Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,510,291 | C→T | 7.0% | V495M (GTG→ATG) ‡ | copA‑I ← | copper resistance protein A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,510,291 | 0 | C | T | 7.0% | 268.2 / 7.5 | 95 | V495M (GTG→ATG) ‡ | copA‑I | copper resistance protein A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (52/36); new base T (2/5); total (54/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.33e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.33e-01 |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
ACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGACCGTCCGGGTCGGGGTAGGGGCTG > NC_002947/2510143‑2510436 | aCCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCAcg > 1:794989/1‑150 (MQ=255) cccGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCAcgc < 1:1182985/150‑1 (MQ=255) cccGGTAGGTGCGACGGCGGTCGGGCGGGATAGCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCAcgc < 2:1944090/150‑1 (MQ=255) ccGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCAcgcg > 1:945092/1‑150 (MQ=255) ccGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCAcgcg > 1:20310/1‑150 (MQ=255) gTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCg > 1:682477/1‑150 (MQ=255) gTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCg > 1:1555808/1‑150 (MQ=255) cGTCGGCTGCCGGGCGGGATCTCGACGGTGTGCTTGCGCCCCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAg < 2:2200019/150‑1 (MQ=255) ccGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGAACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCACTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTTTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGc > 2:277948/1‑150 (MQ=255) cgggATATCGACGGTGTGCTTGTGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCgg > 1:464109/1‑150 (MQ=255) gATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTc < 2:20310/150‑1 (MQ=255) atCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGc > 1:565402/1‑150 (MQ=255) atCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGc < 2:1840522/150‑1 (MQ=255) tgtgCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCAcgc < 2:17471/111‑1 (MQ=255) tgtgCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCAcgc > 1:17471/1‑111 (MQ=255) tgtgCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGa > 1:361363/1‑150 (MQ=255) tgtgCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGa < 2:361363/150‑1 (MQ=255) gtgCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGACGCTGaa > 1:34235/1‑150 (MQ=255) tgCTTGCGCACTAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAAc < 1:1309267/150‑1 (MQ=255) gCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACt < 2:565402/150‑1 (MQ=255) tGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGa < 2:2228118/150‑1 (MQ=255) gcACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACAACAGGACAGCTGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGc > 2:1171149/1‑150 (MQ=38) aCCAGGAACTGGCCATTCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCg > 2:599338/1‑150 (MQ=255) aCCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCg > 1:801282/1‑150 (MQ=255) cAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAg > 2:1849340/1‑109 (MQ=255) cAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAg < 1:1849340/109‑1 (MQ=255) cAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTc > 1:1636004/1‑150 (MQ=255) cAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTc > 2:1682808/1‑150 (MQ=255) aGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCa > 1:2027484/1‑102 (MQ=255) aGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCa < 2:2027484/102‑1 (MQ=255) ggAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGa > 1:1459902/1‑150 (MQ=255) ccATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAg > 2:2002229/1‑150 (MQ=255) ccATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAg > 2:1219704/1‑150 (MQ=255) aTGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGc > 1:1109933/1‑103 (MQ=255) aTGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGc > 1:1114224/1‑150 (MQ=255) aTGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTAATCCTGCTGTCGTTGAAAAAGGTGATGCCCACGCGC‑TAACCGTAGGTCAGCTGCAGCGGACCCGCGTCGCCGAACTTGATGCCGCCGAACGACCAgcc > 2:418819/1‑148 (MQ=255) cTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCCGGTGGATTGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGaa < 2:1999375/150‑1 (MQ=255) cTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGaa > 2:751256/1‑150 (MQ=255) tCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGAc < 1:616139/141‑1 (MQ=255) tCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGAc > 2:616139/1‑141 (MQ=255) gTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGAGCGTGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAgag > 1:1999375/1‑148 (MQ=255) cTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCt > 2:1445741/1‑150 (MQ=255) cTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGACGAAGCGCt < 1:1219704/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGc < 2:2177977/100‑1 (MQ=255) ttCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGc > 1:2177977/1‑100 (MQ=255) ttCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGCCGAACGACCAGGCGAAGCGCTc > 2:12871/1‑150 (MQ=255) ttCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGAGAAAAACACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTc < 1:419097/150‑1 (MQ=38) gCTCCACATGACGCGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTGGACCAGGGTGATGCGGACGCGC‑TAGCCGTAGGTCAGCCGGTGCCGTTCGGCGACGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGTCGAAGCGCTCCATATGGcc < 2:682477/150‑1 (MQ=255) cTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTc < 2:2068365/101‑1 (MQ=255) cTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTc > 1:2068365/1‑101 (MQ=255) tCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCgg > 2:2045951/1‑150 (MQ=255) ccACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGt > 1:137935/1‑150 (MQ=255) caTGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAg < 1:1445741/150‑1 (MQ=255) aTGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCa < 2:2203281/136‑1 (MQ=255) aTGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCa > 1:2203281/1‑136 (MQ=255) aTGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAgg > 1:963665/1‑150 (MQ=255) gCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTg < 2:801282/150‑1 (MQ=255) cAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTc < 2:300077/150‑1 (MQ=255) aGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGc < 2:2348096/83‑1 (MQ=255) aGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGc > 1:2348096/1‑83 (MQ=255) gTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGAt > 2:426182/1‑150 (MQ=255) tGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCGTGGCAGGTGCAGCTCGATg > 1:1929399/1‑150 (MQ=255) gggtgggtCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGc < 2:483736/107‑1 (MQ=255) gggtgggtCATCATGGTGTCGTTGACAAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGc > 1:483736/1‑107 (MQ=255) ggtgggtCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGAc < 2:348952/101‑1 (MQ=255) ggtgggtCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGAc > 1:348952/1‑101 (MQ=255) ggtgggtCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCg < 1:800207/125‑1 (MQ=255) ggtgggtCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCg > 2:800207/1‑125 (MQ=255) ggtgggtCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCAcgcg > 2:28181/1‑150 (MQ=255) ccaacctcatGCTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCCCGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGGTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATg < 1:112079/144‑1 (MQ=255) ggtCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATgg > 1:897251/1‑150 (MQ=255) tcatcaTGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATggcg > 1:1930166/1‑150 (MQ=255) ccgctgcggctgacctacGGTGA‑GCGCGTGCGCATCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGt < 2:441747‑M1/99‑1 (MQ=255) ccgctgcggctgacctacGGTGA‑GCGCGTGCGCATCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTAGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGt > 1:441747‑M1/19‑117 (MQ=255) atGGTGTCGTTGAACAGGGTGATGCGGACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGAGGCAGCGGTTGGGCGGCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGATCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCCCGATGTAACGCGATggagaacgg > 2:112079/1‑143 (MQ=255) tgtCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCGCGGTGGCACGCGATGGCGGGCGACCGt > 1:1963718/1‑150 (MQ=255) tCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGACCGTcc < 2:897251/150‑1 (MQ=255) tCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGACCGTcc > 1:1631589/1‑150 (MQ=255) tCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGACCGTcc < 1:58703/150‑1 (MQ=255) tCGTTGACCAGGGTGATCCGCACGGGG‑TCACTGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGGCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGGCCGTcc < 2:2196989/150‑1 (MQ=255) gTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGA‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGAGGTTGGGCGTGGCGGAACTTGATGCCGTAGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTAAGGTGCAGCTCGATGTCCCGCGATGGCGGGCGACCGACCgg > 1:359090/1‑150 (MQ=255) ctacGGTGA‑GCGCTTGCGCATCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGACCGTCCGGGTCgg < 2:93284‑M1/146‑1 (MQ=255) ctacGGTGA‑GCGCGTGCGCATCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGACCGTCCGGGTCgg < 1:590042‑M1/146‑1 (MQ=255) ccAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGACCGTCCGGGTCgg < 2:963665/150‑1 (MQ=255) ccAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGACCGTCCGGGTCgg < 1:751256/150‑1 (MQ=255) tacGGTGA‑GCGCGTGCGCATCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAg < 1:763385‑M1/76‑1 (MQ=255) tacGGTGA‑GCGCGTGCGCATCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAg > 2:763385‑M1/4‑79 (MQ=255) tacGGTGA‑GCGCGTGCGCATCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGACCGTCCGGGTCggg < 2:462075‑M1/147‑1 (MQ=255) cAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCTTTTAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGACCGTCCGGGTCggg > 1:1869218/1‑150 (MQ=255) cAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGa > 1:26598/1‑136 (MQ=255) cAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGa < 2:26598/136‑1 (MQ=255) cAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGACCGTCCGGGTCggg > 2:146464/1‑150 (MQ=255) cAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGACCGTCCGGGTCggg < 2:1636004/150‑1 (MQ=255) gggTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGACCGTCCGGGTCGGGGt < 1:599338/150‑1 (MQ=255) GGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGAt > 1:915787‑M1/1‑60 (MQ=255) GGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGAt < 2:915787‑M1/60‑1 (MQ=255) TGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGACCGTCCGGGTCGGGGTAgg > 2:1631589‑M1/1‑150 (MQ=255) cgcACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGACCGTCCGGGTCGGGGTAGGGGCTg > 2:716792/1‑150 (MQ=255) cgcgC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGACCGTCCGGGTCGGGGTAggg < 1:203496/142‑1 (MQ=255) cgcgC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGACCGTCCGGGTCGGGGTAggg > 2:203496/1‑142 (MQ=255) | ACCCGGTAGGTGCGTCGGCTGCCGGGCGGGATATCGACGGTGTGCTTGCGCACCAGGAACTGGCCATGCTCGTCTTCCAGGTCGCTCCACATGCCGTGCAGGTGGATGGGGTGGGTCATCATGGTGTCGTTGACCAGGGTGATGCGCACGCGC‑TCACCGTAGGTCAGCCGCAGCGGTTCGGCGTCGCTGAACTTGATGCCGTCGAACGACCAGGCGAAGCGCTCCATATGGCCGGTCAGGTGCAGCTCGATGTCACGCGATGGCGGGCGACCGTCCGGGTCGGGGTAGGGGCTG > NC_002947/2510143‑2510436 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |