| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,386,430 | G→T | 5.2% | A239A (GCC→GCA) | PP_2094 ← | nitrate‑binding protein NasS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,386,430 | 0 | G | T | 5.2% | 371.0 / 6.0 | 116 | A239A (GCC→GCA) | PP_2094 | nitrate‑binding protein NasS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (51/59); new base T (4/2); total (55/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.21e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.61e-01 | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
TCATAATGGCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCACCAACGCAGAAGCC > NC_002947/2386281‑2386579 | tCATAATGGCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACgg > 1:1220294/1‑150 (MQ=255)tCATAATGGCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACgg > 2:2349217/1‑150 (MQ=255) aTAATGGCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATAAACTTGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGgc < 1:571349/150‑1 (MQ=255) tGGCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTg > 2:273407/1‑150 (MQ=255) gCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGtt > 1:1842320/1‑150 (MQ=255) ccGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTg < 2:688081/150‑1 (MQ=255) cAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGAGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTa < 2:2100716/150‑1 (MQ=255) ggCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTAtt > 2:1694439/1‑150 (MQ=255) gCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTg > 1:2029182/1‑150 (MQ=255) gggggCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTc < 2:2217012/150‑1 (MQ=255) ggggCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCg < 2:1772693/150‑1 (MQ=255) ggggCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCg < 2:2119282/150‑1 (MQ=255) ggggCTATGATGCCCAGCGGTGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCg < 1:1846674/150‑1 (MQ=255) cTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACgg > 1:2394400/1‑125 (MQ=255) cTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACgg < 2:2394400/125‑1 (MQ=255) tATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACgg < 1:548951/124‑1 (MQ=255) tATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACgg > 2:548951/1‑124 (MQ=255) tATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCaaa < 2:439116/150‑1 (MQ=255) tATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCaaa > 1:2009139/1‑150 (MQ=255) tGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTgg > 2:489949/1‑132 (MQ=255) tGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTc > 2:2187957/1‑139 (MQ=255) tGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTc < 1:2187957/139‑1 (MQ=255) ccAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCggg < 2:754012/150‑1 (MQ=255) cAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCCCGTGCGCTga < 1:1522988/122‑2 (MQ=255) cAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCCCGTGCGCTga > 2:1522988/1‑121 (MQ=255) cGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCa < 1:130731/150‑1 (MQ=255) gggTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAgg < 2:959520/150‑1 (MQ=255) ggTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCaaa < 2:2300509/135‑1 (MQ=255) gtCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAg < 1:480956/150‑1 (MQ=255) tCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAgg > 1:721321/1‑150 (MQ=255) tCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAgg > 1:585917/1‑150 (MQ=255) cAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGAc > 2:894718/1‑150 (MQ=255) cAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCCTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGcc > 1:1527405/1‑145 (MQ=255) cAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCCTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGcc < 2:1527405/145‑1 (MQ=255) aGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGAcc > 2:421345/1‑150 (MQ=255) gTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTTATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAg > 2:2388229/1‑139 (MQ=255) gTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAg < 1:2388229/139‑1 (MQ=255) gcTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCTGCTGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCgg > 1:1643426/1‑150 (MQ=255) gcTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGCCGCGGGCGCCGGCCAGGACCTTTTCCgg < 2:1842320/150‑1 (MQ=255) gcTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCa < 2:1934862/132‑1 (MQ=255) gcTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCa > 1:1934862/1‑132 (MQ=255) gcTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCgg < 1:1829463/150‑1 (MQ=255) ttGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCg > 1:1345969/1‑113 (MQ=255) ttGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCg < 2:1345969/113‑1 (MQ=255) ttGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGt > 2:1034450/1‑150 (MQ=255) cgcTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGAt > 1:1797150/1‑150 (MQ=255) tGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCGGGCGGTGAGGAACGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCg > 1:30665/1‑150 (MQ=255) 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tttCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAggg < 2:1797150/150‑1 (MQ=255) cGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGc < 2:14961/121‑1 (MQ=255) cGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGc > 1:14961/1‑121 (MQ=255) gggCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAg > 2:2007622/1‑150 (MQ=255) tttGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCtt > 2:1194870/1‑150 (MQ=255) ttGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTg < 2:764342/150‑1 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aaTCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCtt < 1:1548131/139‑1 (MQ=255) aaTCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCtt > 2:1548131/1‑139 (MQ=255) aaTCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGcc > 1:1228090/1‑150 (MQ=255) tCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAg < 2:1721032/81‑1 (MQ=255) tCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCAc > 2:558524/1‑150 (MQ=255) tCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGCATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCAc > 1:1508639/1‑150 (MQ=255) cGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCAcc < 2:1228090/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACcgc < 1:2087259/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCtggtg > 1:1291776/1‑116 (MQ=255) tGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCtggtg < 2:1291776/116‑1 (MQ=255) tGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCAAAATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGt > 1:149901/1‑150 (MQ=255) gCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCgg > 2:2035892/1‑86 (MQ=255) 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ccTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCa < 2:1943906/129‑1 (MQ=255) ccTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCa > 1:1943906/1‑129 (MQ=255) ccTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAgg > 1:548306/1‑147 (MQ=255) ccTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAgg < 2:548306/147‑1 (MQ=255) cTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTcggcg > 1:1000274/1‑139 (MQ=255) cTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTcggcg < 2:1000274/139‑1 (MQ=255) cTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTc > 1:54522/1‑150 (MQ=255) cccaacAGCGCCCGTGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCa > 2:417798/6‑150 (MQ=255) tGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGCCGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCTTTTGGCCACCGCGTCGGTGGCCCAGGGCTCAc < 2:721321/150‑1 (MQ=255) ccaacAGCGCCCGTGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCAc > 1:1460162/5‑150 (MQ=255) aGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCACCAACg < 2:681651/150‑1 (MQ=255) cgcACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCACCAACGCa < 1:1194870/150‑1 (MQ=255) gcACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGc > 2:1547386/1‑116 (MQ=255) gcACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGc < 1:1547386/116‑1 (MQ=255) | TCATAATGGCCGAGCAGGCGGGGGGCTATGCTGTCCAGCGGGGTGTCCAGGTAAGCGCTTGCGCTGAGCAGTTGCGCGGTGCTGCGGCGGTTTTCCGGGCTTTGCTCGATGAATCGGCTGGCGGTGAGGATCGCCTTGATCAGCGCACGGGCGCTGTTGGGGTATTGCTCGGCAAAGACGCGGGCGCAGGCCAGGACCTTTTCCGGGTGATCCGGCCAGATCGACTGGCTGGTGGCCAGGGTGAAGCCTTGGCCTTTGGCCACCGCGTCGGCGGCCCAGGGCTCACCAACGCAGAAGCC > NC_002947/2386281‑2386579 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |