| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,949,839 | A→T | 6.9% | intergenic (+61/+52) | PP_2583 → / ← oguA | acetyltransferase/8‑oxoguanine deaminase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,949,839 | 0 | A | T | 6.9% | 313.5 / 9.4 | 101 | intergenic (+61/+52) | PP_2583/oguA | acetyltransferase/8‑oxoguanine deaminase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (46/48); new base T (3/4); total (49/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 | |||||||||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
TGTACCAGAAACTGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGCCAGCTGGCCGTCTTTCACCACGAC > NC_002947/2949690‑2949986 | tGTACCAGAAACTGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACTGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCaaa < 1:1967805/150‑1 (MQ=255) aCCAGAAACTGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCGTGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAggg < 2:729151/150‑1 (MQ=255) aCCAGAAACTGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAggg < 1:1819589/150‑1 (MQ=255) ccAGAAACTGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGc > 2:819318/1‑150 (MQ=255) cAGAAACTGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCt > 1:1390468/1‑150 (MQ=255) cAGAAACTGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCt > 2:1603432/1‑150 (MQ=255) aGAAACTGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTg > 1:380854/1‑150 (MQ=255) gAAACTGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATTGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTgc > 1:1666365/1‑150 (MQ=255) tGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCTTTGGGCTgcgctgc < 1:626890/150‑4 (MQ=255) tGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCAt < 2:763757/149‑1 (MQ=255) tGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCAt > 1:763757/1‑149 (MQ=255) tGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATg < 1:582800/150‑1 (MQ=255) tGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATg < 2:1677283/150‑1 (MQ=255) ggCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGcc < 1:1534171/150‑1 (MQ=255) gATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCtt < 1:1218174/146‑1 (MQ=255) gATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCtt > 2:1218174/1‑146 (MQ=255) cGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCAcc < 1:1661538/150‑1 (MQ=255) gTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCAccc > 2:2002678/1‑150 (MQ=255) aCCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCAGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GGGCCGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCAGTCACCCGGCGa < 2:398576/150‑1 (MQ=255) ccgtcgccgtcgGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGAt < 2:380854/150‑1 (MQ=255) cgtcgccgtcgGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATg < 1:1603432/150‑1 (MQ=255) cgGACCACGGCGGCATGGCCTGGGATGAGATGGTCATGGACATTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCNGCCCNAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGa < 1:2518/150‑1 (MQ=255) gACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGAGGACATCACACCGTAGTGTGCGCTACACGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATCCCGAGCTGATg > 1:1807149/1‑150 (MQ=255) cACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCa < 1:2351998/150‑1 (MQ=255) cACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCa < 1:1507098/150‑1 (MQ=255) ggcggcATGGCCTGGCATGAGATGGGCATGGAGCTTTGAGTGGTCATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGTCTAGGTGGGA‑GCGCAGCCCAAAGGNCTGCGCNTGCCCTTCATTCNCCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGc < 1:1628964/150‑1 (MQ=255) cATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCaa < 1:1337269/150‑1 (MQ=255) aTGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAg > 2:318561/1‑150 (MQ=255) cTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCa > 2:2205476/1‑150 (MQ=255) tGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGa < 2:638875/130‑1 (MQ=255) tGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGa > 1:638875/1‑130 (MQ=255) agaTGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAg > 1:723855/1‑150 (MQ=255) aTGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCATGCGCAGCCCTTTGGGCTgcgctgc < 1:826430/92‑4 (MQ=37) aTGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCATGCGCAGCCCTTTGGGCTgcgctgc > 2:826430/1‑89 (MQ=37) aTGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCt > 1:1453683/1‑150 (MQ=255) aTGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCt < 2:2230413/150‑1 (MQ=255) ggTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGa < 1:2002678/150‑1 (MQ=255) ggTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGa < 1:318561/150‑1 (MQ=255) tCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATg > 2:2275800/1‑150 (MQ=255) cATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATgg < 1:819318/150‑1 (MQ=255) aTGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATggg > 2:685187/1‑150 (MQ=255) tGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGc > 2:412136/1‑150 (MQ=255) gggACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGc < 1:1785786/149‑1 (MQ=255) cTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCATGCGCAGCCCTTTGGGCTgcgctgc < 2:892619/80‑4 (MQ=25) cTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCATGCGCAGCCCTTTGGGCTgcgctgc > 1:892619/1‑77 (MQ=25) tttGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTg > 2:1970790/1‑150 (MQ=255) tttGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTg > 1:225415/1‑150 (MQ=255) aGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCGGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTtg < 1:16018/150‑1 (MQ=255) gTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCa < 2:190428/108‑1 (MQ=255) gTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCa > 1:190428/1‑108 (MQ=255) gTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTtgt > 1:1247775/1‑150 (MQ=255) gTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTtgt > 2:2233878/1‑150 (MQ=255) tGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTtgtg > 2:1518187/1‑150 (MQ=255) acatgacatCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGtt < 1:507114/144‑1 (MQ=255) acatgacatCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGtt > 2:507114/1‑144 (MQ=255) atgacatCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCC‑AAGGGCTGCGCATg > 1:1305955/1‑66 (MQ=255) atgacatCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCC‑AAGGGCTGCGCATg < 2:1305955/66‑1 (MQ=255) tgacatCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTc < 1:2233878/150‑1 (MQ=255) acatCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCa < 1:290196/150‑1 (MQ=255) acatCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCa < 2:1447386/150‑1 (MQ=255) acatCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCa < 2:225415/150‑1 (MQ=255) atCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTgcgct > 1:1522421/1‑59 (MQ=255) atCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGc < 2:49887/128‑1 (MQ=255) atCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGc > 1:49887/1‑128 (MQ=255) tCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTa < 1:967867/150‑1 (MQ=255) cGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCCCCCGACGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTAc < 2:1666365/150‑1 (MQ=255) cgcTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGcc > 2:133824/1‑99 (MQ=255) cgcTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGcc < 1:133824/99‑1 (MQ=255) gcTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATgg < 1:566633/114‑1 (MQ=255) gcTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATgg > 2:566633/1‑114 (MQ=255) gcTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAgg > 2:742440/1‑150 (MQ=255) tACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTc < 2:181372/150‑1 (MQ=255) aCCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCaa < 2:1691616/90‑1 (MQ=255) aCCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCaa > 1:1691616/1‑90 (MQ=255) ccGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGc < 1:1463842/92‑1 (MQ=255) ccGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGc > 2:1463842/1‑92 (MQ=255) ccGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGAc > 2:1387151/1‑150 (MQ=255) ccGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGAc > 1:1178612/1‑150 (MQ=255) ccGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCCCGGCAGGTCGAc > 2:623087/1‑150 (MQ=255) cGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACg > 2:1457579/1‑150 (MQ=255) cGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACg > 1:1313998/1‑150 (MQ=255) gCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACgg > 2:1219609/1‑150 (MQ=255) aGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTg < 1:2275800/150‑1 (MQ=255) cTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGc < 1:449369/150‑1 (MQ=255) ttGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGc > 2:764746/1‑135 (MQ=255) ttGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGc < 1:764746/135‑1 (MQ=255) caaGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGCCAGCt > 2:1801891/3‑150 (MQ=255) cTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGCCAGCt < 1:1970790/150‑1 (MQ=255) tAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGc < 2:1584221/71‑1 (MQ=255) tAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGc > 1:1584221/1‑71 (MQ=255) tAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGCCAGCTg < 1:685187/150‑1 (MQ=255) ggCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGt > 2:2175242/1‑129 (MQ=255) ggCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGt < 1:2175242/129‑1 (MQ=255) gca‑gcgcagcCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGCCAGCTGGCCGTc > 1:2153190/1‑150 (MQ=255) catgcgcagcCCTTTGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCa > 1:1459830/4‑83 (MQ=38) catgcgcagcCCTTTGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCa < 2:1459830/80‑1 (MQ=38) a‑gcgcagcCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGCCAGCTGGCCGTCtt > 1:905228/1‑150 (MQ=255) gcCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGCCAGCTGGCCGTCTTTcacca < 2:1390468/150‑1 (MQ=255) ccAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGCCAGCTGGCCGTCTTTCACCacg > 1:690744/1‑150 (MQ=255) aaaGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGCCAGCTGGCCGTCTTTCACCacgac > 2:1453652/1‑150 (MQ=255) | TGTACCAGAAACTGGGCTACCGATACGTGAAACCGTCGCCGTCGGACCACGGCGGCATGGCCTGGCATGAGATGGTCATGGACCTTTGAGTGGACATGACATCGTAGTGTGCGCTACCCGCAGCTTGCCTAGGTGGCA‑GCGCAGCCCAAAGGGCTGCGCATGCCCTTCATTCACCCGGCGATGCCGAGCTGATGCCAGGCCTCAAGTGCCACTGACCAGCTGATGGGCCAGCTGGTTGTGGCGTTCCAGTACGCGCGGCAGGTCGACGGTGGCCAGCTGGCCGTCTTTCACCACGAC > NC_002947/2949690‑2949986 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |