Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,565,106 | T→G | 6.2% | Q630P (CAG→CCG) ‡ | pctB ← | methyl‑accepting chemotaxis protein PctB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,565,106 | 0 | T | G | 6.2% | 284.2 / 9.5 | 98 | Q630P (CAG→CCG) ‡ | pctB | methyl‑accepting chemotaxis protein PctB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (48/43); new base G (2/4); total (51/47) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.26e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.99e-01 |
TTGCTGGCCTGGGTACGGCGGGGCAGGGCTGCGAAGGCGGTGGCGGCATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCGACCACGGCGGTCTGTTCTTCGGTCGCTGTCGCCACCGACTGGTTCAT > NC_002947/2564959‑2565254 | ttGCTGGCCTGGGTACGGCGGGGCAGGGCTGCGAAGGCGGTGGCGGCATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCctgc < 2:236189/150‑1 (MQ=255) cTGGCCTGGGTACGGCGGGGCAGGGCTGCGAAGGCGGTGGCGGCATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTgg > 1:1691559/1‑150 (MQ=255) cTGGCCTGGGTACGGCGGGGCAGGGCTGCGAAGGCGGTGGCGGCATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTgg < 1:940872/150‑1 (MQ=255) tGGCCTGGGTACGGCGGGGCAGGGCTGCGAAGGCGGTGGCGGCATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTggg > 1:883159/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGGTACGGCGGGGCAGGGCTGCGAAGGCGGTGGCGGCATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGc < 1:1830006/150‑1 (MQ=255) cTGGGTACGGCGGGGCAGGGCTGCGAAGGCGGTGGCGGCATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCAGGCTGGGcgtt < 2:605551/150‑4 (MQ=255) cTGGGTAAGGCCGGGCAGGGCGGCTAAGGCGGTGGCGGCATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAg > 2:594628/1‑150 (MQ=255) tGGGTACGGCGGGGCAGGGCTGCGAAGGCGGTGGCGGCATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCAGGCTGGGcgttt < 1:1147793/150‑5 (MQ=255) gTACGGCGGGGCAGGGCTGCGAAGGCGGTGGCGGCATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTgg > 2:333418/1‑150 (MQ=255) tACGGCGGGGCAGGGCTGCGAAGGCGGTGGCGGCATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGt < 1:1369739/150‑1 (MQ=255) ggcggGGCAGGGCTGCGAAGGCGGTGGCGGCATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCAGGCTGGGcgtttga < 1:1894918/145‑7 (MQ=255) ggcggGGCAGGGCTGCGAAGGCGGTGGCGGCATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCAGGCTGGGcgtttga > 2:1894918/1‑139 (MQ=255) gcggGGCAGGGCTGCGAAGGCGGTGGCGGCATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCa < 1:1167984/150‑1 (MQ=255) gCAGGGCTGCGAAGGCGGTGGCGGCATAAGGGGCTGGGACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGgc > 1:1948959/1‑150 (MQ=255) gggCTGCGAAGGCGGTGGCGGCATAAGGGGCTGGTCCAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCa < 2:307425/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGGCATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCGATTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAg < 1:2246568/150‑1 (MQ=255) gTGGCGGCATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAgg > 1:848751/1‑150 (MQ=255) gcggcATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAg > 1:847888/1‑146 (MQ=255) gcggcATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAg < 2:847888/146‑1 (MQ=255) ggcATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGTTGGGCTAGCTGTTCTCAATGTCGCAGGGTCTCGTTGAGGTtctc < 2:2082231/150‑1 (MQ=255) ggcATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTtctc > 2:1786635/1‑150 (MQ=255) aTAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCAGGCTGGGcgtt > 2:832482/1‑108 (MQ=255) aTAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCAGGCTGGGcgtt < 1:832482/111‑4 (MQ=255) tAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCAcc > 2:2006052/1‑150 (MQ=255) gggCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGAAGCACTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCct > 1:263500/1‑150 (MQ=255) gCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCctgc < 1:1786635/150‑1 (MQ=255) tGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCctgctg < 1:2006052/150‑1 (MQ=255) aGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAg < 1:425360/150‑1 (MQ=255) gCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCGGCCTGAAACCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAA‑GCCCAGCCTGCTGGGCCTGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAggg > 1:1046067/1‑150 (MQ=255) gCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGc > 2:1127693/1‑91 (MQ=255) gCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGc < 1:1127693/91‑1 (MQ=255) gACAACAGGCATAGGGCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAggg < 2:460210/148‑1 (MQ=255) gACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATNCTGANGCTGCCAACCACCTCATTCCCTCTTAGCAGGCCGC‑CGAACAGGCGTTGACAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTACCCCCACCGCGGGGTCAGGGCg > 1:172756/1‑150 (MQ=255) gACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAggg > 1:460210/1‑148 (MQ=255) acaacaGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGt < 1:1422982/150‑1 (MQ=255) aacaGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCATGGTCTCGTTGa < 2:1908821/118‑1 (MQ=255) aacaGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGa > 1:1908821/1‑118 (MQ=255) aacaGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTg > 1:1927487/1‑150 (MQ=255) caGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTTAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGAt < 2:883159/150‑1 (MQ=255) caGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGc > 2:86689/1‑144 (MQ=255) caGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGc < 1:86689/144‑1 (MQ=255) aGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATc > 2:1487408/1‑150 (MQ=255) aTAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTggg > 2:2043155/1‑150 (MQ=255) aTAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTggg < 1:594628/150‑1 (MQ=255) tAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGt < 2:1948959/150‑1 (MQ=255) tAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGt > 1:392521/1‑150 (MQ=255) ggCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGa > 2:829062/1‑150 (MQ=255) gCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTc < 2:1336126/84‑1 (MQ=255) gCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTc > 1:1336126/1‑84 (MQ=255) gCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGAt > 1:1366697/1‑150 (MQ=255) gCCGTTGCCGCCGGAACCCGGCGTTTAAATGCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCACCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCGGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGAt < 2:1014256/150‑1 (MQ=255) accGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGAt > 2:1902315/2‑150 (MQ=255) ttGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTcc < 1:1487408/150‑1 (MQ=255) gccgccTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAg < 1:518069/150‑1 (MQ=255) cTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGa < 1:2043155/150‑1 (MQ=255) tGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTgg > 1:1784103/1‑133 (MQ=255) tGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTgg < 2:1784103/133‑1 (MQ=255) gAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAgg < 2:848751/150‑1 (MQ=255) aCCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGct > 2:1941085/1‑150 (MQ=255) ccGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGtc < 1:1698285/83‑1 (MQ=255) ccGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGtc > 2:1698285/1‑83 (MQ=255) cGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCtctc > 2:1880861/1‑150 (MQ=255) ggCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTTCTTCAAAC‑GCCCAGCCTACTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCg < 2:1046067/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATATTGAGGTTGAGGCTCTCg > 1:2044737/1‑150 (MQ=255) 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cTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCGACCACGGCGGTc > 2:1056845/1‑150 (MQ=255) cTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCGACCACGGCGGTc < 1:1902315/150‑1 (MQ=255) aGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCGACCACGGCGGTCTGtt < 1:333418/150‑1 (MQ=255) gCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGGGCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCGACCACGGCGGTCTGttcttc < 2:586126/150‑1 (MQ=255) cccACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTTGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTggg < 1:898579/106‑1 (MQ=255) cccACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTggg > 2:898579/1‑106 (MQ=255) cccACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAgg < 1:1013280/117‑1 (MQ=255) cccACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAgg > 2:1013280/1‑117 (MQ=255) ccaccaACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCGACCAcggcgg > 2:2168680/1‑138 (MQ=255) ccaccaACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCGACCAcggcgg < 1:2168680/138‑1 (MQ=255) gCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTtctc < 1:1504264/64‑1 (MQ=255) gCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTtctc > 2:1504264/1‑64 (MQ=255) cTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCg > 2:177210/1‑118 (MQ=255) cTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCg < 1:177210/118‑1 (MQ=255) aaaC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGtt < 2:503561/104‑1 (MQ=255) aaaC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGtt > 1:503561/1‑104 (MQ=255) aaaC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGa < 2:2343799/106‑1 (MQ=255) aaaC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGa > 1:2343799/1‑106 (MQ=255) aaaC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCGACCACGGCGGTCTGttctt > 1:2242674/1‑133 (MQ=255) aaaC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCGACCACGGCGGTCTGttctt < 2:2242674/133‑1 (MQ=255) aaaC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGGTCTCCACCCCCTGCTGGGTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCGACCACGGCGGTCTGTTCTTCGGTCGCTGTCGCCAcc > 1:2348931/1‑150 (MQ=255) aaaC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTATCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGCTCTGGGTGATGTCAAGGTTGAGGCTCTCGACCACGGCGGTAGGATCGTCGGTATCTGTCGCGAcc > 2:2316720/1‑150 (MQ=255) ttgcgaccAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCGACCACGGCGGTCTGTTCTTCGGTCGCTGTCGCCAcc > 1:2371497/7‑150 (MQ=255) cccAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCGACCACGGCGGTCTGTTCTTCGGTCGCTGTCGCCACCGACTg > 2:1240461/1‑150 (MQ=255) ccAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCGACCACGGCGGTCTGTTCTTCGGTCGCTGTCGCCACCGACTgg > 2:1522881/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCGACCACGGCGGTCTGTTCTTCGGTCGCTGTCGCCACCGACTGGt > 2:1711457/1‑150 (MQ=255) aGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGt > 2:2070436/1‑65 (MQ=255) aGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGt < 1:2070436/65‑1 (MQ=255) ctgctgGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCGACCACGGCGGTCTGTTCTTCGGTCGCTGTCGCCACCGACTGGTTCAt < 1:599871/150‑1 (MQ=255) | TTGCTGGCCTGGGTACGGCGGGGCAGGGCTGCGAAGGCGGTGGCGGCATAAGGGGCTGGTACAGGCGACAACAGGCATAGGCCGTTGCCGCCTGAACCCGGCGTTTAAATCCTGAAGCTGCCCACCAACTGCTTCAAAC‑GCCCAGCCTGCTGGGCCAGCTGGTCGCAATGGCGCAGGGTCTCGTTGAGGTTCTCCACCCCCTGCTGGTTCAGGGCGTTGATCTGGGTGATGTCCAGGTTGAGGCTCTCGACCACGGCGGTCTGTTCTTCGGTCGCTGTCGCCACCGACTGGTTCAT > NC_002947/2564959‑2565254 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |