Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,884,856 | C→G | 5.2% | P93R (CCG→CGG) ‡ | PP_2540 → | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,884,856 | 0 | C | G | 5.2% | 375.7 / 8.9 | 116 | P93R (CCG→CGG) ‡ | PP_2540 | short‑chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (50/60); new base G (4/2); total (54/62) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.15e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.32e-01 |
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
TGGAGCAGACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAATATCACCTCCGG > NC_002947/2884709‑2885003 | gAGCAGACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCa > 1:2218213/1‑150 (MQ=255) aCCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGTCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCgggg < 1:219373/150‑1 (MQ=255) aCCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCgggg < 1:954436/150‑1 (MQ=255) ccGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCGGGCCACCggcgt < 2:877820/150‑4 (MQ=255) cGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGa > 1:411358/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCgggg < 2:857915/147‑1 (MQ=255) gCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCgggg > 1:857915/1‑147 (MQ=255) cAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACtt < 2:1864170/150‑1 (MQ=255) gAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACACTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGt < 2:1751319/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGAtt < 2:1549499/150‑1 (MQ=255) gcgcAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTg < 1:14047/150‑1 (MQ=255) cgcAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTgg < 1:1215877/150‑1 (MQ=255) cAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTgggg > 2:2141539/1‑150 (MQ=255) gggCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGc < 2:2113654/150‑1 (MQ=255) gggCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCAACCTGGGGATTTCCGTGATTGGGGGc > 1:611195/1‑150 (MQ=255) gCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGTAGCTGGCAACCGGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGt < 2:63424/150‑1 (MQ=255) tGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGtgat < 1:287040/150‑1 (MQ=255) cGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACt > 2:1142378/1‑150 (MQ=255) ggAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTgg < 2:259675/150‑1 (MQ=255) aaTCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGt < 1:1772286/127‑1 (MQ=255) aaTCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGt > 2:1772286/1‑127 (MQ=255) tCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGa < 2:178457/150‑1 (MQ=255) cGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGaa < 2:411358/150‑1 (MQ=255) cGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGaa < 1:1703499/150‑1 (MQ=255) aGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAgg > 1:1873784/1‑150 (MQ=255) gTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGt < 1:2249065/132‑1 (MQ=255) gTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGt > 2:2249065/1‑132 (MQ=255) cATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGATTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTg < 2:611195/150‑1 (MQ=255) aCCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGAc < 2:1291904/150‑1 (MQ=255) gTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGcc < 1:202364/150‑1 (MQ=255) tGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTg < 1:1175254/143‑1 (MQ=255) tGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTg > 2:1175254/1‑143 (MQ=255) aGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCgggg > 1:685660/1‑97 (MQ=255) aGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCgggg < 2:685660/97‑1 (MQ=255) ggCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCCGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATg < 2:1873784/150‑1 (MQ=255) ggCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTgggg < 1:1471594/113‑1 (MQ=255) ggCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTgggg > 2:1471594/1‑113 (MQ=255) gATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTc > 2:448781/1‑150 (MQ=255) gTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACg < 1:2141539/150‑1 (MQ=255) ttGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCTCGCGACTGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGTGGGATGAGTGGCGGTAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGc < 1:974989/150‑1 (MQ=255) ttGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGc > 2:1431512/1‑150 (MQ=255) ttGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGGGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGc > 2:1177855/1‑150 (MQ=255) ttGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCT‑GTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGcc > 1:847326/1‑150 (MQ=255) ttGCAGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGGCAGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTGCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGc < 1:22102/150‑1 (MQ=255) cGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGc < 1:2065622/140‑1 (MQ=255) cGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGc > 2:2065622/1‑140 (MQ=255) gATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATc > 1:1941203/1‑150 (MQ=255) gATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATc > 1:1708484/1‑150 (MQ=255) cccAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGt < 2:1814793/102‑1 (MQ=255) cccAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGt > 1:1814793/1‑102 (MQ=255) cAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTgg < 2:268549/109‑1 (MQ=255) cAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCt > 1:1392203/1‑150 (MQ=255) cAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCt > 1:12843/1‑150 (MQ=255) cAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCt > 1:639759/1‑150 (MQ=255) aaGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGa > 2:22271/1‑112 (MQ=255) aaGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGa < 1:22271/112‑1 (MQ=255) gcCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGc > 2:1381661/1‑141 (MQ=255) gcCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGc < 1:1381661/141‑1 (MQ=255) cAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCg > 1:1417276/1‑150 (MQ=255) gcgcTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCggtt > 1:965545/1‑149 (MQ=255) gTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACACTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCTTGATTgggg < 2:222772/78‑1 (MQ=255) ttGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATGGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGat > 2:612230/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATTCAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGatg < 1:2366656/150‑1 (MQ=255) gcggcCTGCCCGAAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGatgac > 1:488033/1‑148 (MQ=255) ggcCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGatggcat < 2:1941203/150‑1 (MQ=255) gcCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGatggcatg < 2:1098750/150‑1 (MQ=255) ccTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGatggcatgg > 1:1595655/1‑150 (MQ=255) ccTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGatggcatgg < 2:708031/150‑1 (MQ=255) ccTGCCCGCAGGTCGACATTCT‑GTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGatggcatggc < 2:847326/150‑1 (MQ=255) cTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGatggcatggc > 1:121345/1‑150 (MQ=255) tGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGcc < 2:1595655/150‑1 (MQ=255) ccGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAg > 1:2002998/1‑150 (MQ=255) cGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGACATGGCCGAGc > 2:852149/1‑150 (MQ=255) cGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTACat < 1:2405426/137‑1 (MQ=255) aGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCCCCGTGGTTCATCCTTTATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTg < 1:1142378/150‑1 (MQ=255) aGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGACATGGCCGAGCGTg < 1:852149/150‑1 (MQ=255) gTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGaa < 2:1442931/77‑1 (MQ=255) gTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGt > 2:306171/1‑150 (MQ=255) gTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGt > 1:1451237/1‑150 (MQ=255) tCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTgg > 1:2268542/1‑56 (MQ=255) tCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTgg < 2:2268542/56‑1 (MQ=255) tCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGtt < 1:448781/150‑1 (MQ=255) cTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTTGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCgg < 2:965545/150‑1 (MQ=255) gTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGggtg > 1:1942738/1‑150 (MQ=255) caacaaCGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGc > 2:1824867/1‑98 (MQ=255) caacaaCGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGc < 1:1824867/98‑1 (MQ=255) aacaacGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCACCCGGCCACCTCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGCGCGTGGTTTTGGCCGGgtggtg > 1:760661/1‑150 (MQ=255) aacaacGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCgg > 2:2323919/1‑144 (MQ=255) aacaacGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCgg < 1:2323919/144‑1 (MQ=255) caacGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGaa < 2:1942738/150‑1 (MQ=255) ccccGGTGGCGGGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGatggcatg > 2:1207510/3‑118 (MQ=255) ccccGGTGGCGGGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGatggcatg < 1:1207510/116‑1 (MQ=255) ccccGGTGGCGGGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAatat > 1:2144189/3‑150 (MQ=255) cccGGTGGCGGGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAatacc > 2:1977420/2‑148 (MQ=255) ccGGTGGCGGGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAATATCa > 2:1473633/1‑150 (MQ=255) gCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGat > 1:2227349/1‑104 (MQ=255) gCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGat < 2:2227349/104‑1 (MQ=255) gCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAATATCACCTCCg > 2:1966330/1‑150 (MQ=255) cccGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAATATCACCTCCgg > 2:2207725/1‑150 (MQ=255) ccGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGaa > 1:1408224/1‑137 (MQ=255) | TGGAGCAGACCGCCAGCGAGTTGCGCAGGGCCTGCCCGGGAATCGAGGTCCATACCGTGGCAGGCGATGTTGCCGATCCCAAGGTGCGCCAGGCGCTGTTGGCGGCCTGCCCGCAGGTCGACATTCTGGTCAACAACGCCGGTGGCCCGCCACCGGGGGACTTCCGTGATTGGGGGCGTGATGACTGGCTGAAGGCGCTGGACGCCAACATGCTCACGCCCATCGAGCTGATCAAGGCGGTGGTAGATGGCATGGCCGAGCGTGGTTTTGGCCGGGTGGTGAATATCACCTCCGG > NC_002947/2884709‑2885003 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |