| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 282,579 | A→T | 5.6% | N10I (AAT→ATT) | betT‑II → | choline/carnitine/betaine transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 282,579 | 0 | A | T | 5.6% | 279.1 / 6.6 | 89 | N10I (AAT→ATT) | betT‑II | choline/carnitine/betaine transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (45/39); new base T (3/2); total (48/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.77e-01 | |||||||||||
TTTAACTTGAACGCTTGTTCAATGAAAAACGCTGGTCCGCTGCCGGTGTTCAACAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCAACCCGCAAGCCGCAGGTGACTGGTTGCTGGCAGCGCAGAACTGGGCGGCCAACACGGTCGGCTGG > NC_002947/282432‑282724 | tttAACTTGAACGCTTGTTCAATGAAAAACGCTGGTCCGCTGCCGGTGTTCAACAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATg > 1:2312281/1‑150 (MQ=255)tttAACTTGAACGCTTGTTCAATGAAAAACGCTGGTCCGCTGCCGGTGTTCAACAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATg > 1:1508932/1‑150 (MQ=255) gAACGCTTGTTCAATGAAAAACGCTGGTCCGCTGCCGGTGTTCAACAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCATTGGCAAggga < 2:123141/150‑4 (MQ=255) aaCGCTTGTTCAATGAAAAACGCTGGTCCGCTGCCGGTGTTCAACAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATcc > 1:616695/1‑150 (MQ=255) gCTTGTTCAATGAAAAACGCTGGTCCGCTGCCGGTGTTCAACAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCa > 1:2375306/1‑150 (MQ=255) gCTTGTTCAATGAAAAACGCTGGTCCGCTGCCGGTGTTCAACAGGAGGATACCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCa > 2:815085/1‑150 (MQ=255) aaTGAAAAACGCTGGTCCGCTGCCGGAGTTCAACAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAAcccc > 1:442765/1‑150 (MQ=255) atcaaccaCGCTGGTCCGCTGCCTTTGTTCAACAGGAGGATTGCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAAccccc > 2:2085912/8‑150 (MQ=255) aTGAAAAACGCTGGTCCGCTGCCGGTGTTCAACAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAAccccc < 1:710091/150‑1 (MQ=255) tGAAAAACGCTGGTCCGCTGCCGGTGTTCAACAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTTCCAATGGCAAGATCCGCATGAAcccccc > 2:193923/1‑150 (MQ=255) cTGGTCCGCTGCCGGTGTTCAACAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTa > 1:547554/1‑150 (MQ=255) gTCCGCTGCCGGTGTTCAACAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGgtg > 2:1412534/1‑142 (MQ=255) gTCCGCTGCCGGTGTTCAACAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGgtg < 1:1412534/142‑1 (MQ=255) cTGCCGGTGTTCAACAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCTCCGGTGTTCTACTTTgcgg < 2:308969/150‑1 (MQ=255) ccGGTGTTCAACAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGa > 1:2169862/1‑150 (MQ=255) ggTGTTCAACAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCAGTATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGt < 1:193923/150‑1 (MQ=255) ggTGTTCAACAGGAGGATTACTATGCTGAACCAGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTACGATTACACAGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGTTGTTCTACTTTGCGGCGAGt > 2:779478/1‑150 (MQ=255) gtgtGCAACAGGACGATTCCTTTGCTGCACCCGTTCATTCTCCCCCTCACGTCATCCTACGAGGTGCACGCCATACGAGTTCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGtt < 1:1740715/150‑1 (MQ=255) cAACAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATc < 2:547554/150‑1 (MQ=255) cAACAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATc < 2:2375306/150‑1 (MQ=255) aaCAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCaa < 2:1813872/103‑1 (MQ=255) aaCAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCaa > 1:1813872/1‑103 (MQ=255) aaCAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGCGTTTCATc > 1:34685/1‑149 (MQ=255) aaCAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCCTc < 2:34685/149‑1 (MQ=255) aaCAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATcc > 1:1075961/1‑150 (MQ=255) gaggaTTCCTTTGCTGAACCCGTGCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAATGCCCCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATc > 1:767312/1‑150 (MQ=255) aTTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTg < 1:1347329/150‑1 (MQ=255) cTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCGCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTAATCTTTGGCCt > 1:1373425/1‑150 (MQ=255) cTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTa < 1:443927/117‑1 (MQ=255) cTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTa > 2:443927/1‑117 (MQ=255) cTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCt > 1:1737494/1‑150 (MQ=255) cTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCAGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCt > 2:1498638/1‑150 (MQ=255) tttGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGTACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCaa > 2:1739610/1‑89 (MQ=255) tttGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGGATGGCCGCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTg > 2:674960/1‑150 (MQ=255) tttGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTg > 1:1533415/1‑150 (MQ=255) tttGCTGAACCAGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGTACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCaa < 1:1739610/89‑1 (MQ=255) tcgCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCCTGCCAATGGCAAGATCCGCATGACCCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTgg < 2:616695/148‑1 (MQ=255) cTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAg < 2:968076/150‑1 (MQ=255) tGAACCCGTTCATTCCGAACCTCCCGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGt < 2:487581/150‑1 (MQ=255) tGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACCCCCCATCAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTGTGCCCGGGTAgg > 2:942988/1‑149 (MQ=255) ccGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCAtct < 2:1737494/150‑1 (MQ=255) cGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCAtctc > 1:1054261/1‑150 (MQ=255) tCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCAACCCGCAAGCCGc > 2:1740618/1‑150 (MQ=255) gTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCAtctc > 2:523985/1‑131 (MQ=255) gTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCAtctc < 1:523985/131‑1 (MQ=255) gTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCAACCCGCAAGCCGCAGGt < 2:1508932/150‑1 (MQ=255) gTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTCTTTGTCATCTCCAACCCGCAAGCCGCAGGt < 1:674960/150‑1 (MQ=255) gTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTCTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCAACCCGCAAGCCGCAGGt > 2:1317825/1‑150 (MQ=255) aTTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCAACCCGCAAGCCGCAGGTGAc < 1:1227058/150‑1 (MQ=255) tCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCAGCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCAACCCGCAAGCCGCAGGTGACTg < 1:2085912/150‑1 (MQ=255) gacgaGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCttt < 2:619089/107‑1 (MQ=255) gacgaGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCttt > 1:619089/1‑107 (MQ=255) gacgaGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCttt > 1:134205/1‑107 (MQ=255) gacgaGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCttt < 2:134205/107‑1 (MQ=255) acgaGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCAACCCGCAAGCCGCAGGTGACTGGtt < 1:92474/150‑1 (MQ=255) gTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGc > 2:2016642/1‑53 (MQ=255) gTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGc < 1:2016642/53‑1 (MQ=255) gTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCaa > 1:1366194/1‑121 (MQ=255) gTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCaa < 2:1366194/121‑1 (MQ=255) gTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCAACCCGCAAGCCGCAGGTGACTGGTTGCTgg < 2:1054261/150‑1 (MQ=255) 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gatcttGCCATTGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCAACCCGCAAGCCGCAGGTGACTGGTTGCTGGCAGCGCAGAACTGggc < 2:1084591/134‑1 (MQ=255) gatcttGCCATTGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCAACCCGCAAGCCGCAGGTGACTGGTTGCTGGCAGCGCAGAACTGggc > 1:1084591/4‑137 (MQ=255) gatcttGCCATTGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCAACCCGCAAGCCGCAGGTGACTGGTTGCTGGCAGCGCAGAACTGGGCGGCCAACACGGTc > 1:1282683/4‑150 (MQ=255) cccttGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCAACCCGCAAGCCGCAGGTGACTGGTTGCTGGCAGCGCAGAACTGGGCGGCCAACACTGTCg < 1:815085/150‑1 (MQ=255) cccttGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCAACCCGCAAGCCGCAGGTGACTGGTTGCTGGCAGCGCAGAACTGGGCGGCCAACACGGTCg > 2:1543445/1‑150 (MQ=255) gcttGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCAACCCGCAAGCCGCAGGTGACTGGTTGCTGGCAGCGCAGAACTGGGCGGCCAACACGGTCgg > 2:1654248/2‑150 (MQ=255) aTGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCAACCCGCAAGCCGCAGGTGACTGGTTGCTGGCAGCTCAGAACTGGGCGGCCAACACGGTCGGCTgg > 2:2200316/1‑146 (MQ=255) aTGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCAACCCGCAAGCCGCAGGTGACTGGTTGCTGGCAGCGCAGAACTGGGCGGCCAACACGGTCGGCTgg < 1:2200316/146‑1 (MQ=255) | TTTAACTTGAACGCTTGTTCAATGAAAAACGCTGGTCCGCTGCCGGTGTTCAACAGGAGGATTCCTTTGCTGAACCCGTTCATTCCGAACCTCACGTCATTCGACGAGGTGCACGCCCTATGAGTGCACCGAACCCTTCCCTTGCCAATGGCAAGATCCGCATGAACCCCCCGGTGTTCTACTTTGCGGCGAGTTTCATCCTCATCTTTGGCCTGGTAGTCATCTCCAACCCGCAAGCCGCAGGTGACTGGTTGCTGGCAGCGCAGAACTGGGCGGCCAACACGGTCGGCTGG > NC_002947/282432‑282724 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |