| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 236,388 | C→G | 5.5% | L149L (CTG→CTC) | argH ← | argininosuccinate lyase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 236,388 | 0 | C | G | 5.5% | 285.4 / 5.0 | 90 | L149L (CTG→CTC) | argH | argininosuccinate lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (46/39); new base G (3/2); total (49/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
GCGCTTGCGGCAGTCGACCAGGCGCTCATAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGTTGCGGCTACGCCCAGTATGCAGCTTCTTGCCGGTGATGCCGATGCGGTCGGTCAGGCG > NC_002947/236241‑236537 | gcgcTTGCGGCAGTCGACCAGGCGCTCATAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCcag > 1:397935/1‑150 (MQ=255)gcgcTTGCGGCAGTCGACCAGGCGCTCATAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCcag > 2:2409891/1‑150 (MQ=255)gcgcTTGCGGCAGTCGACCAGGCGCTCATAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCcag > 1:418828/1‑150 (MQ=255) cGGCAGTCGACCAGGCGCTCATAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGccc > 1:1211964/1‑150 (MQ=255) cAGTCGACCAGGCGCTCATAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCctgc < 2:2163439/150‑1 (MQ=255) cAGTCGACCAGGCGCTCATAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCctgc < 2:286662/150‑1 (MQ=255) cAGTCGACCAGGCGCTCATAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCCGCCTGCTGGAGCAGGcagagc < 1:1017177/150‑6 (MQ=255) gTCGACCAGGCGCTCATAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGTTGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCctgctg > 1:1071455/1‑150 (MQ=255) aCCAGGCGCTCATAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAgg > 1:935230/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGCTCATAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGc > 1:882337/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCTCATAGTCGCAACAGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGTTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCg > 2:217051/1‑150 (MQ=255) aGGCGCTCATAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCTGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCgg < 1:1209903/150‑1 (MQ=255) tCATAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTTCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGGGGGTGAtt > 2:1142782/1‑150 (MQ=255) tCATAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCgg > 1:1585356/1‑144 (MQ=255) tCATAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCgg < 2:1585356/144‑1 (MQ=255) tCATAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGAtt < 2:418828/150‑1 (MQ=255) tCATAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTACAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGAtt > 1:2177331/1‑150 (MQ=255) aTAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTc > 1:1501486/1‑150 (MQ=255) ggTCGCGGCTGAGCATTTCGACCCACGCCAGCAGGTGGTGGCAAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGc < 2:1656492/149‑1 (MQ=255) gAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGAAGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAg < 2:342004/150‑1 (MQ=255) gCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGTTGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGt < 2:1071455/150‑1 (MQ=255) acATTGCTAACCACGCTCGTAACTGGTGGCCCACGGTCCCCGGCTGCGCGGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCATGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGt < 2:397935/149‑1 (MQ=255) cATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTc > 1:1493766/1‑150 (MQ=255) cACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGc < 2:1391690/127‑1 (MQ=255) cACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGc > 1:1391690/1‑127 (MQ=255) cACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTtcgtcg > 2:969354/1‑150 (MQ=255) aCGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTcgc > 2:539343/1‑150 (MQ=255) aCGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTcgc < 2:1211964/150‑1 (MQ=255) gCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCgcgc > 1:76383/1‑150 (MQ=255) gtggtgGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGc‑cc < 2:741936/118‑1 (MQ=255) gtggtgGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGc‑cc > 1:741936/1‑118 (MQ=255) tggtggCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAgg > 1:1930814/1‑150 (MQ=255) gtggCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCg < 1:2409891/150‑1 (MQ=255) gtggCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCg < 1:1840734/150‑1 (MQ=255) ggCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGa < 1:969354/150‑1 (MQ=255) ttcaGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGt > 1:85022/4‑150 (MQ=255) cAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGGAGGTGGGTCAAACCAGGCATGATGAGGTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGCTCGTTGCCGTCGCGCGGCGTGAGGTGGATgg > 2:338996/1‑149 (MQ=255) cAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGc > 2:281671/1‑108 (MQ=255) cAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGc < 1:281671/108‑1 (MQ=255) cAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGCGTGACGA‑CGGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGt > 1:1330038/1‑150 (MQ=255) cAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCgg < 1:1803528/146‑1 (MQ=255) cAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCgg > 2:1803528/1‑146 (MQ=255) cAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGt > 1:301568/1‑150 (MQ=255) aaaGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTc > 1:1136896/1‑150 (MQ=255) aaaGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGCCTTCACGCTCTGCCTGCACCAGTAGGCCCTGCTCCCGCCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCGGCCAACGGCCGATGTc > 2:1068442/1‑150 (MQ=255) ggTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGt < 1:948249/150‑1 (MQ=255) ggTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGt > 2:143237/1‑150 (MQ=255) ggTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGt < 1:104990/150‑1 (MQ=255) ggTGACCGGCTGCGACGTCTGCAGGTGGGTGGACCCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTTCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGt < 2:1330038/150‑1 (MQ=255) ggCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCcagc > 2:1014124/1‑69 (MQ=255) ggCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCcagc < 1:1014124/69‑1 (MQ=255) cgcCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTc > 2:463797/1‑150 (MQ=255) gcCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGt < 2:918579/137‑1 (MQ=255) gcCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGt > 1:918579/1‑137 (MQ=255) ccGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGAtt < 2:2123256/86‑1 (MQ=255) ccGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGAtt > 1:2123256/1‑86 (MQ=255) ccGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGt < 2:2177331/150‑1 (MQ=255) 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gTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGTTGCGGCTACGCCCAGTATGCAGCTTCTTGCCg > 1:554125/1‑150 (MQ=255) tttCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAGAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGTTGCGGCTACGCCCAGTATGCAGCTTCTTGCCgg > 1:603556/1‑150 (MQ=255) ttCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCa < 1:2352990/101‑1 (MQ=255) ttCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCa > 2:2352990/1‑101 (MQ=255) aCGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGTTGCGGCTACGCCCAGTATGCAGCTTCTTGCCGGTGATGCCGAt < 1:2263074/150‑1 (MQ=255) gCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGTTGCGGCTACGCCCAGTATGCAGCTTCTTGCCGGTGATGCCGATGc > 2:2258452/1‑150 (MQ=255) tctGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGTTGCGGCTACGCCCAGTATGCAGCTTCTTGCCGGTGATGCCGATGcgc < 2:1649338/150‑2 (MQ=255) gggcctgcTGGAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGc > 1:1064066/3‑78 (MQ=255) gggcctgcTGGAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGc < 2:1064066/76‑1 (MQ=255) gggcctgcTGGAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGTTGCGGCTACGCCCAGTATGCAGCTTCTTGCCGGTGATGCCGATGcggt > 2:1248480/3‑150 (MQ=255) ggcctgcTGGAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGTTGCGGCTACGCCCAGTATGCAGCTTCTTGCCGGTGATGCCGATGcggtc > 2:2336371/2‑150 (MQ=255) gcctgcTCCAGCAATCCCTTCTGAAGGCGCGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCTCCCATCCAAAGGCGTATGTCGGTCGCCACCTTTTCGTTGCAGCTACGCTCAGTATTCAGCTTCTTGCCCTTTATGCCGATGcggtcg < 2:178210/150‑1 (MQ=255) cctgcTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCAcc < 2:1315135/92‑1 (MQ=255) cctgcTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCAcc > 1:1315135/1‑92 (MQ=255) cctgcTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGTTGCGGCTACGCCCAGTATGCAGCTTCTTGCCGGTGATGCCGATGcggtcgg > 2:2326265/1‑150 (MQ=255) cctgcTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGTTGCGGCTACGCCCAGTATGCAGCTTCTTGCAGGTGATGCCGATGcggtcgg > 1:1291689/1‑150 (MQ=255) ccgccTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGTTGCGGCTACGCCCAGTATGCAGCTTCTTGCCGGTGATGCCGATGcggtcgg > 1:1493895/5‑150 (MQ=255) tgcTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGTTGCGGCTACGCCCAGTATGCAGCTTCTTGCCGGTGATGCCGATGCggtcggtc > 2:2050015/1‑150 (MQ=255) tCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGtt > 2:1992518/1‑95 (MQ=255) tCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGtt < 1:1992518/95‑1 (MQ=255) cagcagGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGTTGCGGCTACGCCCAGTATGCa < 2:347863/113‑1 (MQ=255) cagcagGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGTTGCGGCTACGCCCAGTATGCa > 1:347863/1‑113 (MQ=255) cagcagGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGTTGCGGCTACGCCCAGTATGCAGCTTCTTGCCGGTGATGCCGATGCGGTCGGTCAGGCg > 1:707797/1‑150 (MQ=255) cagcagGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGTTGCGGCTACGCCCAGTATGCAGCTTCTTGCCGGTGATGCCGATGCGGTCGGTCAGGCg > 2:2095672/1‑150 (MQ=255) | GCGCTTGCGGCAGTCGACCAGGCGCTCATAGTCGCGGCTGAGCATTTCGAACCACGCCAGCAGGTGGTGGCCAAAGGTGACCGGCTGCGCCGTCTGCAGGTGGGTGAAACCAGGCATGATGGTTTCGGCTTCACGCTCTGCCTGCTCCAGCAGGCCCTGCTGCAGGCGGGTGATTTCGC‑CCAGGATCAGGTCGATTTCGTCGCGCAGCCAAAGGCGGATGTCGGTGGCCACCTGGTCGTTGCGGCTACGCCCAGTATGCAGCTTCTTGCCGGTGATGCCGATGCGGTCGGTCAGGCG > NC_002947/236241‑236537 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |