| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,891,846 | A→T | 10.6% | L13Q (CTG→CAG) | PP_2546 ← | membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,891,846 | 0 | A | T | 10.6% | 221.6 / 14.4 | 76 | L13Q (CTG→CAG) | PP_2546 | membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/36); new base T (3/5); total (34/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.34e-01 | |||||||||||
GGTTTTCCCAGGTGGTGAGCGGGCAGCCCAGGTGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGAAAGTCGCCACCACCCGGCGCGTACGC > NC_002947/2891697‑2891995 | ggTTTTCCCAGGTGGTGAGCGGGCAGTCCAGGTGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCCGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGAAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTgca < 2:382898/150‑1 (MQ=255)ggTTTTCCCAGGTGGGGAGCGGGCAGCCGAGGTGCAGGCACTCCGCCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACATGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTgca < 2:1736828/150‑1 (MQ=255) gTTTTCCCAGGTGGTGAGCGGGCAGCCCAGGTGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTgcag > 1:895733/1‑150 (MQ=255) gTTTTCCCAGGTGGTGAGCGGGCAGCCCAGGTGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTgcag < 1:358772/150‑1 (MQ=255) cccAGGTGGTGAGCGGGCAGCCCAGGTGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCAGTCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTgcagcagca > 1:1043937/1‑150 (MQ=255) ccAGGTGGTGAGCGGGCAGCCCAGGTGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCAc > 1:408429/1‑150 (MQ=255) ccAGGTGGTGAGCGGGCAGCCCAGGTGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCAc < 2:670383/150‑1 (MQ=255) gtggtgAGCGGGCAGCCCAGGTGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAgg < 2:1866941/150‑1 (MQ=255) tggtgAGCGGGCAGCCCAGGTGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCTGCTGCACCTggc < 2:1252253/150‑2 (MQ=255) gtgAGCGGGCAGCCCAGGTGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGgtg > 1:13787/1‑150 (MQ=255) gggCAGCCCAGGTGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTcggcg < 2:2214231/150‑1 (MQ=255) gCAGCCCAGGTGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCggcggc > 1:1752467/1‑150 (MQ=255) gCCCAGGTGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAg < 2:391524/150‑1 (MQ=255) ccAGGTGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGc > 2:805993/1‑150 (MQ=255) aGGTGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCgg > 2:2192736/1‑150 (MQ=255) gTGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCaa > 1:1534045/1‑143 (MQ=255) gTGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCaa < 2:1534045/143‑1 (MQ=255) tGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTag > 1:353760/1‑150 (MQ=255) ggCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTaga > 1:248580/1‑147 (MQ=255) ggCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTaga < 2:248580/147‑1 (MQ=255) gCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAggacggc > 1:1741990/1‑139 (MQ=255) gCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAggacggc < 2:1741990/144‑6 (MQ=255) cACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCATGTCGAACAGCAACCGGAAGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCAtg < 1:1500083/150‑1 (MQ=255) aCTCCACCGCCAGGCCCCAGTCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCAtgg < 2:1043937/150‑1 (MQ=255) tCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTgca > 2:586797/1‑109 (MQ=255) tCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTgca < 1:586797/109‑1 (MQ=255) tCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCCtgggt > 2:869065/1‑150 (MQ=255) aCCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCAtgggttgg < 1:2192736/150‑1 (MQ=255) ccccaggccAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCggg > 2:1983541/1‑150 (MQ=255) ccccaggccAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCggg < 2:2160760/150‑1 (MQ=255) cccaggccAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTgcag > 1:1239209/1‑97 (MQ=255) cccaggccAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTgcag < 2:1239209/97‑1 (MQ=255) cccaggccAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCgggg > 1:1784375/1‑150 (MQ=255) ccaggccaggACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGa > 2:513919/1‑150 (MQ=255) cggccaggCCCCGCAAGTCACGCAAACGGCCGCGGCGGCAGCGCAGCTGGATCATCCCGCCGAGCATTACCAGCATGAGGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGAtt > 2:1233374/2‑150 (MQ=255) ccaggACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTggg < 1:1838102/150‑1 (MQ=255) ccaggACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTggg < 1:1983541/150‑1 (MQ=255) ccaggACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTggg < 1:2314611/150‑1 (MQ=255) caggACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAg < 2:90495/99‑1 (MQ=255) caggACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAg > 1:90495/1‑99 (MQ=255) aggACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGt > 1:1527305/1‑150 (MQ=255) aaGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGc < 2:408429/150‑1 (MQ=255) caACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTgg < 2:614663/150‑1 (MQ=255) aCAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCgg < 1:1248127/121‑1 (MQ=255) aCAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCgg > 2:1248127/1‑121 (MQ=255) cagggcagggCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCGTAGTTGGGtt < 2:2127262/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGccggtcct < 2:1527305/150‑7 (MQ=255) cgcCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCAACAGGAGGAGGAAGGACAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTg < 2:193896/150‑1 (MQ=255) gcCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTgg > 2:1806605/1‑150 (MQ=255) cAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCTGGTGCTGCTGCACCTggc < 2:454734/67‑2 (MQ=37) gcagcaCCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTaca > 2:2385821/1‑150 (MQ=255) agcaCCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGt > 1:1758700/1‑111 (MQ=255) agcaCCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGt < 2:1758700/111‑1 (MQ=255) caCCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACAcccc < 1:1806605/150‑1 (MQ=255) ccAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCtt > 2:479385/1‑150 (MQ=255) gcagcCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCt > 1:462545/1‑150 (MQ=255) cccGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTAGAc > 1:1809304/1‑150 (MQ=255) cccGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGACGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGAc < 1:869065/150‑1 (MQ=255) ccgccgAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTacac > 2:1713583/1‑137 (MQ=255) ccgccgAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTacac < 1:1713583/137‑1 (MQ=255) ccgccgAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGAcc < 2:353760/150‑1 (MQ=255) cgccgAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGAGTTGGGTGCCCGGGGGTTGGGGTGATCCCAGTAGAGGTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCa > 2:880033/1‑150 (MQ=255) ccgAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATc < 2:895733/150‑1 (MQ=255) cgAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCt < 1:805993/150‑1 (MQ=255) cgAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCt > 2:2403690/1‑150 (MQ=255) cAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAg < 1:1156032/150‑1 (MQ=255) agcagcagGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCGTCCTCGACCATCTGCAGGaaa < 2:564637/148‑1 (MQ=255) aCCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGaaa < 2:1193290/150‑1 (MQ=255) aCCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGaaa < 2:462545/150‑1 (MQ=255) aCCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGaaa < 2:1752467/150‑1 (MQ=255) aCCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGaaa < 1:479385/150‑1 (MQ=255) aCCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGCTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGaaa < 2:71234/150‑1 (MQ=255) cagcagGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCa < 1:590601/92‑1 (MQ=255) cagcagGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCa > 2:590601/1‑92 (MQ=255) cagGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGCGAATGAGATGGGTGCCTGGGGGTGGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGAAAGTCGc > 1:2100830/1‑150 (MQ=255) gttaTGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGAAAGTCGcc > 1:1893158/4‑150 (MQ=255) gATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGAAAGTCGccac > 1:1742188/1‑150 (MQ=255) gAAGGCCAGGTGCAACAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGAAAGTCGCcaccac > 2:2022857/1‑150 (MQ=255) cctggTGCTGCTGCACCTGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGaaa < 1:716375/131‑1 (MQ=255) cctggTGCTGCTGCACCTGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGACTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGaaa > 2:716375/4‑134 (MQ=255) cctggTGCTGCTGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTggg < 1:1116397/66‑1 (MQ=255) cctggTGCTGCTGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTggg > 2:1116397/4‑69 (MQ=255) cctggTGCTGCTGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGAAAGTCGc < 2:101565/136‑1 (MQ=255) cctggTGCTGCTGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGAAAGTCGc > 1:101565/4‑139 (MQ=255) ccAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGAAAGTCGCCACCACCCGgc < 2:43618/150‑1 (MQ=255) gcagcagcaCCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGAAAGTCGCCACCACCCGGCGCGTAc > 1:1944653/1‑150 (MQ=255) agcggcaCCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCGCAGCATACTTGGGTGGCCTGATCTGGCCTACACGCCTTGCTCGACTATCTGCACGAAAGTCGCCACCACCCGGCGCGTACgc > 2:2370233/1‑150 (MQ=255) agcagcaCCAGGGTGTCGGCGGCAGGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGAAAGTCGCCACCACCCGGCGCGTACgc < 1:880033/150‑1 (MQ=255) agcagcaCCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGAAAGTCGCCACCACCCGGCGCGTACgc > 1:949254/1‑150 (MQ=255) | GGTTTTCCCAGGTGGTGAGCGGGCAGCCCAGGTGCAGGCACTCCACCGCCAGGCCCCAGGCCAGGACCGGCAAGTGCAGCAACAGGGCAGGGCGCCAGCGCAGCACCAGCAGCCCGCCGAACAGCACCAGCAGGATGAAGGCCAGGTGCAGCAGCACCAGGGTGTCGGCGGCAAGGCGGTAGAGCATGGGTTGGGTGCCCGGGGATTGGGGTTATCCCAGCATAGTTGGGTTGCCTGATCTGGCCTACACCCCTTCCTCGACCATCTGCAGGAAAGTCGCCACCACCCGGCGCGTACGC > NC_002947/2891697‑2891995 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |