| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,066,370 | T→A | 5.4% | L154Q (CTG→CAG) | PP_2678 → | hydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,066,370 | 0 | T | A | 5.4% | 294.9 / 5.0 | 93 | L154Q (CTG→CAG) | PP_2678 | hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/43); new base A (2/3); total (47/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.85e-01 | |||||||||||
CCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGCTGTTCGCCGGCGACCTGGTGTTCTACCAACGCGCCCTGACCACGC > NC_002947/3066224‑3066519 | ccAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCa > 2:716962/1‑150 (MQ=255) cAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAg > 1:2353401/1‑150 (MQ=255) aGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGc > 1:756745/1‑150 (MQ=255) aGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGc > 2:594370/1‑150 (MQ=255) aGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGc > 2:2073264/1‑150 (MQ=255) ggCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGcc < 2:1319052/150‑1 (MQ=255) ggCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGcc > 1:607784/1‑150 (MQ=255) tttGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGc < 2:787066/150‑1 (MQ=255) tttGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGc < 1:925382/150‑1 (MQ=255) ccGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGc < 1:232114/150‑1 (MQ=255) gATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCACGCCCGGCTGCAGCACCCgggtcggcag < 2:454218/150‑8 (MQ=255) gtgCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAg < 1:780560/150‑1 (MQ=255) tgCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACATGCTGCGCGAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAgg < 2:529019/150‑1 (MQ=255) gATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAggtggg > 1:342908/1‑150 (MQ=255) tCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAggtgggtg < 2:607784/150‑1 (MQ=255) cGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGGTGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGgtgggtgg < 1:1983073/150‑1 (MQ=255) cGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCCACCGGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGgtgggtgg < 1:733086/150‑1 (MQ=255) gTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGCTGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGCTGCAGCACCCgg < 2:2203150/129‑1 (MQ=255) gTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGCTGCAGCACCCgg > 1:2203150/1‑129 (MQ=255) ccTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCg > 2:2309873/1‑150 (MQ=255) tGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAggtgggt < 1:1678501/140‑1 (MQ=255) tGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAggtgggt > 2:1678501/1‑140 (MQ=255) tGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAg > 2:139797/1‑134 (MQ=255) tGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAg < 1:139797/134‑1 (MQ=255) gCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGCTGCAGCACCCgggtc > 2:593231/1‑122 (MQ=255) gCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGCTGCAGCACCCgggtc < 1:593231/124‑3 (MQ=255) aagCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAg > 2:1902570/3‑150 (MQ=255) cACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATTCTCGGCACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGGGGTGGGTGGGCACCTGCTGAGGtt > 1:1489512/1‑150 (MQ=255) aCCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTg > 1:2389573/1‑150 (MQ=255) ccGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGACGGGGACTGGATGCTCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTgct > 1:1499851/1‑150 (MQ=255) cgcgACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAggtg > 1:2075293/1‑126 (MQ=255) cgcgACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAggtg < 2:2075293/126‑1 (MQ=255) gcgACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTgctgg < 2:1155675/150‑1 (MQ=255) gcgACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTgctgg < 2:952946/150‑1 (MQ=255) gACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTgctgggg > 2:1115427/1‑150 (MQ=255) ctgctgCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTCGGTGGGCACCGCCTGAGGTTgctggggctg > 2:663418/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGGCTGGTTGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGGGGGCACCGCCTGAGGTTgctggggctgg > 1:1623594/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTgctggggctgg > 1:755742/1‑150 (MQ=255) ctgcGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTgggc < 1:2309873/150‑1 (MQ=255) tgcGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTgggcg < 2:1884751/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTgggcgg < 1:716962/150‑1 (MQ=255) ccAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCa > 2:789985/1‑150 (MQ=255) gCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCAt > 1:2318363/1‑103 (MQ=255) gCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCAt < 2:2318363/103‑1 (MQ=255) gCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATAc > 2:2185495/1‑150 (MQ=255) ggCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGt < 2:2389573/150‑1 (MQ=255) gATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAggtgggtg > 2:1760891/1‑106 (MQ=255) gATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAggtgggtg < 1:1760891/106‑1 (MQ=255) gATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGcc > 2:2228099/1‑150 (MQ=255) gATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGAAGCTGCCGACCCGGGAGCTGCAGCCGGGCGTGAAGGAGGTGGGTGGGGACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATCGGGGTAcc > 2:1166293/1‑150 (MQ=255) tGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGa < 2:1443213/150‑1 (MQ=255) ccATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCa > 2:53758/1‑79 (MQ=255) ccATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCa < 1:53758/79‑1 (MQ=255) aTGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTg > 1:315153/1‑150 (MQ=255) tGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTgg > 1:339742/1‑150 (MQ=255) ggCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGc < 2:315153/150‑1 (MQ=255) cGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCa < 1:1666049/84‑1 (MQ=255) cGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCa > 2:1666049/1‑84 (MQ=255) cGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGAt > 2:1412448/1‑150 (MQ=255) aaCATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGTGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTc < 2:2198294/150‑1 (MQ=255) aTGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGAt > 2:847321/1‑150 (MQ=255) aTGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGAt > 1:230515/1‑150 (MQ=255) aTGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGAt < 1:1412448/150‑1 (MQ=255) gTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGa > 1:1751072/1‑150 (MQ=255) aTCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGaaa < 2:1903475/150‑1 (MQ=255) tCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAggtgggt > 2:1436933/1‑82 (MQ=255) tCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAggtgggt < 1:1436933/82‑1 (MQ=255) tCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTg < 2:1014651/94‑1 (MQ=255) tCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTg > 1:1014651/1‑94 (MQ=255) gCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGAGCTGGCGATAATCGAGTAAAAGa > 2:1268737/1‑150 (MQ=255) tGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTTCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTCAGACGTGTCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCg < 1:1268737/150‑1 (MQ=255) cGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGAGCGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGCt < 2:342908/150‑1 (MQ=255) gACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGa > 2:1726434/1‑82 (MQ=255) gACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGa < 1:1726434/82‑1 (MQ=255) aCTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGa < 1:650200/130‑1 (MQ=255) aCTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGa > 2:650200/1‑130 (MQ=255) tGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGCTGTTc < 2:1751072/150‑1 (MQ=255) aTGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGCTGTTCGcc < 1:594370/150‑1 (MQ=255) tGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGGCGACCCGGGTGCTGCAGGCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCGGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGCTGTTCGCCg > 2:1853667/1‑150 (MQ=255) gcgcGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCAt > 2:1732908/1‑52 (MQ=255) gcgcGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCAt < 1:1732908/52‑1 (MQ=255) aCCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGCTGTTCGCCGGCGACCTg > 2:586242/1‑150 (MQ=255) ggtgCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGACGGGGCTGGGCGGGCTGACGGGGTCCGTCCTGGCGATTTTCTATGAAAAGACCGGGGTGCTGTTCGCCGGCGACCTGGTGTTCTa < 2:2078868/150‑1 (MQ=255) ggtcCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGGCGGGCGTGCATGTGTGGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTAGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGCTGTTCGCCGGCGACCTGGTGTTCTa < 1:1737510/150‑1 (MQ=255) gtgCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCTCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGCTGTTCGCCGGCGACCTGGTGTTCTAc < 1:1341134/150‑1 (MQ=255) gtgCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGCTGTTCGCCGGCGACCTGGTGTTCTAc < 1:1115427/150‑1 (MQ=255) gtgCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGCTGTTCGCCGGCGACCTGGTGTTCTAc < 1:586242/150‑1 (MQ=255) ctgcCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGCCGGTTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGCTTTGCGCCGGCGACCTCGTGCTCTACCaa > 2:542769/1‑150 (MQ=255) tgcCGACCCGGGTGCTGCAGGCGGGCGTGCATGACGTGGGTGCGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGAGCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGCTGTTCGCCGGCGACCTGGTGTTCTACCAAc < 2:1082686/150‑1 (MQ=255) tgcCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGCTGTTCGCCGGCGACCTGGTGTTCTACCAAc > 2:2030359/1‑150 (MQ=255) ccGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGCCTGGGGTGCTGTTCGCCGGCGACCTGGTGTTCTACCAACGCGCCCt > 1:1039658/1‑150 (MQ=255) ccGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGCTGTTCGCCGGCGACCTGGTGTTCTACCAACGCGCCCt > 2:2274310/1‑150 (MQ=255) ccGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGCTGTTCGCCGGCGACCTGGTGTTCTACCAACGCGCCCt < 1:2030359/150‑1 (MQ=255) gctgcAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGCTGTTCGCCGGCGACCTGGTGTTCTACCAACGCGCCCTGACCAc < 1:847321/150‑1 (MQ=255) ctgcAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGc > 1:1369348/1‑106 (MQ=255) ctgcAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGc < 2:1369348/106‑1 (MQ=255) tgcAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGCTGTTCGCCGGCGACCTGGTGTTCTACCAACGCGCCCTGACCACGc > 2:335000/1‑150 (MQ=255) | CCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGACCCGGGTGCTGCAGCCGGGCGTGCATGAGGTGGGTGGGCACCGCCTGAGGTTGCTGGGGCTGGGCGGGCATACGGGTGCCGACCTGGCGATTTTCGATGAAAAGACCGGGGTGCTGTTCGCCGGCGACCTGGTGTTCTACCAACGCGCCCTGACCACGC > NC_002947/3066224‑3066519 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |