgctgaaggcgttcgccgccaagcagggggtgTCGTTCAGCGGGTAACTGCTGATCGACACGAAGGTCACCTGGGCGGCCAGCGCTGGCCCCATGGCCTCGCGCACCTCGCGCAGCTTGCGGGTGATCAACg > 1:970902‑M2/51‑150 (MQ=255) 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gTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGACACGAAGGTCACCTGGGCGGCCAGCGCTGGCCCCATGGCCTCGCGCACCTCGCGCAGCTTGCGGGTGATCAACGGGCAGGCATCGGTGCAATGGGTGAAGATCACGTTGAGCATCACCACCtt < 2:1182123‑M2/149‑1 (MQ=255) tCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGACACGAAGGTCACCTGGGCGGCCAGCGCTGGCCCCATGGCCTCGCGCACCTCGCGCAGCTTGCGGGTGATCAACGGGCAGGCATCGGTGCAATGGGTGAAGATCACGTTGAGCATCACCACCTTg > 1:602090/1‑150 (MQ=255) | TGCGTCGAATGCTGCTCGGGACTCGGCAGGAACTGCCCTATACGGCCAAGCACCAGGTCGACATTGGCCTTGTCGCCGGTCAGGAACAGCCAGTTCGGCCCATCCACCCCCTGCTTGGCGGCGAACGCCTTCAGCGCCTCGGGGGTGTCGTTCAGCGGGTCACTGCTGATCGACACGAAGGTCACCTGGGCGGCCAGCGCTGGCCCCATGGCCTCGCGCACCTCGCGCAGCTTGCGGGTGATCAACGGGCAGGCATCGGTGCAATGGGTGAAGATCACGTTGAGCATCACCACCTTG > NC_002947/3951390‑3951686 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
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