| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,166,099 | G→C | 9.0% | G163A (GGC→GCC) | PP_2780 → | 3‑oxoacyl‑ACP synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,166,099 | 0 | G | C | 9.0% | 349.6 / 21.6 | 112 | G163A (GGC→GCC) | PP_2780 | 3‑oxoacyl‑ACP synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (48/53); new base C (5/5); total (54/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.61e-01 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TCATCGTTTGCAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGCCTGGACACCA > NC_002947/3165950‑3166248 | tCGTTTGCAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCAt > 1:1182936/1‑150 (MQ=255) tttGCAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGCCATCgg > 2:1891934/1‑150 (MQ=255) tGCAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCTTATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCa < 1:1697844/150‑1 (MQ=255) gCAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGCCATCGGCaa < 1:2317641/150‑2 (MQ=255) cAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGt < 2:1182936/150‑1 (MQ=255) aGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATc < 1:996554/143‑1 (MQ=255) aTGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGc > 1:643307/1‑150 (MQ=255) gctgctCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAg > 2:329028/1‑146 (MQ=255) gctgctCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAg < 1:329028/146‑1 (MQ=255) tgctCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCgg > 1:1904414/1‑150 (MQ=255) gctCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGt < 1:1144835/150‑1 (MQ=255) gctCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGt < 1:1949928/150‑1 (MQ=255) ctCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTg > 1:625381/1‑150 (MQ=255) aGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATc > 2:1780501/1‑150 (MQ=255) aGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATc < 2:20559/150‑1 (MQ=255) aGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATc < 1:121155/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCGGATACCCCGGCGCGGAAGCAGTCCTACACTGAATTTGGCGGTCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCa < 2:1468728/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCaa > 1:1992959/1‑150 (MQ=255) ccTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCaa < 1:1805407/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAAt < 2:2250995/150‑1 (MQ=255) ggCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGt < 2:89303/150‑1 (MQ=255) gCGGATACCCCGGCGAAGCGGCCGCCCTGGCCTAAATTGTTGGCGCGACAGCCGAAGGCCGATCCTCACAGTTCACTGCGTAAGAGCAACGACCCCCTTGCGCGGGGGATTGCCGATGGAATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTc < 2:954218/150‑1 (MQ=255) cGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTca < 1:1780501/150‑1 (MQ=255) cGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTca < 2:283364/150‑1 (MQ=255) ggctAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGCGATCAATGTcag > 2:2298139/4‑150 (MQ=255) ggATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTcag > 1:1384100/1‑150 (MQ=255) ggATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTcag < 1:731857/150‑1 (MQ=255) gATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTcagc < 1:1272728/150‑1 (MQ=255) atctcccGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTcagca < 2:1972235/146‑1 (MQ=255) aggacGGCGCCTGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCagcagc > 2:501258/5‑150 (MQ=255) gacGGCGCCTGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGAGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCTGCAGAGCAAAGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCGgcgc > 1:780272/3‑150 (MQ=255) cccGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGCCATCGGCaa > 1:17866/1‑119 (MQ=255) cccGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGATAGCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAgcgc > 1:2308105/1‑150 (MQ=255) cccGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTCCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTAATCAATGTCATCAgcgc < 2:1955880/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGCCATCGGCaatca > 1:1262267/1‑118 (MQ=255) ccGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGCCATCGGCaatca < 2:1262267/122‑5 (MQ=255) ccGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAANTGATGGCGCGACNGGCGCANGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTcagcagagat > 1:1972235/1‑146 (MQ=255) cAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑cgcg < 1:693601/150‑1 (MQ=255) ctgcgcCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAg > 1:1078886/3‑117 (MQ=255) ctgcgcCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAg < 2:1078886/115‑1 (MQ=255) aGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCgg < 1:852253/150‑1 (MQ=255) cGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGt > 1:538706/1‑150 (MQ=255) tCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTcc > 2:2150703/1‑150 (MQ=255) tGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGTTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAg > 2:514469/1‑150 (MQ=255) tGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAg < 2:1904414/150‑1 (MQ=255) tGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAg < 2:643307/150‑1 (MQ=255) tCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCg < 1:1434970/106‑1 (MQ=255) aaTTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCg < 2:538706/150‑1 (MQ=255) aTTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCgg > 1:248096/1‑150 (MQ=255) aTTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCgg > 1:1265013/1‑150 (MQ=255) aTTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCgg < 2:554672/150‑1 (MQ=255) ttGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGAACGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGc > 2:621133/1‑150 (MQ=255) gcgACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCAtt < 2:248096/150‑1 (MQ=255) aCAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTCCCGATGGCATCGCCAACGACGCCCCAGTG‑CAGACGTGTGCTATTCCGGTCTGGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCa < 1:1253848/150‑1 (MQ=255) gcgcAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑cgcg > 2:361278/1‑114 (MQ=255) gcgcAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑cgcg < 1:361278/114‑1 (MQ=255) gcAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAg > 1:2004730/1‑75 (MQ=255) gcAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAg < 2:2004730/75‑1 (MQ=255) tCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTc < 1:2057467/150‑1 (MQ=255) aTCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTcgcg > 2:2137908/1‑150 (MQ=255) tCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCgcgg < 2:2150660/150‑1 (MQ=255) cTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCgcggcg > 2:319194/1‑150 (MQ=255) tGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGa < 1:319194/150‑1 (MQ=255) gACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAga > 2:1201692/1‑133 (MQ=255) aCAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAgg < 2:1992959/150‑1 (MQ=255) ttCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGa > 2:1484161/1‑150 (MQ=255) aCTGCGTCGGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCCTGAGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCt > 1:1601142/1‑150 (MQ=255) aCTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCt > 2:489653/1‑150 (MQ=255) aCTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCt > 1:1007596/1‑150 (MQ=255) cTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTg > 2:187920/1‑150 (MQ=255) tGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTgg < 2:2089770/150‑1 (MQ=255) tCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCAt > 2:1454534/1‑150 (MQ=255) gagCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGAGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGCCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGc > 2:1024527/1‑150 (MQ=255) gCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCg > 1:1759128/1‑150 (MQ=255) cAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGTTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCgg < 1:514469/150‑1 (MQ=255) cAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCgg > 2:588035/1‑150 (MQ=255) cAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCgg < 1:501258/150‑1 (MQ=255) aaCGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCgg < 2:1876601/52‑1 (MQ=255) aaCGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCgg > 1:1874954/1‑52 (MQ=255) aaCGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCgg > 1:1876601/1‑52 (MQ=255) aaCGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCgg < 2:1874954/52‑1 (MQ=255) gACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCgggggg > 2:1337839/1‑149 (MQ=255) gACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGgc > 2:1488617/1‑150 (MQ=255) ccGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGgcgc > 2:2136308/1‑150 (MQ=255) ccTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCa > 2:1560979/1‑102 (MQ=255) ccTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCa < 1:1560979/102‑1 (MQ=255) cgcgGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCgg < 2:257468/150‑1 (MQ=255) aTTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAAAGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGc < 2:1384100/150‑1 (MQ=255) ctGCCGATGCCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGTTTCGGTGCTTAGcc > 1:1698216/2‑150 (MQ=255) tGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGATGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGCCt < 1:719403/150‑1 (MQ=255) tGCCGATGCCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGCCt > 1:69495/1‑150 (MQ=255) gCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCTGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGCCTg < 2:742888/150‑1 (MQ=255) gCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCg > 1:2117986/1‑124 (MQ=255) cGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCgg < 1:1082271/123‑1 (MQ=255) cGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGCCTGGa < 1:2136308/150‑1 (MQ=255) tGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGCCTGGacac < 1:2150703/150‑1 (MQ=255) ggCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGCCTGGACAcc > 2:1830579/1‑150 (MQ=255) gCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCggg > 2:1167840/1‑119 (MQ=255) gCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCggg < 1:1167840/119‑1 (MQ=255) gCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGCCTGGACACCa < 1:1830579/150‑1 (MQ=255) | TCATCGTTTGCAGGACATGCTGCTCAGCCTGGCGGATAACCCGGCGCAGGCGCCGTCCTGGGCTCAATTGATGGCGCGACAGGCGCAGGTCGATCCTGACAGTTCACTGCGTCAGAGCAACGACCGCCTTGCGCGGGTGATTGCCGATGGCATCGGCAGTGAAGGCCCGGTGATCAATGTCAGCAGCGCCTG‑CGCGGGAGCGTCCCAGGCCATCGGCAATGCATTCCAGATGATCCGTCGCGGCGAGGTCGAGCTGGCCATTGCCGGGGGCGCCGATTCGGTGCTTAGCCTGGACACCA > NC_002947/3165950‑3166248 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |