| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 287,068 | G→C | 9.2% | P19R (CCG→CGG) ‡ | tauB‑II ← | taurine ABC transporter ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 287,068 | 0 | G | C | 9.2% | 303.8 / 17.5 | 98 | P19R (CCG→CGG) ‡ | tauB‑II | taurine ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (43/46); new base C (4/5); total (47/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.46e-01 | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
CGGCACACCATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGA > NC_002947/286920‑287213 | cGGCACACCATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCgg < 1:1039799/150‑1 (MQ=255) ggCACACCATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGGCCCTGGGCCTCCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCggg < 1:2102045/150‑1 (MQ=255) ggCACACCATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCggg > 2:1602079/1‑150 (MQ=255) acCATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCt < 2:377059/150‑1 (MQ=255) ccATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTAATATCGGCCAGCACCCCGGTGCTg < 1:74763/150‑1 (MQ=255) cATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTgg > 1:753794/1‑150 (MQ=255) cATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCCCGGTGCTgg > 2:1029928/1‑150 (MQ=255) aTCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGgc < 2:1037921/150‑1 (MQ=255) tCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCCCGGTGCTGgcc < 1:2229765/150‑2 (MQ=255) gAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGcc > 2:1186662/1‑150 (MQ=255) gAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCCCGGTGCTGgccga < 1:1029928/150‑4 (MQ=255) gggTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTg < 2:1827500/150‑1 (MQ=255) gggTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTg < 2:446481/150‑1 (MQ=255) ggTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTgg < 1:734039/150‑1 (MQ=255) gTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTggg > 2:273862/1‑150 (MQ=255) gATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTGGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTa < 2:728622/150‑1 (MQ=255) tgtgACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACt < 1:1913437/150‑1 (MQ=255) gtgACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACtg < 1:273862/150‑1 (MQ=255) gtgACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACtg > 2:1555919/1‑150 (MQ=255) aCTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGAt < 2:188257/150‑1 (MQ=255) ggggCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCg < 1:668515/115‑1 (MQ=255) ggggCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCg > 2:668515/1‑115 (MQ=255) ggggCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATgcgc < 1:2110723/150‑1 (MQ=255) gggCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGTGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCt > 2:792690/1‑150 (MQ=255) cgacgaAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGTGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCa < 1:792690/150‑1 (MQ=255) gCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCCCGGTGCTGgc < 1:1987641/114‑1 (MQ=255) gCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCCCGGTGCTGgc > 2:1987641/1‑114 (MQ=255) gATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGc > 2:1492789/1‑150 (MQ=255) gTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGAc < 1:1377659/150‑1 (MQ=255) gTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGAc > 1:427548/1‑150 (MQ=255) ttGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACg > 2:1950871/1‑150 (MQ=255) tGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACgg > 2:1286109/1‑150 (MQ=255) tGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCggg < 2:817721/85‑1 (MQ=255) tGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCggg > 1:817721/1‑85 (MQ=255) tGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGTGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGa > 2:2041369/1‑128 (MQ=255) tGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGTGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGa < 1:2041369/128‑1 (MQ=255) tGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGAt > 1:197884/1‑114 (MQ=255) tGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGAt < 2:197884/114‑1 (MQ=255) gTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGAGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGCCCTCCGGATCa > 2:305424/1‑150 (MQ=255) tCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAg < 2:753794/150‑1 (MQ=255) cTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGGTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGt < 1:305424/150‑1 (MQ=255) ttGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGtt > 2:559614/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCCCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGtt < 2:25892/150‑1 (MQ=255) tGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGttt < 1:877507/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTg < 1:1383244/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTggaa < 1:504504/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTggaa < 2:552824/150‑1 (MQ=255) cTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTggaag < 1:1950871/150‑1 (MQ=255) tGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTggaagg < 1:1555919/150‑1 (MQ=255) gAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACtt > 2:1453186/1‑150 (MQ=255) gcggcAGGTCGACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGgcg > 2:1200211/5‑150 (MQ=255) ccccAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGgcgc > 2:140507/1‑150 (MQ=255) cccAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCt > 2:1124213/1‑150 (MQ=255) cccAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCt > 1:1163905/1‑150 (MQ=255) cccAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCCGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCt > 1:1248979/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTg > 1:311615/1‑150 (MQ=255) aGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGACGGAGCTTGCCGCTGAc > 2:1376581/1‑150 (MQ=255) ccaccaGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTgg < 2:1635012/60‑1 (MQ=255) ccaccaGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTggaa > 1:378560/1‑130 (MQ=255) ccaccaGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTggaa < 2:378560/130‑1 (MQ=255) ccaccaGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTAc > 2:726662/1‑150 (MQ=255) caccaGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACg < 1:1453186/150‑1 (MQ=255) accaGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACgg > 2:318969/1‑150 (MQ=255) ccaGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTggaa < 1:90089/127‑1 (MQ=255) ccaGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTAc > 2:143227/1‑147 (MQ=255) ccaGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTAc < 1:143227/147‑1 (MQ=255) ccaGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGc < 1:318969/150‑1 (MQ=255) cagcagTTGGCGTGGTCCCAGGCTCGGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGgc < 2:733328/136‑1 (MQ=255) agcagTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGa < 1:559614/150‑1 (MQ=255) ttGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGagtagt > 1:1111375/1‑150 (MQ=255) gCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGGGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCg > 1:1397992/1‑150 (MQ=255) tGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGgca > 2:2285955/1‑150 (MQ=255) ggTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGgcag < 2:168794/150‑1 (MQ=255) gTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGgcagc > 1:1646503/1‑150 (MQ=255) cccAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCAc < 1:1492789/150‑1 (MQ=255) ccAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTgg < 2:837498/46‑1 (MQ=255) ccAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTgg > 1:837498/1‑46 (MQ=255) ccAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACg < 2:2370385/130‑1 (MQ=255) ccAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACg > 1:2370385/1‑130 (MQ=255) ccAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACt > 1:1474080/1‑150 (MQ=255) cAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTg < 1:1186662/150‑1 (MQ=255) gCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCtt < 1:1124213/150‑1 (MQ=255) cTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTc < 2:1646503/150‑1 (MQ=255) tCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGc > 1:142348/1‑86 (MQ=255) aGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGAc > 2:2389199/1‑150 (MQ=255) aGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGAc < 2:2339403/150‑1 (MQ=255) gTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGAc > 1:7988/1‑148 (MQ=255) gTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGAc < 2:7988/148‑1 (MQ=255) gTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACtt > 1:400517/1‑150 (MQ=255) tatCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCt < 1:1286109/150‑1 (MQ=255) tatCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCt > 2:1511563/1‑150 (MQ=255) tatCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGCGAACGGTAGGCTGATACGCTCGGGGTCGGGCAAGGCTATGAGGGGCTCCGCATTTGGCCCGAAGGTACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACACCTTGTACTTGGCCt > 1:1376138/1‑150 (MQ=255) gCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCATGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTtgctg > 2:300895/1‑150 (MQ=255) gCCAGCACCCCGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGttt < 2:1032548/85‑1 (MQ=255) gCCAGCACCCCGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGttt > 1:1032548/1‑85 (MQ=255) ccAGCACCCCGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCAGGATCCGTGGTGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTtgctgc > 2:195860/1‑150 (MQ=255) ccccGGGGTGATGGCGCCTGTTTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGa < 2:1156855/148‑1 (MQ=255) cACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGa < 2:400517/150‑1 (MQ=255) cGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGag > 2:1211331/1‑107 (MQ=255) cGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGag < 1:1211331/107‑1 (MQ=255) | CGGCACACCATCGAGGGTGATGTGACCGCCACTGGGGGCGACGAAGCCGGCGATGAGGTTGAGCAGTGAGGTCTTGCCGCTGCCGGAAGGCCCCAGGGCCACCAGCAGTTGGCGTGGTCCCAGGCTCAGGTTGATATCGGCCAGCACCGGGGTGCTGGCGCCTGGGTACTGTGCGCTGATGCGCTCCAGCTCGAGCAAGGCCATGACGGGCTCCGGATCAGTTTGGAAGGAACTTGGCGCTGACGTACGGCGAGTAGTCCGGCAGCACTGCTTCGACTTTGCCTTGCTGCTTGA > NC_002947/286920‑287213 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |