Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,945,745 | A→G | 6.1% | K160R (AAG→AGG) | PP_2578 → | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,945,745 | 0 | A | G | 6.1% | 280.4 / 4.0 | 93 | K160R (AAG→AGG) | PP_2578 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (45/42); new base G (4/2); total (49/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.80e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ACGGTACCAGGGCGCTACGCCTCGCTGGAGGCCGTGTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTCCTGTACCCCGTCGGCCTTGTCCAGCGGCAGGTGGTCGAACTCGCGCAAGCCATTCTTGCG > NC_002947/2945597‑2945893 | acGGTACCAGGGCGCTACGCCTCGCTGGAGGCCGTGTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAg < 1:500802/150‑1 (MQ=255) gTACCAGGGCGCTACGCCTCGCTGGAGGCCGTGTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTg < 1:1187666/150‑1 (MQ=255) ggCGCTACGCCTCGCTGGAGGCCGTGTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACTTGCGCAGGTTGGcctg < 2:1167292/148‑3 (MQ=255) ggCGCTACGCCTCGCTGGAGGCCGTGTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACTTGCGCAGGTTGGcctg > 1:1167292/1‑146 (MQ=255) ggCGCTACGCCTCGCTGGAGGCCGTGTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAgg > 1:1983240/1‑150 (MQ=255) cTACGCCTCGCTGGAGGCCGTGTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGt < 2:663181/150‑1 (MQ=255) tACGCCTCGCTGGAGGCCGTGTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTg > 1:1501904/1‑150 (MQ=255) tACGCCTCGCTGGAGGCCGTGTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTg > 2:589982/1‑150 (MQ=255) ctggCTGGAGGCCGTGTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCgggg > 1:2400906/4‑150 (MQ=255) cTCGCTGGAGGCCGTGTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCgggg < 2:431141/150‑1 (MQ=255) cTCGCTGGAGGCCGTCTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCgggg < 1:950044/150‑1 (MQ=255) tCGCTGGAGGCCGTGTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAg < 1:1893743/129‑1 (MQ=255) tCGCTGGAGGCCGTGTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAg > 2:1893743/1‑129 (MQ=255) gCTGGAGGCCGTGTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAg > 1:1191234/1‑150 (MQ=255) gAGGCCGTGTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGcc < 2:1501904/150‑1 (MQ=255) gCCGTGTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCgg > 1:625395/1‑150 (MQ=255) cGTGTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCa < 2:1977183/150‑1 (MQ=255) gtgGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAggg < 2:1839886/150‑1 (MQ=255) tgGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGGCTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGt > 1:1868259/1‑150 (MQ=255) gcgcCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGTCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAg < 1:1665057/150‑1 (MQ=255) gcCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCAGAGGGGTGGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCt > 2:395608/1‑150 (MQ=255) ccTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAgg > 1:1969536/1‑119 (MQ=255) ccTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAgg < 2:1969536/119‑1 (MQ=255) cagcaAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCa < 2:123633/150‑1 (MQ=255) gcaAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACTTGCGCAGGTTGGcc < 1:1000503/106‑1 (MQ=255) gcaAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACTTGCGCAGGTTGGcc > 2:1000503/1‑106 (MQ=255) gcaAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTTGCCAAGGCGGTGCGGGGGGGCGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATg > 1:1717425/1‑150 (MQ=255) gggCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAAcc > 2:1358425/1‑150 (MQ=255) ggCAGGTC‑AGCTCGACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCt > 2:879728/1‑150 (MQ=255) aGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTgg < 2:1191234/150‑1 (MQ=255) ggTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACCGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGc < 1:614144/150‑1 (MQ=255) tCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCt > 2:1699453/1‑150 (MQ=255) aGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGAt < 1:1358425/150‑1 (MQ=255) aCCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAggg > 1:2322230/1‑116 (MQ=255) aCCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAggg < 2:2322230/116‑1 (MQ=255) cTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGcc > 2:2041793/1‑150 (MQ=255) cTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGcc > 1:1657604/1‑150 (MQ=255) tGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAgg > 2:1072632/1‑112 (MQ=255) tGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAgg < 1:1072632/112‑1 (MQ=255) tGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGACCCTTGGCCTGATTACTGCCg > 1:1931199/1‑150 (MQ=255) ccGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGcc > 2:387731/1‑82 (MQ=255) ccGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGcc < 1:387731/82‑1 (MQ=255) gTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGcc > 2:1343605/1‑101 (MQ=255) gTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGcc < 1:1343605/101‑1 (MQ=255) gTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGcc < 2:51133/101‑1 (MQ=255) gTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGcc > 1:51133/1‑101 (MQ=255) gTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGt < 2:2125843/110‑1 (MQ=255) gTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGt > 1:2125843/1‑110 (MQ=255) tACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGc < 2:1656284/78‑1 (MQ=255) tACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGc > 1:1656284/1‑78 (MQ=255) tACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTgc > 2:733139/1‑150 (MQ=255) cAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTgctggct < 2:625395/150‑1 (MQ=255) gTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGc > 2:1675587/1‑108 (MQ=255) gTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGc < 1:1675587/108‑1 (MQ=255) gTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTgctgg > 2:626486/1‑146 (MQ=255) gTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTgctgg < 1:626486/146‑1 (MQ=255) tGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGTAGGTTAGCTGCCTTGCATTAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGtt < 1:298208/150‑1 (MQ=255) aGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTcc > 2:229963/1‑150 (MQ=255) aGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTcc < 2:2400906/150‑1 (MQ=255) gACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTCCt < 1:2283228/150‑1 (MQ=255) gACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTCCt < 2:1774690/150‑1 (MQ=255) tgctgcGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGc > 1:655992/1‑74 (MQ=255) 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cAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTCCTGTACCCCGTCGGCCTTGTCCAGCg > 1:685424/1‑150 (MQ=255) tGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTCCTGTACCCCGTCGGCCTTGTCCAGCGGCAgg < 1:73363/150‑1 (MQ=255) tGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTCCTGTACCCCGTCGGCCTTGTCCAGCGGCAgg < 2:1931199/150‑1 (MQ=255) gcgcACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAAc < 1:1577980/77‑1 (MQ=255) gcgcACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAAc > 2:1577980/1‑77 (MQ=255) ccAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTCCTGTACCCCGTCGGCCTTGTCCAGCGGCAGGTGGTCGAACTcgc < 1:733139/150‑1 (MQ=255) tcggCCAACTTGCGCAGGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTCCTGTACCCCGTCGGCCTTGTCCAGCGGCAGGTGGTCGAACTcgcg > 1:154391/3‑150 (MQ=255) cAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTCCTGTACCCCGTCGGCCTTGTCCAGCGGCAGGTGGTCGAACTcgcg > 2:954324/1‑150 (MQ=255) cAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTCCTGTACCCCGTCGGCCTTGTCCAGCGGCAGGTGGTCGAACTcgcg > 1:2035324/1‑150 (MQ=255) aGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTCCTGTACCCCGTCGGCCTTGTCCAGCGGCAGGTGGTCGAACTCgcgc > 2:1247383/1‑150 (MQ=255) ggCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTCCTGTACCCCGTCGGCCTTGTCCAGCGGCAGGTGGTCGAACTCGCGCa > 1:862098/1‑150 (MQ=255) gCCAACTTGCGCAGGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGATGCTGGCTGTTTCCTGTACCCCGTCGGCCTTGTCCAGCGGCAGGTGGTCGAACTCGCGCaa > 2:2132130/1‑150 (MQ=255) cTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTCCTGTACCCCGTCGGCCTTGTCCCGCGGCAGGTGGTCGCACTCGCGCAACCCAtt > 2:188/1‑150 (MQ=255) cTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGATGGCTGTTTc > 2:1989401/1‑96 (MQ=255) cTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGATGGCTGTTTc < 1:1989401/96‑1 (MQ=255) cgcAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGACCCTTGGCCTGATTACTGGCGGGTGCTGGCTGTTTCATGTTCCCCGTCGGCCTTGTCCAGCGGCAGGTGGTCGAACTCGCGCAAGCCATTCtt < 1:898049/150‑1 (MQ=255) cAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTCCTGTACCCCGTCGGCCTTGTCCAGCGGCAGGTGGTCGAACTCGCGCAAGCCATTCTTGc < 2:2138813/150‑1 (MQ=255) cAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTCCTGTACCCCGTCGGCCTTGTCCAGCGGCAGGTGGTCGAACTCGCGCAAGCCATTCTTGc > 1:1651615/1‑150 (MQ=255) aaGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTc < 2:1068060/90‑1 (MQ=255) aaGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTc > 1:1068060/1‑90 (MQ=255) aaGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTCCTGTACCCCGTCGGCCTTGTCCAGCGGCAGGTGGTCGAACTCGCGCAAGCCATTCTTGCg < 2:1235544/150‑1 (MQ=255) aaGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTCCTGTACCCCGTCGGCCTTGTCCAGCGGCAGGTGGTCGAACTCGCGCAAGCCATTCTTGCg < 1:2041793/150‑1 (MQ=255) | ACGGTACCAGGGCGCTACGCCTCGCTGGAGGCCGTGTGGCGCCTGAAGCAGCAAGGGCAGGTCGAGCT‑GACCTGCCGTACGTCAGTGCAGACTGCTGCGGACAACAGCATCACCAGCCTGGTGAATGCGCACCAGGCCAACCTGCGCAAGTTGGCCGAGGCGGTGCGGGGGAGTGCCCGGCAGGGTAGCTGCCCTGCATGAACCTTGGCCTGATTACTGCCGGGTGCTGGCTGTTTCCTGTACCCCGTCGGCCTTGTCCAGCGGCAGGTGGTCGAACTCGCGCAAGCCATTCTTGCG > NC_002947/2945597‑2945893 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |