| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,060,597 | A→T | 7.0% | K187* (AAG→TAG) ‡ | exaE → | transcriptional regulator ExaE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,060,597 | 0 | A | T | 7.0% | 318.3 / 11.8 | 100 | K187* (AAG→TAG) ‡ | exaE | transcriptional regulator ExaE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (49/44); new base T (5/2); total (54/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.47e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.41e-01 | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
AGCAAAGCACCAGTGACCCCCGGTTGCAGCGCATGACCCAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCAGCCGACCGCGCCCAACGGAATGTATCCACCCCCC > NC_002947/3060448‑3060745 | aGCAAAGCACCAGTGACCCCCGGTTGCAGCGCATGACCCAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCa > 1:1346603/1‑150 (MQ=255)aGCAAAGCACCAGTGACCCCCGGTTGCAGCGCATGACCCAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCa > 1:1972428/1‑150 (MQ=255) gCAAAGCACCAGTGACCCCCGGTTGCAGCGCATGACCCAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCaa < 2:1116638/150‑1 (MQ=255) gCAAAGCACCAGTGACCCCCGGTTGCAGCGCATGACCCAGCGCGAACTGGAGATATTCACGAAGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCaa < 1:792548/150‑1 (MQ=255) aaaGCACCAGTGACCCCCGGTTGCAGCGCATGACCCAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAaga < 1:364288/150‑1 (MQ=255) aaGCACCAGTGACCCCCGGTTGCAGCGCATGACCCAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAagag > 2:2211156/1‑150 (MQ=255) aCCAGTGACCCCCGGTTGCAGCGCATGACCCAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGTCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAg < 1:1836923/150‑1 (MQ=255) cAGTGACCCCCGGTTGCAGCGCATGACCCAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGtt < 2:1695462/150‑1 (MQ=255) gACCCCCGGTTGCAGCGCATGACCCAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCTCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGAACTTGCTCTTGAGCAAggtcagg < 2:78403/150‑7 (MQ=255) gACCCCCGGTTGCAGCGCATGACCCAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAg < 1:105015/150‑1 (MQ=255) gACCCCCGGTTGCAGCGCATGACCCAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCAAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAg < 1:1601774/150‑1 (MQ=255) aCCCCCGGTTGCAGCGCATGACCCAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAgg < 1:1091513/150‑1 (MQ=255) ccccGGTTGCAGCGCATGACCCAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTc < 2:469661/150‑1 (MQ=255) tacctcATGACCCAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCac‑ac > 1:1892288/6‑150 (MQ=255) cgcATGACCCAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTAGCAGTGCCAAGACCGTATCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGcc > 1:898300/1‑150 (MQ=255) cccAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTtg < 2:1423234/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTtgt < 1:1793571/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTtgt < 1:351101/150‑1 (MQ=255) gcgcGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGGGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCa > 2:1645471/1‑150 (MQ=255) gAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTg > 1:684610/1‑150 (MQ=255) ggAGGTATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAG‑TGACGACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGAt > 1:1811204/1‑150 (MQ=255) gagaTATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAg < 1:246627/114‑1 (MQ=255) gagaTATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAg > 2:246627/1‑114 (MQ=255) gagaTATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGAtt > 1:1914042/1‑150 (MQ=255) atatTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGAt < 1:2211156/150‑1 (MQ=255) tatTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATc > 1:854424/1‑150 (MQ=255) atTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGCCGCGGGTGATTCTCCAGCGGTTAGGTATCGGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCt > 1:1624635/1‑150 (MQ=255) ttCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCTCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCa < 1:1524321/107‑1 (MQ=255) ttCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCTCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCa > 2:1524321/1‑107 (MQ=255) ttCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTg > 1:96545/1‑150 (MQ=255) tCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTgg < 2:2194259/150‑1 (MQ=255) cACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTggg < 1:637549/150‑1 (MQ=255) aCGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTtgt > 2:1820685/1‑128 (MQ=255) aCGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTtgt < 1:1820685/128‑1 (MQ=255) aaGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTg > 1:992702/1‑150 (MQ=255) aaGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGACCTGGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTg > 1:1331775/1‑150 (MQ=255) aaCCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCggg < 2:541742/150‑1 (MQ=255) cccGGCGCGGATGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTggg < 1:1277771/117‑1 (MQ=255) cccGGCGCGGATGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTggg > 2:1277771/1‑117 (MQ=255) gTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCa < 1:2305591/150‑1 (MQ=255) gTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCa < 1:578615/150‑1 (MQ=255) gTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCa > 2:1199111/1‑150 (MQ=255) tGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCAt < 2:1914042/150‑1 (MQ=255) tGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCAt < 1:2274074/150‑1 (MQ=255) gATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCAtt < 1:1257238/150‑1 (MQ=255) ttGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGCTATGAAGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGc > 2:193360/1‑150 (MQ=255) tGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTATCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCa < 2:898300/150‑1 (MQ=255) cAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTg < 2:2169577/150‑1 (MQ=255) gtgtATCAGTGCCAAGACCGTGTCCACCCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCt < 1:1361782/150‑1 (MQ=255) gtgtATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCt > 2:250730/1‑150 (MQ=255) gtATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGc < 2:1972428/150‑1 (MQ=255) aTCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGAATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGt > 2:1254536/1‑150 (MQ=255) tCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTc > 1:1033010/1‑150 (MQ=255) gTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGAt > 1:1045505/1‑85 (MQ=255) gTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGAt < 2:1045505/85‑1 (MQ=255) tGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTg > 1:1046465/1‑79 (MQ=255) tGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTg < 2:1046465/79‑1 (MQ=255) ccAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGggtgg < 2:2398711/96‑1 (MQ=255) 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cAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCAGCCGACCGCGCCCAAc > 2:209095/1‑150 (MQ=255) aaCCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGgtggtg < 1:1152781/84‑1 (MQ=255) aaCCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGgtggtg > 2:1152781/1‑84 (MQ=255) aaCCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGc < 1:1009307/127‑1 (MQ=255) aaCCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGc > 2:1009307/1‑127 (MQ=255) aaCCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCAGCCGACCGCGCCCAACg > 1:1339307/1‑150 (MQ=255) aaCCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCAGCCGACCGCGCCCAACg > 1:2203418/1‑150 (MQ=255) accTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTtgt < 2:1861204/52‑1 (MQ=255) accTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTtgt > 1:1861204/1‑52 (MQ=255) tGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCAGCCGACCGCGCCCAACGGAATGTa > 2:2268690/1‑150 (MQ=255) tGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCAGCCGACCGCGCCCAACGGAATGTa < 1:209095/150‑1 (MQ=255) gACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTgggg < 2:2365754/115‑1 (MQ=255) gACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTgggg > 1:2365754/1‑115 (MQ=255) caacTTGCTCTTGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCAGCCGACCGCGCCCAACGGAATGTAt > 1:828638/4‑150 (MQ=255) aCCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGGTTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCa > 1:222077/1‑124 (MQ=255) aCCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCa < 2:222077/124‑1 (MQ=255) acTTGCTCTTGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCAGCCGACCGCGCCCAACGGAATGTATcc > 2:128014/2‑150 (MQ=255) acTTGCTCTTGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCAGCCGACCGCGCCCAACGGAATGTATcc > 2:1351687/2‑150 (MQ=255) cTTGCTCTTGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCAtt < 2:1122047/99‑1 (MQ=255) cTTGCTCTTGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCAtt > 1:1122047/1‑99 (MQ=255) cTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTgggg > 2:1091941/1‑67 (MQ=255) cTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTgggg < 1:1091941/67‑1 (MQ=255) cTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCAGCCGACCGCGCCCAACGGAATGTATCCa > 2:2004343/1‑150 (MQ=255) cTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCAGCCGACCGCGCCCAACGGAATGTATCCa > 2:1066750/1‑150 (MQ=255) gCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCAGCCGACCGCGCCCAACGGAATGTATCCAccc > 1:995922/1‑150 (MQ=255) tCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCAGCCGACCGCGCCCAACGGAATGTATCCa > 1:1037491/1‑145 (MQ=255) tCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCAGCCGACCGCGCCCAACGGAATGTATCCa < 2:1037491/145‑1 (MQ=255) tCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCAGCCGACCGCGCCCAACGGAATGTATCCAccccc > 1:438683/1‑150 (MQ=255) tCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCAGCCGACCGCGCCCAACGGAATGTATCCAccccc > 1:897254/1‑150 (MQ=255) cAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCAGCCGACCGCGCCCAACGGAATGTATCCAcccccc < 1:2004343/150‑1 (MQ=255) | AGCAAAGCACCAGTGACCCCCGGTTGCAGCGCATGACCCAGCGCGAACTGGAGATATTCACGATGCTGGCCAAGGGAACCCCGGCGCGGGTGATTGCCGAGCAGTTGTGTATCAGTGCCAAGACCGTGTCCAACCACCTGACCTTGCTCAAGAGCAAGTTGCAGGTCAGCTCAC‑ACGCCGAGCTTGTGCATCTGGGGATTGATCTGGGGGTGGTGCGGGTGGCGGGGTGAGGTATTTCATTGCACCTGTTGGGGCTGCGTCGCAGCCGACCGCGCCCAACGGAATGTATCCACCCCCC > NC_002947/3060448‑3060745 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |