| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5211498 | 68 (0.770) | 6 (0.070) | 6/234 | NT | 7.9% | coding (500/1638 nt) | PP_4592 | metal dependent hydrolase |
| ? | NC_002947 | = 5211513 | 76 (0.900) | coding (485/1638 nt) | PP_4592 | metal dependent hydrolase | |||||
GAGGCCGTACCGACACGTTCGTCGACATAACCAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTCCACAGCAGCACCGATGGCAGCACACCCAGCAGCAGGATATACGCGGCAAACTTGAACGACATCAAGTCG > NC_002947/5211375‑5211662 | gAGGCCGTACCGACACGTTCGTCGACATAACCAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGGCGATGGTCACcaca < 2:1234810/150‑1 (MQ=255) aGGCCGTACCGACACGTTCGTCGACATAACCAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACcacac > 1:1762157/1‑150 (MQ=255) tACCGACACGTTCGTCGACATAACCAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGcac > 1:1615647/1‑150 (MQ=255) cGACACGTTCGTCGACATAACCAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGCTGGTCACCACACCGGcaccac > 2:428751/1‑150 (MQ=255) acacGTTCGTCGACATAACCAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTg < 1:785120/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCGACATAACCAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGAtggt > 2:2097038‑M2/1‑123 (MQ=255) gTTCGTCGACATAACCAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGAtggt < 1:2097038‑M2/127‑5 (MQ=255) gTTCGTCGACATAACCAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGac < 1:630946/148‑1 (MQ=255) gTTCGTCGACATAACCAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGac > 2:630946/1‑148 (MQ=255) ttCGTCGACATAACCAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGCAACCGCTACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGaccac < 1:779855/150‑1 (MQ=255) ttCGTCGACATAACCAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGaccac < 2:1412473/150‑1 (MQ=255) gtcgtccAGATAACCAATGGAAGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGTCCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGaccac < 1:1010282/149‑1 (MQ=255) tcgACATAACCAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAAc > 2:2073341/1‑150 (MQ=255) aCATAACCAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTa > 1:1768121/1‑150 (MQ=255) aaCCAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTAATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTTACGACCAACTTACCca > 1:1101802/1‑150 (MQ=255) aCCAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCcag < 1:1666719/150‑1 (MQ=255) aCCAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCcag > 2:1666719/1‑150 (MQ=255) ccAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCTACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCcagc > 1:1064755/1‑150 (MQ=255) ccAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCcagc > 2:162644/1‑150 (MQ=255) ccAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCAGGGTGATGGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCcagc > 2:147061/1‑150 (MQ=255) aTGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCagcagc > 2:1264774/1‑150 (MQ=255) ggAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTcacca < 1:725682/113‑1 (MQ=255) ggAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTcacca > 2:725682/1‑113 (MQ=255) aGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTAcc > 2:2387273/1‑139 (MQ=255) aGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTAcc < 1:2387273/139‑1 (MQ=255) ggCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTcgcg < 2:1768121/150‑1 (MQ=255) ccGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCaa < 2:1328526/128‑1 (MQ=255) ccGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCaa > 1:1328526/1‑128 (MQ=255) ccGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAACGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTAcc > 2:954983/1‑134 (MQ=255) ccGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAACGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTAcc < 1:954983/134‑1 (MQ=255) gaTATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGAtg < 2:1816394‑M2/94‑3 (MQ=255) gaTATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGAtg > 1:1816394‑M2/1‑92 (MQ=255) agtGCGGGGGGTCAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCg < 2:1101802/148‑1 (MQ=255) cTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAg < 1:713188/150‑1 (MQ=255) tGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAgg > 1:1856842/1‑150 (MQ=255) gTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTAcc < 1:1849713/116‑1 (MQ=255) gTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTAcc > 2:1849713/1‑116 (MQ=255) cATCAGACGCAGTACCGGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTgcgc > 2:1899270/1‑150 (MQ=255) gACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTcc > 2:711423/1‑150 (MQ=255) aCGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCATCca > 1:2025766/1‑150 (MQ=255) cGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTCcac < 2:1409118/150‑1 (MQ=255) tCATGGGGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCATCGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTCCACagcagc < 1:428751/150‑1 (MQ=255) 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cgacgaCAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTCCACAGCAGCACCGATGGCAGCACACCcag < 2:351572/150‑1 (MQ=255) tcgtttgCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTCCACAGCAGCACCGATGGCAGCACACCcagca < 1:1569579/144‑1 (MQ=255) gacAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTCCACAGCAGCACCGATGGCAGCACACCcagcagc < 2:988990/150‑1 (MQ=255) acAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTCCACAGCAGCACCGATGGCAGCACACCcagcagca > 1:1543082/1‑150 (MQ=255) cAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTCCACAGCAGCACCGATGGCAGCACACCcagcagcag < 1:147061/150‑1 (MQ=255) 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aaCGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTCCACAGCAGCACCGATGGCAGCACACCCAGCAGCAGGATATACGCGGCAAACTTg > 2:2155069/1‑150 (MQ=255) aaCGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTCCACAGCAGCACCGATGGCAGCACACCCAGCAGCAGGATATACGCGGCAAACTTg > 2:780148/1‑150 (MQ=255) gACCGAGGCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTCCACAGCAGCACCGATGGCAGCACACCCAGCAGCAGGATATACGCGGCAAACTTGAACGa > 2:2211288/1‑150 (MQ=255) gACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTCCACAGCAGCACCGATGGCAGCACACCCAGCAGCAGGATATACGCGGCAAACtt < 1:2119665/144‑1 (MQ=255) gACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTCCACAGCAGCACCGATGGCAGCACACCCAGCAGCAGGATATACGCGGCAAACtt > 2:2119665/1‑144 (MQ=255) aCCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTCCACAGCAGCACCGATGGCAGCACACCCAGCAGCAGGATATACGCGGCAAACTTGAACGAc > 2:525863/1‑150 (MQ=255) gAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTCCACAGCAGCACCGATGGCAGCACACCCAGCAGCAGGATATACGCGGCAAACTTGAACGACATc < 1:711423/150‑1 (MQ=255) gCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCTGTAGGCGATCTGCGCCTTCCACAGCAGCACCGATGGCAGCACACCCAGCAGCAGGATATACGCGGCAAACTTGAACGACATCaa < 1:318120/150‑1 (MQ=255) aTGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTCCACAGCAGCACCGATGGCAGCACACCCAGCAGCAGGATATACGCGGCAAACTTGAACGACATCAAGTcg > 1:341210/1‑150 (MQ=255) aTGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTCCACAGCAGCACCGATGGCAGCACACCCAGCAGCAGGATATACGCGGCAAACTTGAACGACATCAAGTcg > 1:299898/1‑150 (MQ=255) | GAGGCCGTACCGACACGTTCGTCGACATAACCAATGGAGGCCCCGACGATATTGCTGGGGGTGAGCATCAGACGCAGTTCATGGTGATTGCGAAACAGCGACGACAGCCCTTGATAATTGACCAACGCGACCGAGCCGATGGTCACCACACAGGCACCACTGACCACCAACTTACCCAGCAGCTCGCGGTGCCACGGGCGGTAGGCGATCTGCGCCTTCCACAGCAGCACCGATGGCAGCACACCCAGCAGCAGGATATACGCGGCAAACTTGAACGACATCAAGTCG > NC_002947/5211375‑5211662 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |