| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,729,577 | T→C | 6.1% | intergenic (+341/‑20) | PP_2390 → / → PP_2392 | LysR family transcriptional regulator/MFS transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,729,577 | 0 | T | C | 6.1% | 218.0 / 2.1 | 77 | intergenic (+341/‑20) | PP_2390/PP_2392 | LysR family transcriptional regulator/MFS transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/37); new base C (3/2); total (38/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAGCAAACGCGTGTTTCGACGTGGTTGCAGACCATCGAGATGGGGATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCA > NC_002947/2729428‑2729726 | aagcaaaCGCGTGTTTCGACGTGGTTGCAGACCATCGAGATGGGGATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCt > 1:2186091/1‑150 (MQ=255) gcaaaCGCGTGTTTCGACGTGGTTGCAGACCATCGAGATGGGGATGTCATAGGCTTGCGCGGGATGCTACTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTcc > 2:1029455/1‑149 (MQ=255) aaaCGCGTGTTTCGACGTGGTTGCAGACCATCGAGATGGGGATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGAc < 1:2118844/150‑1 (MQ=255) gtgtTTCGACGTGGTTGCAGACCATCGAGATGGGGATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTACAGAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTTTGCTCGACCAGATc > 1:654692/1‑150 (MQ=255) tgtTTCGACGTGGTTGCAGACCATCGAGATGGGGATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCg > 1:2084901/1‑150 (MQ=255) tttCGACGTGGTTGCAGACCATCGAGATGGGGATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGcc < 2:2008319/150‑1 (MQ=255) cGACGTGGTTGCAGACCATCGAGATGGGGATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGAt < 2:2186091/150‑1 (MQ=255) gACGTGGTTGCAGACCATCGAGATGGGGATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATg < 2:532914/150‑1 (MQ=255) gACCATCGAGATGGGGATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCa < 1:1075605/150‑1 (MQ=255) aCCATCGAGATGGGGATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCa < 1:1410122/149‑1 (MQ=255) aCCATCGAGATGGGGATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCa > 2:1410122/1‑149 (MQ=255) cATCGAGATGGGGATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGAc > 1:1616675/1‑122 (MQ=255) cATCGAGATGGGGATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGAc < 2:1616675/122‑1 (MQ=255) aTCGAGATGGGGATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGAt > 2:356366/1‑133 (MQ=255) aTCGAGATGGGGATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGAt < 1:356366/133‑1 (MQ=255) tCGAGATGGGGATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACAGCAGCCA‑g < 2:283714/150‑1 (MQ=255) ggATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATTCACATCAGCCA‑GGCCATGGCt > 2:2251254/1‑150 (MQ=255) ggATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCt < 2:924907/150‑1 (MQ=255) aTGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGa < 1:516980/120‑1 (MQ=255) aTGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGa > 2:516980/1‑120 (MQ=255) tCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCATGGCC‑TGGCTgatgt < 2:654692/150‑5 (MQ=255) tCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑TGGCCTGGCTgatg > 1:1954039/1‑146 (MQ=255) tCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑TGGCCTGGCTgatg < 2:1954039/149‑4 (MQ=255) tCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCa > 2:1266069/1‑150 (MQ=255) aTAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGca > 1:1728097/1‑124 (MQ=255) aTAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGca < 2:1728097/124‑1 (MQ=255) aTAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAAt > 1:2053980/1‑150 (MQ=255) aTAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAAt < 2:221086/150‑1 (MQ=255) aGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCTACAAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATgg < 1:1377805/150‑1 (MQ=255) aGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATgg < 1:1266069/150‑1 (MQ=255) cTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTg > 2:2362889/1‑139 (MQ=255) cTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTg < 1:2362889/139‑1 (MQ=255) cTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTc > 1:698853/1‑150 (MQ=255) ttGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATgg > 2:1084154/1‑146 (MQ=255) ttGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATgg < 1:1084154/146‑1 (MQ=255) ttGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCa > 1:2256867/1‑150 (MQ=255) tGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCAc < 2:734878/150‑1 (MQ=255) tGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCCCGACCAGATCGCCGATGGCATGc > 1:730287/1‑116 (MQ=255) tGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCCCGACCAGATCGCCGATGGCATGc > 1:730041/1‑116 (MQ=255) tGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCCCGACCAGATCGCCGATGGCATGc < 2:730041/116‑1 (MQ=255) tGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCCCGACCAGATCGCCGATGGCATGc < 2:730287/116‑1 (MQ=255) ggATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTa < 2:2256867/150‑1 (MQ=255) gATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGCTCTGCTCGACCAGAGCCCCGCTCGGCTTCACCTCCGCCC‑TGCCAGGCTTGGGCAACGGCTCACAGCTTAt > 2:1037851/1‑150 (MQ=255) aTGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCCTGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATg > 2:778309/1‑150 (MQ=255) tGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGc < 1:1454592/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTg < 2:2084901/150‑1 (MQ=255) cTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTc > 2:2112415/1‑80 (MQ=255) cTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTc < 1:2112415/80‑1 (MQ=255) cTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTgg > 1:763959/1‑150 (MQ=255) gcAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCg > 2:233606/1‑150 (MQ=255) ccAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGa > 1:1372106/1‑150 (MQ=255) cAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGAc > 1:1543928/1‑150 (MQ=255) aGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGACTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGAcc > 2:1741196/1‑150 (MQ=255) gTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATgg > 2:1244345/1‑81 (MQ=255) gTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATgg < 1:1244345/81‑1 (MQ=255) ccAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATc < 2:1124809/150‑1 (MQ=255) cAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGAc > 1:373884/1‑62 (MQ=255) cAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGAc < 2:373884/62‑1 (MQ=255) cAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGcc > 2:93316/1‑90 (MQ=255) cAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGcc < 1:93316/90‑1 (MQ=255) cAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATcc > 1:1753138/1‑150 (MQ=255) 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1:1144952/150‑1 (MQ=255) tGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACg < 2:2406696/150‑1 (MQ=255) gggAAGCGATGATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGAc < 2:1072970/150‑1 (MQ=255) gcggCGATAATGAAGGCAGGGATGCCCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGCCCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGAccc > 2:1730897/4‑150 (MQ=255) gAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGAccc > 2:1779229/1‑150 (MQ=255) aaGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCa > 1:220766/1‑150 (MQ=255) aaTGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCCAGGTAAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGAAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTgg > 1:572662/1‑150 (MQ=255) aggcaggTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCg > 1:1775860/1‑150 (MQ=255) aggTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGgcgc < 1:464058/150‑1 (MQ=255) gggTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCt > 2:1500103/1‑150 (MQ=255) ggTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTg < 2:1753138/150‑1 (MQ=255) gTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTgg < 2:698853/150‑1 (MQ=255) tCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGa > 2:557881/1‑102 (MQ=255) tCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGa < 1:557881/102‑1 (MQ=255) tCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGatca > 2:1335109/1‑150 (MQ=255) | AAGCAAACGCGTGTTTCGACGTGGTTGCAGACCATCGAGATGGGGATGTCATAGGCTTGCTCGGGATGCTCCTGGCGCAGCGGCCAGGTTTCCAGCTTGCCGTTGCTGGGGAAGCGATAATGCAGGCAGGTATGCGCCGGCGGGTCTGCTCGACCAGATCGCCGATGGCATGCACATCAGCCA‑GGCCATGGCTGGGCAATGGGTCACGGCGTATGCCTTGGGCTCGTTACTGACCGCCATCCCGTTGGTGACGTTGACCCAAGGCTGGTATCGGCGCCGGGCGCTGTTGCTGGCGATCA > NC_002947/2729428‑2729726 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |