| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,462,973 | T→A | 5.9% | L229Q (CTG→CAG) | lolD → | lipoprotein‑releasing system ATP‑binding protein LolD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,462,973 | 0 | T | A | 5.9% | 269.3 / 6.3 | 85 | L229Q (CTG→CAG) | lolD | lipoprotein‑releasing system ATP‑binding protein LolD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/41); new base A (2/3); total (41/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.80e-01 | |||||||||||
CGGTAACCTCGACCACCATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGGCGCGCGCTACACCCGAGCCAAGCGTCGCAACCACTTCATCTCGT > NC_002947/2462824‑2463119 | cGGTAACCTCGACCACCATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGCGCTTAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCt < 1:1978395/150‑1 (MQ=255) gTAACCTCGACCACCATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGTCCACCt < 2:834477/148‑1 (MQ=255) gTAACCTCGACCACCATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCt > 1:834477/1‑148 (MQ=255) tAACCTCGACCACCATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCtggt < 2:1416259/150‑1 (MQ=255) tAACCTCGACCACCATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCtggt > 2:1758278/1‑150 (MQ=255) aaCCTCGACCACCATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCtggtg < 1:1944649/150‑1 (MQ=255) ccTCGACCACCATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCtggt > 1:750772/1‑147 (MQ=255) ccTCGACCACCATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCtggt < 2:750772/147‑1 (MQ=255) ccTCGACCACCATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGc > 2:2145941/1‑150 (MQ=255) cTCGACCACCATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGcc > 2:2050347/1‑150 (MQ=255) cTCGACCACCATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGcc > 2:1876782/1‑150 (MQ=255) cTCGACCACCATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGcc > 2:1958973/1‑150 (MQ=255) cTCGACCACCATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGcc > 1:1913073/1‑150 (MQ=255) cTCGACCACCATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGAGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGcc > 2:192828/1‑150 (MQ=255) cTCGACCACCATACCGCCCAAGCCATCCAGGAGCTGATGCACGAGCTGTCCAGCGCGTCGCCCACGGCATTCCTCGGGGTCACCCACGACCGCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGcc < 2:1007404/150‑1 (MQ=255) cGACCACCATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCAt < 2:618841/150‑1 (MQ=255) gACCACCATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCCGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATc < 2:207762/150‑1 (MQ=255) accaccATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCAGGTGGCCATcg < 2:511775/150‑2 (MQ=255) ccaccaTACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTg < 1:1958973/150‑1 (MQ=255) caccaTACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGa < 2:2185035/150‑1 (MQ=255) caccaTACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGa > 2:490080/1‑150 (MQ=255) caTACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCg > 1:1386197/1‑150 (MQ=255) caTACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCg > 1:378224/1‑150 (MQ=255) 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ccAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCgg > 2:2203096/1‑150 (MQ=255) cAAGGCATCCCGCAACTGAAGGAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCggg > 2:1192361/1‑150 (MQ=255) cAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCggg < 1:1993011/150‑1 (MQ=255) aaGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCgggg > 1:1223803/1‑150 (MQ=255) aaGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCgggg > 1:1424812/1‑150 (MQ=255) aTCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCa < 1:1876782/150‑1 (MQ=255) tCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAg < 2:158371/150‑1 (MQ=255) aGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGtg < 2:378224/150‑1 (MQ=255) gCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGGAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGACAGGtgctgc < 2:1388818/150‑1 (MQ=255) gATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGcccc < 1:1161614/150‑1 (MQ=255) gCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGtt < 1:490080/150‑1 (MQ=255) cAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGttt > 1:313602/1‑150 (MQ=255) ggAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTc < 1:2145941/150‑1 (MQ=255) gAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGa < 2:2187344/114‑1 (MQ=255) gAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGa > 1:2187344/1‑114 (MQ=255) tGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGtt > 2:1853098/1‑150 (MQ=255) tCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTc > 2:2063939/1‑150 (MQ=255) tCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATAGACGTCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTc > 1:738061/1‑150 (MQ=255) aGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGcc < 2:1663384/132‑1 (MQ=255) aGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGcc > 1:1663384/1‑132 (MQ=255) aGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCAt > 1:885037/1‑150 (MQ=255) aGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCAt < 1:2186470/150‑1 (MQ=255) cTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATc < 2:1742255/103‑1 (MQ=255) cTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATc > 1:1742255/1‑103 (MQ=255) ttCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGCGt < 1:2408538/150‑1 (MQ=255) cgcgCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGa < 1:1758278/150‑1 (MQ=255) cgcACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCtggtgg < 1:233/88‑1 (MQ=255) cgcACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCtggtgg > 2:233/1‑88 (MQ=255) ggCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGTGTGATTTCGTa < 1:1182534/150‑1 (MQ=255) ggCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTa < 2:1223803/150‑1 (MQ=255) aTTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTTAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACAt > 1:296073/1‑150 (MQ=255) cTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTc < 2:2065892/150‑1 (MQ=255) tggtggTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCa < 1:2063939/150‑1 (MQ=255) gtCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGAccc < 2:1754287/150‑1 (MQ=255) gtCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGAccc > 2:653485/1‑150 (MQ=255) cACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCgggg < 2:1592178/89‑1 (MQ=255) cACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCgggg > 1:1592178/1‑89 (MQ=255) ccACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGttt < 2:1747202/114‑1 (MQ=255) ccACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGttt > 1:1747202/1‑114 (MQ=255) ccACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCATACCCTTGcc > 1:2230589/1‑150 (MQ=255) cACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGccc > 2:458898/1‑150 (MQ=255) gACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATc < 2:1386197/150‑1 (MQ=255) tCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTa > 1:1070126/1‑150 (MQ=255) tCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTa < 1:843359/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGGCGCGCGCTACACCCGa < 1:1192361/150‑1 (MQ=255) aCCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGGCGCGCGCTACACCCGAg < 1:369829/150‑1 (MQ=255) ccGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGGCGCGCGCTACACCCGAGc > 1:445189/1‑150 (MQ=255) gCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGgcgc > 2:835021/1‑129 (MQ=255) gCTGAAGCGCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGgcgc < 1:835021/129‑1 (MQ=255) tGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGGCGCGCGCTACACCCGAGCCAAGCGTc > 2:189503/1‑150 (MQ=255) tGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGGCGCGCGCTACACCCGAGCCAAGCGTc < 2:176278/150‑1 (MQ=255) tGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGGCGCGCGCTACACCCGAGCCAAGCGTc < 2:445189/150‑1 (MQ=255) tCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGGCGCGCGCTACACCCGAGCCAAGCGTCGCAAcc > 2:892880/1‑150 (MQ=255) cgacgaTGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGGCGCGCGCTACACCCGAGCCAAGCGTCGCAACCa > 1:1616950/1‑150 (MQ=255) gacgaTGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCGGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGGCGCGCGCTACACCCGAGCAAAGCGTCGCAACCAc > 1:1098627/1‑150 (MQ=255) gacgaTGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGGCGCGCGCTACACCCGAGCCAAGCGTCGCAACCAc > 2:2374260/1‑150 (MQ=255) gacgaTGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGGCGCGCGCTACACCCGAGCCAAGCGTCGCAACCAc > 2:830191/1‑150 (MQ=255) aTGGCCACCAGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCg < 2:2337579/111‑1 (MQ=255) aTGGCCACCAGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCg > 1:2337579/1‑111 (MQ=255) aTGGCCACCAGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGGCGCGCGCTACACCCGAGCCAAGCGTc < 1:185382/138‑1 (MQ=255) aTGGCCACCAGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGGCGCGCGCTACACCCGAGCCAAGCGTc > 2:185382/1‑138 (MQ=255) ccACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGGCGCGCGCTACACCCGAGCCAAGCGTCGCAACCACTTCAtctc > 1:13149/1‑150 (MQ=255) aCCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGGCGCGCGCTACACCCGAGCCAAGCGTCGCAACCACTTCATCTCGt < 1:189503/150‑1 (MQ=255) | CGGTAACCTCGACCACCATACCGCCCAAGGCATCCAGGAGCTGATGCAGGAGCTGTCCAGCGCTTCGCGCACGGCATTCCTGGTGGTCACCCACGACCTCAACCTGGCGCGGCAGATGGACCGTGTGCTGAAGCTCGACGATGGCCACCTGGTGGCCATCTGATCGACTGCCGGGGTGGCAGGTGCTGCCCCGTTTTCCTGTTTCCATTGGGTGATTTCGTACATGTTCAGACCCTTGCCCATCTTTATCGGCGCGCGCTACACCCGAGCCAAGCGTCGCAACCACTTCATCTCGT > NC_002947/2462824‑2463119 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |