New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4012772 | 71 (0.800) | 4 (0.050) | 4/232 | NT | 5.0% | coding (564/900 nt) | mvaB | hydroxymethylglutaryl‑CoA lyase |
? | NC_002947 | = 4012789 | 84 (1.010) | coding (581/900 nt) | mvaB | hydroxymethylglutaryl‑CoA lyase |
GTGCTTGGCTGCCCTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCGGTAGCCGGGCTGGGCGGCTGCCCTTAC > NC_002947/4012641‑4012934 | gtgCTTGGCTGCCCTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTg > 2:1836401‑M2/1‑149 (MQ=255) gCTTGGCTGCCCTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGCAGGCCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCAAACCGTCCGCCACCGTAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTggt < 1:1142049‑M2/150‑4 (MQ=255) gCCCTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGccc < 1:2209508/150‑1 (MQ=255) cccTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCa > 2:2092582/1‑150 (MQ=255) cGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTAcc < 2:540970/150‑1 (MQ=255) gAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACcg > 2:836227/1‑150 (MQ=255) ggCAAGGTCAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTg > 1:2303690‑M2/1‑128 (MQ=255) ggCAAGGTCAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTg < 2:2303690‑M2/129‑2 (MQ=255) ggCAAGGTCAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACcgcgc < 1:1014903/150‑1 (MQ=255) ggCAAGGTCAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGAGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCAAAACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACcgcgc > 1:772707/1‑150 (MQ=255) cAAGGTCAGCGCCGAGCTGGTGGCCCAGGTGGACGGCGTGGTGCACTACATGGGCGGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGa < 2:634021/150‑1 (MQ=255) aaGGTCAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAg > 1:866240/1‑150 (MQ=255) tCAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGt > 1:789953/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGTGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGtt < 2:2324275/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGtt < 2:1065559/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGtt < 2:1829165/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGtt < 1:836227/150‑1 (MQ=255) cAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGtt < 2:1514700/150‑1 (MQ=255) aGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTg > 2:489551/1‑150 (MQ=255) gcgcCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTgg < 2:1097093/150‑1 (MQ=255) gcCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGcc < 2:866240/150‑1 (MQ=255) ccGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCg < 1:1767012/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACtt < 2:2129720/150‑1 (MQ=255) gTGGCCCCGGTGGCGCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGGACCGGTACCGCATGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTTGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTc < 2:923092/150‑1 (MQ=255) cccGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGa > 1:819809/1‑150 (MQ=255) cccGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGa < 2:910017/150‑1 (MQ=255) cccGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACAGCACGCGACACCCGACGCCTGTCTTCGAGCAG‑‑ATCGGCCGAGGCACCGCGGGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGa > 1:1142693/1‑150 (MQ=255) cGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGaca < 2:248830/150‑1 (MQ=255) ggTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGacac > 2:525401/1‑150 (MQ=255) ggCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTa < 1:2092582/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTg < 1:2145532‑M2/94‑2 (MQ=255) ccGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTg > 2:2145532‑M2/1‑93 (MQ=255) ccGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACgg > 1:915020/1‑150 (MQ=255) ccGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACgg > 1:689742/1‑150 (MQ=255) tGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCg < 1:1286530/120‑1 (MQ=255) tGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCg > 2:1286530/1‑120 (MQ=255) gCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAg > 2:2377089/1‑109 (MQ=255) gCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAg < 1:2377089/109‑1 (MQ=255) gCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCtt < 2:689742/150‑1 (MQ=255) cACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTg > 1:203039/1‑150 (MQ=255) cACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTg < 1:869853/150‑1 (MQ=255) aTGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAAc < 2:2110840/150‑1 (MQ=255) ggCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTc < 2:789953/150‑1 (MQ=255) gctgctACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTAGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCt > 1:263189/1‑150 (MQ=255) tgctACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTAt < 1:1074310/150‑1 (MQ=255) 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tctcGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGc < 2:886135/150‑1 (MQ=255) tcGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTc > 2:2013469/1‑150 (MQ=255) gCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTcc > 2:1229534/1‑101 (MQ=255) gCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTcc < 1:1229534/101‑1 (MQ=255) tGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGc > 2:2290812/1‑136 (MQ=255) tGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGc < 1:2290812/136‑1 (MQ=255) 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< 2:1460786/150‑1 (MQ=255) aCCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGAc < 2:203039/150‑1 (MQ=255) gTACCGCAGGCGACACCAGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCt > 2:1420521/1‑150 (MQ=255) cGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCgg < 2:808112/149‑1 (MQ=255) cGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCgg > 1:808112/1‑149 (MQ=255) cGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCGGt > 1:865124/1‑150 (MQ=255) 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cGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCGGTAGCCgg < 2:865124/150‑1 (MQ=255) gACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTggtgtcgcctgcggtaccggtgccgatggtgtcacccagcgagacctcgtagcagcccatgtc > 1:190363‑M2/1‑23 (MQ=255) gACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTggtgtcgcctgcggtaccggtgccgatggtgtcacccagcgagacctcgtagcagcccatgtc < 2:190363‑M2/86‑64 (MQ=255) ccGACGCGTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTTGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTAGTCGACAGCTCGGTAGCCGGGCTggg < 2:784732/150‑1 (MQ=255) ccGACGCCTG‑‑TTCGAGGTggtgtcgcctgcggtaccggtgccgatggtgtcacccagcgagacctcgtagcagccca > 2:980372‑M2/1‑18 (MQ=255) ccGACGCCTG‑‑TTCGAGGTggtgtcgcctgcggtaccggtgccgatggtgtcacccagcgagacctcgtagcagccca < 1:980372‑M2/77‑60 (MQ=255) ccGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCGGTAGCCgcgtgggg > 1:2307429/1‑143 (MQ=255) ccGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCGGTAGCCGGGCTggg > 1:1432197/1‑150 (MQ=255) ccGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCCCggctaccg < 1:315224/143‑7 (MQ=255) ccGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCCCggctaccg > 2:315224/1‑137 (MQ=255) cGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGc > 1:1051188/1‑106 (MQ=255) cGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGc < 2:1051188/106‑1 (MQ=255) cGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCGGTAGcc < 2:259175/141‑1 (MQ=255) cGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCGGTAGcc > 1:259175/1‑141 (MQ=255) cGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCGGTAGCCGGGCTGggc > 1:1714831/1‑150 (MQ=255) cGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCGGTAGCCGGGCTGggcggc < 1:489551/150‑1 (MQ=255) gCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGaca > 2:901826/1‑63 (MQ=255) gCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGaca < 1:901826/63‑1 (MQ=255) cTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCGGTAGCCGGGCTGGGCGGCTGc > 2:777005/1‑150 (MQ=255) cTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCGGTAGCCGGGCTGGGCGGCTGc > 2:1125264/1‑150 (MQ=255) tG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCGGTAGCCGGGCTGGGCGGCTGcc < 1:2295293/150‑1 (MQ=255) g‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCGGTAGCCGGGCTGGGCGGCTGccc < 2:1142693/150‑1 (MQ=255) gAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCGGTAGCCGGGCTGGGCGGCTGCCCTTAc > 2:1111333/1‑150 (MQ=255) | GTGCTTGGCTGCCCTTACGAGGGCAAGGTCAGCGCCGAGCAGGTGGCCCCGGTGGCCCGCGCCCTGCACGACATGGGCTGCTACGAGGTCTCGCTGGGTGACACCATCGGCACCGGTACCGCAGGCGACACCCGACGCCTG‑‑TTCGAGGTGGTGTCGGCCCAGGTACCGCGCGAGCAGTTGGCCGGACACTTCCATGACACTTACGGCCAGGCCTTGGCTAACGTCTATGCCAGCCTGCTCGAGGGCATCAGCGTATTCGACAGCTCGGTAGCCGGGCTGGGCGGCTGCCCTTAC > NC_002947/4012641‑4012934 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |