| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,568,736 | T→A | 5.5% | Q285H (CAA→CAT) | PP_2252 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,568,736 | 0 | T | A | 5.5% | 283.9 / 5.5 | 91 | Q285H (CAA→CAT) | PP_2252 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (50/35); new base A (2/3); total (53/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.74e-01 | |||||||||||
ACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCACCTTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGGCGATCCCGCGTGGGGCCAGGGTGGCGCCAAGCTTTTC > NC_002947/2568596‑2568885 | aCCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGAcc > 2:1819559/1‑150 (MQ=255) ccGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTg > 2:138062/1‑150 (MQ=255) cggcgCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCgg < 1:1819559/150‑1 (MQ=255) cggcgCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACACCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCCGATGGTCGAACAACTGCgg < 2:1108575/150‑1 (MQ=255) gcACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGACCACCCGCAGATGGTCGAACAACTGCGggtga < 2:1612149/150‑2 (MQ=255) cAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATg < 2:655960/150‑1 (MQ=255) aaGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATgg < 2:1954235/150‑1 (MQ=255) aGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATggg < 1:514316/150‑1 (MQ=255) cTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGtc > 1:2325607/1‑150 (MQ=255) cTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGtc < 1:358707/150‑1 (MQ=255) tCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGtcatc > 1:326091/1‑150 (MQ=255) cTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATgg > 1:534129/1‑142 (MQ=255) cTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATgg < 2:534129/142‑1 (MQ=255) cTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCAc > 2:1558076/1‑150 (MQ=255) cTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCAc > 2:810427/1‑150 (MQ=255) cTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCAc > 1:1190804/1‑150 (MQ=255) cTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCAc > 1:1391230/1‑150 (MQ=255) tCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCAcc > 1:253784/1‑150 (MQ=255) aCCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCg > 2:1690351/1‑150 (MQ=255) cTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGCTCACCCCCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGTGCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTa > 1:208736/1‑150 (MQ=255) cTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCCCCCGCAGTTGTTCGa < 2:1473440/110‑1 (MQ=255) cTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGa > 1:1473440/1‑110 (MQ=255) cTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATgg < 2:2176858/136‑1 (MQ=255) cTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATgg > 1:2176858/1‑136 (MQ=255) tGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATCGCCACGCTCTGGCGGTTCTCGATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGCGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTaa > 2:147591/1‑150 (MQ=255) gCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAAc < 2:620286/150‑1 (MQ=255) ccGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTc > 1:2050245/1‑103 (MQ=255) ccGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTc < 2:2050245/103‑1 (MQ=255) ccGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCgg > 2:1969720/1‑150 (MQ=255) ccGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCgg > 1:14992/1‑150 (MQ=255) cAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCATGTGAGATAGGAAGCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTAACGGTGGTGGGGCATCAGCGCGTAACCGGCTGc > 1:1022249/1‑150 (MQ=255) cAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACg > 1:400324/1‑120 (MQ=255) cAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACg < 2:400324/120‑1 (MQ=255) ggTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCgg < 2:326091/150‑1 (MQ=255) aaTAGCCCTCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCATCCTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCaa < 1:637235/150‑1 (MQ=255) aaTAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCaa < 1:1558076/150‑1 (MQ=255) aTAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCAcccc > 1:4463/1‑132 (MQ=255) aTAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCAcccc < 2:4463/132‑1 (MQ=255) tAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATc < 1:2226482/150‑1 (MQ=255) aCCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGaa > 1:1097378/1‑150 (MQ=255) cccccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGaaa < 1:1988991/150‑1 (MQ=255) ccccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCAcccc < 1:1585686/126‑1 (MQ=255) ccccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCAcccc > 2:1585686/1‑126 (MQ=255) ccccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGATGGTCGAACAACTGCgg < 2:339368/99‑1 (MQ=38) ccccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGATGGTCGAACAACTGCgg > 1:339368/1‑99 (MQ=38) ccccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGCACTGCATAACCTTCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAat > 1:1171408/1‑150 (MQ=255) cccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCATGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAatc > 2:593430/1‑150 (MQ=255) ccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGggtgg > 1:733323/1‑101 (MQ=255) ccGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGggtgg < 2:733323/101‑1 (MQ=255) aTGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGcc < 1:593430/150‑1 (MQ=255) ggCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGcccc > 1:309890/1‑150 (MQ=255) ccccGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCCTCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTg > 1:633774/1‑150 (MQ=255) gCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCAc > 1:1275135/1‑150 (MQ=255) gCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCAGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCACCTTGcc < 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aaCGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCACCTTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGGCGATCCCGCGt < 2:1693652/150‑1 (MQ=255) aaCGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCACCTTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGGCGATCCCGCGt > 1:1710465/1‑150 (MQ=255) gCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCACCTTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGGCGATCCCGCGTggg < 1:1948026/150‑1 (MQ=255) gTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCgg < 1:1831814/77‑1 (MQ=255) gTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCgg > 2:1831814/1‑77 (MQ=255) ttCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCACCTTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGGCGATCCCGCGTGGGGCCAgg > 2:1317162/1‑150 (MQ=255) atgATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGCCTGCGGCAATCGAACTCATCGCCCCTGCCACCTTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGGCGATCCCGCGTGGGGCCAGGGTg < 2:1022249/148‑1 (MQ=255) aGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCACCTTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGGCGATCCCGCGTGGGGGCAGGGTg > 2:1404293/1‑150 (MQ=255) gATCACCCGCAGGTGTTGGACGATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCACCTTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGGCGATCCCGCGTGGGGCCAGGGTGgc > 2:1843892/1‑150 (MQ=255) aTCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCACCTTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGGCGATCCCGCGTGGGGCCAGGGTGgcg < 2:253784/150‑1 (MQ=255) cccGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCAccc < 2:2145603/51‑1 (MQ=255) cccGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCAccc > 1:2145603/1‑51 (MQ=255) cccGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCACCTTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGGCGATCCCGCGTGGGGCCAGGGTGGCGCCaa < 2:309890/150‑1 (MQ=255) ccGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCACCTTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGGCGATCCCGCGTGGGGCCAGGGTGGCGCCAAg > 2:983257/1‑150 (MQ=255) ccGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCACCTTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGGCGATCCCGCGTGGGGCCAGGGTGGCGCCAAg > 1:702567/1‑150 (MQ=255) ccGCAGATGGTCGAACAACTGCGGTTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCACCTTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGGCGATCCCGCGTGGGGCCAGGGTGGCGCCAAg > 1:1721001/1‑150 (MQ=255) cGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCACCTTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGGCGATCCCGCGTGGGGCCAGGGTGGCGCCAAGc > 1:439963/1‑150 (MQ=255) gCAGTTGTTCGACCATCTGCAGGAGGACACGGTCATAGGTCATCACCCCGTAACAGGCTGCGGCAAACGAAATCATCGCCCCTACAACCTTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGACGATCCCGCGTGGCGCCAGGGTGgcgcacagat > 2:976637/1‑144 (MQ=255) aGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGc > 2:2228630/1‑77 (MQ=255) aGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGc < 1:2228630/77‑1 (MQ=255) gttgttCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCACCTTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGGCGATCCCGCGTGGGGTCAGGGTGGCGCCAAGCtttt < 1:1396488/150‑1 (MQ=255) ttgttCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCACCTTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGGCGATCCCGCGTGGGGCCAGGGTGGCGCCAAGCTTTTc > 2:134439/1‑150 (MQ=255) ttgttAGAGCATTTGCGGGTGGTCACGGACAAGGCGGCGCACCCCGTAACCGGCTGCTGTAATCGAAATCATCGCCCCTGCCACATTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGGCGATCCCGCGTGGGGCCAGGGTGGCGCCAAGCTTTTc < 2:1171408/150‑1 (MQ=255) | ACCGGCCGCGGCGCACTGGCCAGCAAGCTGTCCTCAACCTGCCCCGACAGGTAATAGACCCCCGCCATGGCCCCGCTCTGGCGGTTCTCCATCAACTCCTGCCATTCCTGGTTCAACGCCACGTTCAGGATCACCCGCAGTTGTTCGACCATCTGCGGGTGGTCACGGTCATGGGTCATCACCCCGTAACCGGCTGCGGCAATCGAAATCATCGCCCCTGCCACCTTGCCCACTGCCGATGCCACGGCACTGGCGATCCCGCGTGGGGCCAGGGTGGCGCCAAGCTTTTC > NC_002947/2568596‑2568885 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |