New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6019326 | 88 (0.990) | 8 (0.110) | 7/200 | NT | 9.7% | intergenic (‑71/+74) | dadX/dadA‑II | alanine racemase/D‑amino acid:quinone oxidoreductase |
? | NC_002947 | = 6019356 | 78 (1.090) | intergenic (‑101/+44) | dadX/dadA‑II | alanine racemase/D‑amino acid:quinone oxidoreductase |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
TTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGATATCCAGGCCTTCGGCACTGATCTGCGGCTTCTT > NC_002947/6019209‑6019501 | ttGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcc < 2:248671‑M2/150‑3 (MQ=255) atgtggCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGGTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcc < 2:1649905‑M2/149‑3 (MQ=255) gcgcAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgg > 1:800358‑M2/1‑143 (MQ=255) gcgcAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgg > 1:1669638‑M2/1‑143 (MQ=255) aGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagc > 2:47168‑M2/1‑139 (MQ=255) gggCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcg < 2:2117807‑M2/150‑13 (MQ=255) tGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcgggcaa < 2:1428046‑M2/150‑18 (MQ=255) gTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcgggcaa < 2:2123844‑M2/145‑18 (MQ=255) gTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcgggcaa > 1:2123844‑M2/1‑128 (MQ=255) cGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCa < 1:1649905/150‑1 (MQ=255) gATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCGCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGAGCAAGGCCGCaa > 2:369520/1‑150 (MQ=255) tCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGGCCGCCCCTACGGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTTTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAAt < 2:200059/150‑1 (MQ=255) gggCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATggg > 2:76252/1‑150 (MQ=255) ggCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGc > 1:361802/1‑150 (MQ=255) ggcgggACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGcac > 1:916024/1‑150 (MQ=255) gcgggACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTTGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGcaca < 1:1603385/150‑1 (MQ=255) gggACGCATTGCGGTTGTCTTATGGGGTTTCGCCTTAAAATCGGTGGTGGTTTATTCCCGCGCTTGCCCGCTCCCACAGCTCGTGAACAGCTTTCAAAAGCGGTGCTGTTCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCAAATGGGCCGGCACAgg < 1:615529/150‑1 (MQ=255) ggACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCCTGCACAGCTTTCAAAACCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAACCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGc > 1:648481/1‑150 (MQ=255) aTAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAAt < 1:1896964/130‑1 (MQ=255) aTAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAAt > 2:1896964/1‑130 (MQ=255) aTAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTAc < 1:1712756/150‑1 (MQ=255) tAGCGGCTGCCTGATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTAct > 1:1780886/1‑150 (MQ=255) gCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcgg > 2:1210057‑M2/1‑100 (MQ=255) gCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcgg < 1:1210057‑M2/113‑14 (MQ=255) gCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgt > 2:1650211‑M2/1‑100 (MQ=255) gCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTTAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGGCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTgg > 1:850644/1‑150 (MQ=255) tGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTgggg > 1:1755737/1‑148 (MQ=255) ccTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAgg > 1:1970745/1‑133 (MQ=255) ccTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAgg < 2:1970745/133‑1 (MQ=255) aTGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcgggcaa > 1:1846199‑M2/1‑89 (MQ=255) aTGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcgggcaa < 2:1846199‑M2/106‑18 (MQ=255) ggtggtTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTg < 1:1349596/130‑1 (MQ=255) gtggtTCGGGTTGCAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGGCTGCGCCGTCTGGTGGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGGGTTCCTGGGGGCGCGGGCAGGCCCGCAAATGGGCCGGCACGTGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGgggc > 2:340832/1‑150 (MQ=255) ggtTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATGCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGgcgcgc < 1:2084381/150‑1 (MQ=255) ttCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcgg < 1:774919‑M2/95‑14 (MQ=255) ttCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcgg > 2:774919‑M2/1‑82 (MQ=255) tCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTAAAAAGCGGTTGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCttt < 2:106031/150‑1 (MQ=255) gggTTGAACTCGGTGGGGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCGCACGGGTCGTGCACGGCTTTCAAAAGGGGTGGTGTTCCTGTGGGGGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGc < 2:648481/150‑1 (MQ=39) ggTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggag > 2:1359546‑M2/1‑78 (MQ=255) ggTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggag < 1:1359546‑M2/88‑11 (MQ=255) gTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGccc > 1:2144476/1‑150 (MQ=255) gTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGccc < 1:76252/150‑1 (MQ=255) gTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGccc > 2:351962/1‑150 (MQ=255) tcaaaTCGGTGGTGGCTTACCCGGGGGCTTGCCCGCTCCCTCAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCTTGTGGGAGGGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGt < 2:183350/148‑1 (MQ=255) tGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGt < 1:2274625/150‑1 (MQ=255) tCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGt < 1:742835/114‑1 (MQ=255) ggtggATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTGTGCCCGTGCTTGGCCAc > 1:1929929/1‑150 (MQ=255) tggATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcgggcaa < 1:367538‑M2/80‑18 (MQ=255) tggATTATTCGCGGGCCTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGGTcctgcgggagcgggcaacgaatcaaataagacaccaccgatttcaacccgaaacaccataaggcagccgctattcgtcccgcccgcc < 2:2256963‑M2/150‑88 (MQ=255) ggATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGc > 2:2002490/1‑139 (MQ=255) ggATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGc < 1:2002490/139‑1 (MQ=255) gATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCACAAGCGGGGGGGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCAGACGCGGATACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGGCACTTcc > 1:2244045/1‑150 (MQ=38) gATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTcc > 2:1983582/1‑150 (MQ=255) gATTATTCGCGGGCTTGCCCGCCCCCCCAGGTCGGGCACAGCTTTCAAAAGCGGCGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCCAATGGGCCCGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCGTTGCCCGTGCTGTGCCACTTcc > 2:1484190/1‑150 (MQ=37) tattCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCgg < 2:1194316/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCt > 1:1656969/1‑150 (MQ=255) ggagcgGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGt < 2:1123482/97‑1 (MQ=37) gcgGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcgggcaagc > 2:1480984‑M2/1‑53 (MQ=255) gggcgggCCCTCTACCACAGGCGGGGCACAGCGTGCAAGAGCGGTGGGGGTCCTGTTGGAGCGGGCGCGCCCGCAAATGGGCCCGCACAGGCTTTTTCTGCTGGCTAGTCGCCGCGCTTTTCCCCTGCTTGCCCACTTCCCGGCTATTGc < 2:795731/144‑1 (MQ=255) gggCTTGCCCGCTCCCACAGGTGGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGc < 1:1049180/150‑1 (MQ=255) ggCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGcc < 2:361802/150‑1 (MQ=255) ggCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGcc > 1:538473/1‑150 (MQ=255) gCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTActg < 2:1215468/98‑1 (MQ=255) gCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTActg > 1:1215468/1‑98 (MQ=255) cTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGGTTTGCCCGTGCTTGGGCACTTCCCGGCTATTGCCAt > 1:620831/1‑150 (MQ=255) cTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCAt < 1:351962/150‑1 (MQ=255) cTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCAt > 1:601511/1‑150 (MQ=255) ttGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATa > 1:623524/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACg > 2:1407561/1‑150 (MQ=255) cGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGc > 1:2305974/1‑119 (MQ=255) gCTCCCACAGGTCGTGTACTGCTTGCAGATGCGGTGTTGTTCCTGTGGGTGCGGGCAGGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGga < 1:1484190/150‑1 (MQ=255) gCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcgggcaagcccgcgaataatccaccaccgatttcaacccgaaccaccataaggcagccgctatgcgtcccgcccgcgccctgatcgacctccagg > 1:1164227‑M2/1‑41 (MQ=255) gCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGga < 2:538473/150‑1 (MQ=255) tCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGgaga < 2:601511/150‑1 (MQ=255) tCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGgaga > 2:2148694/1‑150 (MQ=255) cccACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGat < 1:2148694/150‑1 (MQ=255) ccACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAACTGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGata > 2:1178149/1‑150 (MQ=255) cacaGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcgggcaagcccgcgaataatccaccaccgatttcaacccgaaccaccataatgcagccgctatgcgtcccgcccgcgccctgatcgacctccaggccctgcgcc < 1:1472866‑M2/150‑115 (MQ=255) cacaGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcgggcaagcccgcgaataatccaccaccgatttcaacccgaaccaccataaggcagccgctatgcgtcccgcccgcgccctgatc > 1:1543071‑M2/1‑36 (MQ=255) cacaGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGTGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGatat > 2:2145016/1‑150 (MQ=255) acaGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTcctgtgggagcgggcaagcccgcgaataatccaccaccgatttcaacccgaaccaccataaggcagccgctatgcgtcccgcccgcgccctgatcgacctcc < 2:812856‑M2/137‑103 (MQ=255) aGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGATATCCa < 2:1258344/150‑1 (MQ=255) ggTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGATATCCAg < 1:1428046/150‑1 (MQ=255) ggTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGATATCCAg < 1:1407561/150‑1 (MQ=255) gTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGTACAGGCTGTTActgctg < 2:32989/83‑1 (MQ=255) gTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTActgctg > 1:32989/1‑83 (MQ=255) cacaGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGATATCCAGGCCTTCg < 1:1483130/150‑1 (MQ=255) cTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGa < 2:1063537/76‑1 (MQ=255) cTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGa > 1:1063537/1‑76 (MQ=255) cTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGATATCCAGGCCTTCGGCACt > 1:984598/1‑150 (MQ=255) tttCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTa > 2:1291324/1‑65 (MQ=255) tttCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTa < 1:1291324/65‑1 (MQ=255) aaaaGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGATATCCAGGCCTTCGGCACTGATCt > 1:1025895/1‑150 (MQ=255) aaaaGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGATATCCAGGCCTTCGGCACTGATCt > 2:1676604/1‑150 (MQ=255) aaGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGATATCCAGGCCTTCGGCACTGATCTGc < 2:916024/150‑1 (MQ=255) aaGCGGTGGTCTTCCTGCGGAAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGATATCCAGGCCTTCGGCACTGATCTGc < 2:2244045/150‑1 (MQ=255) ggtgTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGATATCCAGGCCTTCGGCACTGATCTGCGGcttct > 1:385540/1‑150 (MQ=255) gtgtTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGATATCCAGGCCTTCGGCACTGATCTGCGGcttctt > 2:1783406/1‑150 (MQ=255) gtTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTg > 2:449522/1‑83 (MQ=255) gtTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTg < 1:449522/83‑1 (MQ=255) | TTGTGGCGCAGGGCCTGGAGGTCGATCAGGGCGCGGGCGGGACGCATAGCGGCTGCCTTATGGTGGTTCGGGTTGAAATCGGTGGTGGATTATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTCGTGCACAGCTTTCAAAAGCGGTGGTGTTCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATGGGCCGGCACAGGCTGTTACTGCTGGTGAGCCGGCGCGCTTTGCCCGTGCTTGGCCACTTCCCGGCTATTGCCATAACGGGAGATATCCAGGCCTTCGGCACTGATCTGCGGCTTCTT > NC_002947/6019209‑6019501 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |