| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,028,711 | G→A | 6.3% | A107A (GCG→GCA) | pcaY → | aromatic acid chemoreceptor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,028,711 | 0 | G | A | 6.3% | 212.9 / 3.1 | 73 | A107A (GCG→GCA) | pcaY | aromatic acid chemoreceptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (40/28); new base A (3/2); total (43/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.62e-01 | |||||||||||
TCGGACCGTTTGAACAATGCGTTGCTGATGGCGATTCGTTCCAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGAAGCGACCCGCCAGCGTTCGCTGGAGCAGTATTTCAAG > NC_002947/3028565‑3028858 | tCGGACCGTTTGAACAATGCGTTGCTGATGGCGATTCGTTCCAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTg < 1:980515/150‑1 (MQ=255) gACCGTTTGAACAATGCGTTGCTGATGGCGATTCGTTCCAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTc > 1:1146048/1‑150 (MQ=255) aCCGTTTGAACAATGCGTTGCTGATGGCGATTCGTTCCAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTcg > 2:1224673/1‑150 (MQ=255) cGTTTGAACAATGCGTTGCTGATGGCGATTCGTTCCAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTcgac > 2:1693453/1‑150 (MQ=255) gAACAATGCGTTGCTGATGGCGATTCGTTCCAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGCCGAAtt > 2:2385524/1‑150 (MQ=255) aaTGCGTTGCTGATGGCGATTCGTTCCAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTc > 1:1808172/1‑150 (MQ=255) tGCGTTGCTGATGGCGATTCGTTCCAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGa > 1:397318/1‑150 (MQ=255) gCTGATGGCGATTCGTTCCAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGc > 2:1325238/1‑150 (MQ=255) gATTCGTTCCAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGCGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGaaga < 2:13358/150‑3 (MQ=255) aTTCGTTCCAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCACTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAAccc > 2:1981587/1‑150 (MQ=255) aTTCGTTCCAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCACTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAAccc > 2:1981191/1‑150 (MQ=255) tCGTTCCAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAAttt > 1:902532/1‑127 (MQ=255) tCGTTCCAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCAGGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAAttt < 2:902532/127‑1 (MQ=255) gTTCCAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGccc > 1:1604644/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCt > 1:2238624/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAACAGCCAGGCGCTGGTCGACGAAGTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTc > 2:1968795/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTcg > 2:779423/1‑150 (MQ=255) aGCGCCAACGTGGCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACCAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCCGTAGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTcgc < 1:2342872/150‑1 (MQ=255) cAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGtt < 1:1524832/150‑1 (MQ=255) aaCGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGGGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTg < 2:74604/150‑1 (MQ=255) aCGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGGCGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTgg > 2:1739447/1‑150 (MQ=255) ttttATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGCGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGACGACGAATGTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCCCCGTTCGCGGGTCGGCAACCGAGCTGCa > 2:627145/1‑150 (MQ=255) tttATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAg < 1:936867/150‑1 (MQ=255) aTCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGTTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTc > 1:1979289/1‑99 (MQ=255) aTCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTc < 2:1979289/99‑1 (MQ=255) tCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTa < 2:1146048/150‑1 (MQ=255) aGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCt > 1:823024/1‑150 (MQ=255) aGTTGGGTGGCCATGACGAGAGCGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTg > 1:182367/1‑150 (MQ=255) gTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAAc < 1:2018074/97‑1 (MQ=255) gTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAAc > 2:2018074/1‑97 (MQ=255) ggTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGaa < 2:1489651/150‑1 (MQ=255) gTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATGTGTCGAAAACGCCCGCGAACCAGCACTTCGCGCGATGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAAt > 1:1737881/1‑150 (MQ=255) cGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGc < 2:2238624/150‑1 (MQ=255) gagTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGCACAGCAAGAGGCAGTCGCTGGTCGACGAATTTGCACAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGt < 1:1739447/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATAc < 2:767642/136‑1 (MQ=255) tGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATAc > 1:767642/1‑136 (MQ=255) gCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCt < 2:2112982/150‑1 (MQ=255) cAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTg < 1:1693453/150‑1 (MQ=255) gcttaaaCGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGATGCAGGCTAGCTTTGCCAAATACGCCACGGCGGTGGCTgg > 1:695359/5‑150 (MQ=255) aGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTgg > 1:1096109/1‑150 (MQ=255) aGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTgg < 2:1604644/150‑1 (MQ=255) gCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGGCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGc > 2:1917574/1‑150 (MQ=255) gCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGt > 1:119622/1‑142 (MQ=255) gCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGt < 2:119622/142‑1 (MQ=255) gCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGc > 1:698689/1‑150 (MQ=255) cAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACACCAAGAGGCAGGCGCGGGTCGACGAATTTGTCGAAACCGCCCGTGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCa < 1:1968795/150‑1 (MQ=255) aCGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCg > 2:1250202/1‑150 (MQ=255) aCGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCg < 2:1808172/150‑1 (MQ=255) aTGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGccc < 1:1772763/79‑1 (MQ=255) aTGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGcc > 1:1540407/1‑78 (MQ=255) aTGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGcc < 2:1540407/78‑1 (MQ=255) aTGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTATACCGAAGACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGaa > 2:1998254/1‑150 (MQ=255) aTGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAAACCGccc > 2:1772763/1‑79 (MQ=255) aTGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCACTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGaa < 1:1981191/150‑1 (MQ=255) aTGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCACTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGaa < 1:1981587/150‑1 (MQ=255) cgcTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGAAGCGa < 2:823024/150‑1 (MQ=255) tGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGGATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGAAGCGAccc > 1:1015829/1‑150 (MQ=255) ggTGGAGCCGAACAACAAAAACCAGGAACTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGAAGCGACCCGCCa > 2:353235/1‑150 (MQ=255) gTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGAAGCGACCCGCCAg > 2:1318397/1‑150 (MQ=255) tGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAAt > 2:1662895/1‑108 (MQ=255) tGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAAt < 1:1662895/108‑1 (MQ=255) tGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGAAGCGACCCGCCAGc > 2:1040476/1‑150 (MQ=255) gAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGAAGCGACCCGCCAGCGt > 1:1439776/1‑150 (MQ=255) gCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGAAGCGACCCGCCAGCGTTc > 1:305732/1‑150 (MQ=255) tGAACAATAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGAAGCGACCCGCCAGCGTTCGc > 1:978823/1‑150 (MQ=255) tGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGAAGCGACCCGCCAGCGTTCGc > 2:1988684/1‑150 (MQ=255) gAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGAAGCGACCCGCCAGCGTTCGCt < 2:1096109/150‑1 (MQ=255) aacaacAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGAAGCGACCCGCCAGCGTTCGCTg > 2:1572024/1‑150 (MQ=255) aacaacAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGAAGCGACCCGCCAGCGTTCGCTg < 2:1015829/150‑1 (MQ=255) caacaaGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGAAGCGACCCGCCAGCGTTCGCTGGa > 1:632393/1‑150 (MQ=255) aacaaGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGaa > 2:988038/1‑126 (MQ=255) aacaaGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGaa < 1:988038/126‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGAAGCGACCCGCCAGCGTTCGCTGGAGCAGTATTTCaa < 1:2385524/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGAAGCGACCCGCCAGCGTTCGCTGGAGCAGTATTTCAAg < 1:1086033/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGTCGACCAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGAAGCGACCCGCCAGCGTTCGCTGGAGCAGTATTTCAAg < 1:1917574/150‑1 (MQ=255) | TCGGACCGTTTGAACAATGCGTTGCTGATGGCGATTCGTTCCAGCGCCAACGTGTCTTCGGGTTTTATCGAGCAGTTGGGTGGCCATGACGAGAGTGCAGGCAAACGCATGGCGCTGTCGGTGGAGCTGAACAACAAGAGCCAGGCGCTGGTCGACGAATTTGTCGAAAACGCCCGCGAACCCGCCCTTCGCGGGTTGGCAACCGAGCTGCAGGCTACCTTTGCCGAATACGCCAAGGCGGTGGCTGGGCAGCGTGAAGCGACCCGCCAGCGTTCGCTGGAGCAGTATTTCAAG > NC_002947/3028565‑3028858 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |