| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,908,028 | G→A | 5.5% | A237V (GCC→GTC) | hasE ← | secretion metalloprotease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,908,028 | 0 | G | A | 5.5% | 269.2 / 4.6 | 90 | A237V (GCC→GTC) | hasE | secretion metalloprotease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (45/40); new base A (2/3); total (47/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.01e-01 | |||||||||||
CAAGCGGTCGGCCAGGGTGGTGTTTTCCTTGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGAGGAAGCCGATCTGCGAGGCGCGGGCGCCGTACACCTGC > NC_002947/2907880‑2908174 | cAAGCGGTCGGCCAGGGTGGTGTTTTCCTTGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGc < 2:2306276/150‑1 (MQ=255) aaGCGGTCGGCCAGGGTGGTGTTTTCCTTGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGcc > 1:2374872/1‑150 (MQ=255) gCGGTCGGCCAGGGTGGTGTTTTCCTTGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTg < 2:2278243/150‑1 (MQ=255) ggTCGGCCAGGGTGGTGTTTTCCTTGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGc > 2:1555875/1‑150 (MQ=255) ggCCAGGGTGGTGTTTTCCTTGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCcggc < 1:2305792/150‑1 (MQ=255) gcccAGGGTGGTGTTTTCCTTGGCGGTATCGGTCAGTTGCGTCTCCTCCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCTCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCcggc < 2:299046/148‑1 (MQ=255) ccAGGGTGGTGTTTTCCTTGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCcggcgg < 1:1193213/150‑1 (MQ=255) cAGGGTGGTGTTTTCCTTGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGa < 2:955704/150‑1 (MQ=255) gtggtgTTTTCCTTGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAgg > 1:1292431/1‑150 (MQ=255) tggtgTTTTCCTTGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGt > 1:1248355/1‑150 (MQ=255) ggtgTTTTCCTTGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGACCTGTCCGCCGGCCAggcc < 1:1059134/150‑3 (MQ=255) gtgtTTTCCTTGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCGCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCg < 1:738590/150‑1 (MQ=255) tgtTTTCCTTGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCgg > 2:1816120/1‑150 (MQ=255) ttttCCTTGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGACCTGTCCGCCGGCCAggccgaa > 1:1777691/1‑144 (MQ=255) ttttCCTTGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGACCTGTCCGCCGGCCAggccgaa < 2:1777691/149‑6 (MQ=255) cTTGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCCGGCTGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATtgct < 1:23718/150‑1 (MQ=255) ttGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATtgctg > 1:1402695/1‑150 (MQ=255) ttGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGAAAAAAAACAAGTCGGCATtgctg > 2:1641968/1‑150 (MQ=255) tGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATtgctgc < 1:2336659/150‑1 (MQ=255) ggCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCg < 2:1727225/150‑1 (MQ=255) cGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGtt > 1:1539581/1‑150 (MQ=255) aTCGGTCAGTTGCGTCTCCTCCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTtccag < 1:1200335/150‑1 (MQ=255) aTCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCGTGGCTGCGCGCGCTTGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTtccag < 1:900736/150‑1 (MQ=255) ggTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTtccagctc < 1:941092/150‑1 (MQ=255) gTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTtccagctcc < 2:1248355/150‑1 (MQ=255) gTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTtccagctcc > 1:1243036/1‑150 (MQ=255) gTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTAGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCcagca > 2:989139/1‑150 (MQ=255) ttGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCcagcag > 1:756336/1‑150 (MQ=255) gCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGc < 2:756336/150‑1 (MQ=255) tCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACa > 1:984703/1‑112 (MQ=255) tCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACa < 2:984703/112‑1 (MQ=255) tCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTtcca < 2:932908/133‑1 (MQ=255) tCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTtcca > 1:932908/1‑133 (MQ=255) ccACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCAGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGc > 2:1348402/1‑150 (MQ=255) ccctgctTCAGGTAGTCGTGCTGGGCGC‑GCAGATTGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCgg < 2:1344419/149‑1 (MQ=255) aCCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCTGCTTGATCCCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCgg < 1:231103/150‑1 (MQ=255) aCCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCgg > 1:728894/1‑150 (MQ=255) aCCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCgg < 2:1292431/150‑1 (MQ=255) aCCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCgg < 1:1816120/150‑1 (MQ=255) aCCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGACTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGATCCAGCAGGCGGTTGCgg > 2:1670945/1‑150 (MQ=255) cctcctTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCggg < 2:1402695/150‑1 (MQ=255) cctcctTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCggg > 1:71782/1‑150 (MQ=255) cctcctTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCggg > 2:1619865/1‑150 (MQ=255) cctcctTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAACTCCAGCAGGCGGTTGCggg < 2:2374872/150‑1 (MQ=255) cctTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTa > 1:906626/1‑150 (MQ=255) ttCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACa > 2:31218/1‑150 (MQ=255) cT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCgg > 2:1598913/1‑124 (MQ=255) cT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCgg < 1:1598913/124‑1 (MQ=255) gcTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGc > 2:1441300/1‑75 (MQ=255) gcTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGc < 1:1441300/75‑1 (MQ=255) gCAGAATAAGCAGCTTGATCTCGGTGGCCGGGCTGCTCGCCCGGGCAATGTTGGTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTACGTTCCAGCTCCAGTAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGAccc > 2:1955350/1‑150 (MQ=255) gcAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCCATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGATGACAGGACCGAATTTCTGCGTTTCATCTCCAGCAGGCAGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGAACCCGGGTGCCtt > 1:1097926/1‑150 (MQ=255) gcAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCtt > 1:2075399/1‑150 (MQ=255) gCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCtt < 2:773673/147‑1 (MQ=255) gCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCtt > 1:773673/1‑147 (MQ=255) cTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAg > 1:1319335/1‑150 (MQ=255) gATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCtt < 1:1349992/143‑1 (MQ=255) gATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCtt > 2:1349992/1‑143 (MQ=255) gATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGACCTGTCCGCCGGCCAggc < 2:215328/68‑2 (MQ=37) gATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGACCTGTCCGCCGGCCAggc > 1:215328/1‑67 (MQ=37) tctcGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCt > 2:620003/1‑150 (MQ=255) ctcGGTGGCCTGGCTGCGCGCACGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGAACAAGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTg > 2:1148627/1‑150 (MQ=255) gTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTCGCAAGACACATAGCCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTg < 1:1641968/150‑1 (MQ=255) tGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGa < 1:1619865/150‑1 (MQ=255) ccTGGCTGCGCGCCAGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCCTTACTGTGTGCCAGCTCCAGCAGGCGGATGCGGGGTTCATATCATTCGGGGGCCAGGACCGGGGTGCCTTGCAGTTACTCGTTTAGGa > 2:259200/1‑150 (MQ=255) cTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTtccagctccagc > 2:1588546/1‑82 (MQ=255) cTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTtccagctccagc < 1:1588546/82‑1 (MQ=255) cTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGtt > 2:149548/1‑90 (MQ=255) cTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGtt < 1:149548/90‑1 (MQ=255) cTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGAGGaa < 2:728894/150‑1 (MQ=255) cTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGAGGaa > 1:375013/1‑150 (MQ=255) cTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGAGGaa < 1:1819578/150‑1 (MQ=255) tGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTAc > 2:1162622/1‑98 (MQ=255) tGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTAc < 1:1162622/98‑1 (MQ=255) cgcgcCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGAGGAAGCCGATc > 1:1224621/1‑150 (MQ=255) cGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGAGGAAGACGATCTGCGaa < 2:1243036/150‑2 (MQ=255) gggCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGAGGAAGCCGATCTGCGAgg > 1:1434648/1‑150 (MQ=255) ggCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCa < 1:1304022/119‑1 (MQ=255) ggCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCa > 2:1304022/1‑119 (MQ=255) ggCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGAGGAAGCCGATCTGCGAGgc > 1:1579903/1‑150 (MQ=255) ggCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGAGGAAGCCGATCTGCGAGgc > 2:1879881/1‑150 (MQ=255) aTGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGAGGAAGCCGATCTGCGAGGCGCgg < 1:989139/150‑1 (MQ=255) ttgAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGAGGAAGCCGATCTGCGAGGCGCggg > 2:2064543/1‑145 (MQ=255) ttgAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGAGGAAGCCGATCTGCGAGGCGCggg < 1:2064543/145‑1 (MQ=255) ttgAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGAGGAAGCCGATCTGCGAGGCGCGGGCGCCg < 2:1579903/150‑1 (MQ=255) ggTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGCCCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGAGGAAGCCGATCTGCGAGGCGCGGGCGCCGTacc > 1:1176738/1‑149 (MQ=255) ggTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGAGGAAGCCGATCTGCGAGGCGCGGGCGCCGTaca > 1:1095607/1‑150 (MQ=255) ggTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTACGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTGCATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCGGGTCCTGGTTGAGGAGGCGGATCTTCGAGGCGCGGGCGCCGTaca > 1:1111022/1‑150 (MQ=255) gTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGAGGAAGCCGATCTGCGAGGCGCGGGCGCCGTacac > 2:672156/1‑150 (MQ=255) tCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGAGGAAGCCGATCTGCGAGGCGCGGGCGCCGTACACctgc < 1:347109/150‑1 (MQ=255) | CAAGCGGTCGGCCAGGGTGGTGTTTTCCTTGGCGGTATCGGTCAGTTGCGACTCCACCTCCTTCAGGTAGTCGTGCT‑GGCGCTGCAGAATGCGCAGCTTGATCTCGGTGGCCTGGCTGCGCGCCCGGGCAATGTTGTTGAGGTTTTCGGCCTGGCCGGCGGACAGGTCGGCATTGCTGCGTTCCAGCTCCAGCAGGCGGTTGCGGGGTACATAACCTTCGGCGGCCAGGACCCGGGTGCCTTGCAGTTCCTGGTTGAGGAAGCCGATCTGCGAGGCGCGGGCGCCGTACACCTGC > NC_002947/2907880‑2908174 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |