| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,759,091 | A→C | 7.5% | L39R (CTG→CGG) | PP_2412 ← | ParA family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,759,091 | 0 | A | C | 7.5% | 217.8 / 7.4 | 75 | L39R (CTG→CGG) | PP_2412 | ParA family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/37); new base C (2/4); total (34/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.83e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
GGTGATTGCCACGCGGTGCTTCTTGCCGGCGGCGGTAACCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGAAGTAAAAATGTCAGGTCGGGGTCAATCCTAT > NC_002947/2758946‑2759239 | ggTGATTGCCACGCGGTGCTTCTTGCCGGCGACGGTAACCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCaa > 2:1917513/1‑150 (MQ=255) gTGATTGCCACGCGGTGCTTCTTGCCGGCGGCGGTAACCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAg > 2:2287852/1‑150 (MQ=255) aTTGCCACGCGGTGCTTCTTGCCGGCGGCGGTAACCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGtt < 2:2241054/150‑1 (MQ=255) ttGCCACGCGGTGCTTCTTGCCGGCGGCGGTAACCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTc < 1:952235/150‑1 (MQ=255) tGCCACGCGGTGCTTCTTGCCGGCGGCGGTAACCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCTGGTCGACCTCGACCCGCaggccaat < 1:1744097/150‑8 (MQ=255) ccACGCGGTGCTTCTTGCCGGCGGCGGTAACCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCTGGTCGACCTCGACCCGCag < 1:903613/142‑2 (MQ=255) ccACGCGGTGCTTCTTGCCGGCGGCGGTAACCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCTGGTCGACCTCGACCCGCag > 2:903613/1‑141 (MQ=255) ccACGCGGTGCTTCTTGCCGGCGGCGGTAACCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGt < 2:185499/150‑1 (MQ=255) cACGCGGTGCTTCTTGCCGGCGGCGGTAACCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTa < 2:924516/150‑1 (MQ=255) cACGCGGTGCTTCTTGCCGGCGGCGGTAACCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTa < 2:2189277/150‑1 (MQ=255) cACGCGGTGCTTCTTGCCGGCGGCGGTAACCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTa > 2:1548519/1‑150 (MQ=255) aCGCGGTGCTTCTTGCCGGCGGCGGTAACCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAg > 2:1787451/1‑150 (MQ=255) gTGCTTCTTGCCGGCGGCGGTAACCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCAGGGTCGCATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCCTTGGCCTGCGGGTCGCGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCGTc > 2:469114/1‑150 (MQ=255) tGCTTCTTGCCGGCGGCGGTAACCGGCGACAAGGTCCGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTcg > 2:1556103/1‑150 (MQ=255) cttcttGCCGGCGGCGGTAACCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAg < 2:604346/133‑1 (MQ=255) cttcttGCCGGCGGCGGTAACCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAg > 1:604346/1‑133 (MQ=255) tgTACCCGGCGCCAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCTGGTTGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGTCCTGCGGGTCGACGTCGACCCGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAgcggc < 2:797528/149‑1 (MQ=255) tAACCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGCGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAACGGCGa < 2:1648660/150‑1 (MQ=255) tAACCGGCGACAAGGTCCGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGa < 1:735498/150‑1 (MQ=255) aCCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAgg < 2:1838641/150‑1 (MQ=255) ccGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGa < 2:1820971/147‑1 (MQ=255) ccGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGa > 1:1820971/1‑147 (MQ=255) cGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGtt > 1:1561215/1‑150 (MQ=255) cGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGATCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGtt > 1:1450655/1‑150 (MQ=255) cGGCGACAAGGTATGGCGGAAGAAGGCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTGGATCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGCCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGACGtt < 2:540941/150‑1 (MQ=255) ggcAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAg < 2:1395232/148‑1 (MQ=255) gACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAg > 1:2355506/1‑150 (MQ=255) aaGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCg > 2:1837802/1‑150 (MQ=255) tGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTg > 1:12615/1‑150 (MQ=255) ggAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGATAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGCGGTTGCAGGCGACGCTGGAtt > 2:1167393/1‑150 (MQ=255) gaagaaGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGAGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCATGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGAGGCGAGGTTGCAGGCGGTGCAGGAttt > 1:222701/1‑150 (MQ=255) gCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCa < 1:469114/150‑1 (MQ=255) cGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCAc < 1:1917513/150‑1 (MQ=255) gATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCAcc > 1:2157719/1‑150 (MQ=255) aTGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTg < 1:1947512/138‑1 (MQ=255) aTGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTg > 2:1947512/1‑138 (MQ=255) aTGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCt < 2:1561215/150‑1 (MQ=255) cGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCt < 1:278416/150‑1 (MQ=255) tGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGAtt < 1:92851/150‑1 (MQ=255) tGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGAtt < 1:1556103/150‑1 (MQ=255) aaTGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGaa > 2:1929011/1‑150 (MQ=255) aaTGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTCGCATTAGCCTGAGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGaa > 1:1024578/1‑150 (MQ=255) ggTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAAc < 2:18762/150‑1 (MQ=255) tgtCGTTGACCATCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACca > 1:2384892/1‑150 (MQ=255) gtCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACcac < 1:1929011/150‑1 (MQ=255) tCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCACCCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACcaca > 1:55947/1‑150 (MQ=255) cAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCTGGTCGACCTCGACCCGCag < 2:244311/54‑2 (MQ=18) cAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCTGGTCGACCTCGACCCGCag > 1:244311/1‑53 (MQ=18) tGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTa < 2:410/55‑1 (MQ=255) tGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTa > 1:410/1‑55 (MQ=255) tGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCAcc > 1:1060653/1‑115 (MQ=255) tGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCAcc < 2:1060653/115‑1 (MQ=255) gAGGTAGGTGGTGGCATTCGTCTGCGGAGCGTGGTCGACCAGCCAGGTTCGGTCGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGCGGTTGCAGGCGATGCTGGCTTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTc < 2:55947/150‑1 (MQ=37) gTAGAAGGTGGTATTGGCCTGAGGGGCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCATGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATc < 2:222701/150‑1 (MQ=255) tAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATcc > 1:483068/1‑150 (MQ=255) ggTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGaa < 2:12615/150‑1 (MQ=255) cATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGAAGTaaa > 2:1295863/1‑150 (MQ=255) aTTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGc > 2:1909599/1‑89 (MQ=255) aTTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGc < 1:1909599/89‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGAAGTaaaa > 2:595932/1‑150 (MQ=255) gCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGAAGTAAAAATGt > 2:184930/1‑150 (MQ=255) cTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGAAGTAAAAATGTCa < 2:2157719/150‑1 (MQ=255) gCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCAAGGAAGCAGGCGATACTGGAAGTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGAAGTAAAAATGTCAgg > 1:901551/1‑150 (MQ=255) ggtcgaggtcgaCCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGaa > 1:778913/1‑133 (MQ=255) ggtcgaggtcgaCCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGaa < 2:778913/133‑1 (MQ=255) tcgaggtcgaCCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCAGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGAAGTAAAAATGTCAGGTCggg < 2:1292346/150‑1 (MQ=255) gaggtcgaCCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGAAGTAAAAATGTCAGGTCGGGGt < 1:2287852/150‑1 (MQ=255) tgagcAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGAAGTAAAAATGTCAGGTCGGGGTCAATc < 1:70690/146‑1 (MQ=255) gaCCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGAAGTAAAAATGTCAGGTCGGGGTCAATcc < 1:1787451/150‑1 (MQ=255) aCCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGaaaa > 1:939586/1‑91 (MQ=255) aCCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGaaaa < 2:939586/91‑1 (MQ=255) ccAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGAAGTAAAAATGTCAGGTCGGGGTCAATCCTa < 1:1548519/150‑1 (MQ=255) cAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGTC‑CACGTTTGCGCTCATCCATGAAGCAAAAATGTCAGGTCGAGGTCAATCCTAt < 1:674290/150‑1 (MQ=38) cAGCAAGGCTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGAAGTAAAAATGTCAGGTCgg > 1:810864/1‑138 (MQ=255) cAGCAAGGCTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGAAGTAAAAATGTCAGGTCgg < 2:810864/138‑1 (MQ=255) aGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGAAGTAAAAATGTCAGGTCGGGGTCAATCCTa > 1:2009410/1‑148 (MQ=255) aGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGAAGTAAAAATGTCAGGTCGGGGTCAATCCTa < 2:2009410/148‑1 (MQ=255) | GGTGATTGCCACGCGGTGCTTCTTGCCGGCGGCGGTAACCGGCGACAAGGTCTGGCGGAAGAAGTCGGCGATGCCGGGTGGAATGGTGTCGTTGACCAGCCCGGTGAGGTAGAAGGTGGCATTGGCCTGCGGGTCGAGGTCGACCAGCAAGGTTCGGTAGCCCTCGGCGGCGCTGGCAGCGGCGAGGTTGCAGGCGATGCTGGATTTGCCGACGCCACCTTTCTGATTGAAAACCACACGACGCATG‑AGACGCTCATCCATGAAGTAAAAATGTCAGGTCGGGGTCAATCCTAT > NC_002947/2758946‑2759239 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |