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gtggccAACCGCGGACAGCGGTTGGGCCACGGCGCCGACATCGGCATCCACCCCAAGTCCAGCTGGAACAACCCAGAGCCGGAAGTGGTGCTGGCCGTGTCGa > 1:1552286/5‑103 (MQ=37) gtggccAACCGCGGACAGCGGTTGGGCCACGGCGCCGACATCGGCATCCACCCCAAGTCCAGCTGGAACAACCCAGAGCCGGAAGTGGTGCTGGCCGTGTCGa < 2:1552286/99‑1 (MQ=37) gtggccAACCGCGGACAGCGGTTGGGCCACGGCGCCGACATCGGCATCCACCCCAAGTCCAGCTGGAACAACCCAGAGCCGGAAGTGGTGCTGGCCGTGTCGAGCAATGGCAGCATCAAGGGCGCCATGCTCGGCAACGACGTCAACCTg > 1:1005410/5‑150 (MQ=255) aGGCCCAACCGCTGTCCGCGGTT‑GGCCACGGCGCCGACATCGGCATCCACCCCAAGTCCAGCTGGAACAACCCAGAGCCGGAAGTGGTGCTgg > 2:1517204/1‑93 (MQ=255) aGGCCCAACCGCTGTCCGCGGTT‑GGCCACGGCGCCGACATCGGCATCCACCCCAAGTCCAGCTGGAACAACCCAGAGCCGGAAGTGGTGCTgg < 1:1517204/93‑1 (MQ=255) aGGCCCAACCGCTGTCCGCGGTT‑GGCCACGGCGCCGACATCGGCATCCACCCCAAGTCCAGCTGGAACAACCCAGAGCCGGAAGTGGTGCTGGc > 2:2057449/1‑94 (MQ=255) aGGCCCAACCGCTGTCCGCGGTT‑GGCCACGGCGCCGACATCGGCATCCACCCCAAGTCCAGCTGGAACAACCCAGAGCCGGAAGTGGTGCTGGc < 1:2057449/94‑1 (MQ=255) gCCCAACCGCTGTCCGCGGTT‑GGACAAGGTGCCGACATCGGCATCCACCCCAAGTCCAGCTGGAACAACCCAGAGCCGGAAGTGGTGCTGGCCGTGTCGAGCAATGGCAGCATCAAGGGCGCCATGCTCGGCAACGACGTCAACCTgcgc < 2:2108703/150‑1 (MQ=255) cAACCGCTGTCCGCGGTT‑GGCCACGGCGCCGGCATCGGCATCCACCCCAAGTCCAGCTGGAACATCGAGCAGGGTGAAGTGGTGCTGGCCGTGTCGAGCAATGGCAGCATCAAGGGCGCCATGCTCGGCAACGACGTCAACCTGCGCGAc < 1:419735/150‑1 (MQ=255) aaCCGCTGTCCGCGGTT‑GGCCACGGCGCCGACATCGGCATCCACCCCAAGTCCAGCTGGAACAACACCGAGCCGGAAGTGGTGCTGGCCGTGTCGAGCAATGGCAGCATCAAGGGCGCCATGCTCGGCAACGACGTCAACCTGCGCGACt > 1:1012683/1‑150 (MQ=255) aCCGCTGTCCGCGGTT‑GGCCACGGCGCCGACATCGGCATCCACCCCAAGTCCAGCTGGAACAACCCAGAGCCGGAAGTGGTGCTGGCCGTGTCGAGCAATGGCAGCATCAAGGGCGCCATGCTCGGCAACGACGTCAACCTGCGCGACtt < 2:2376468/150‑1 (MQ=255) gCTGTCCGCGGAT‑GGCCACGGCGCCGACATCGGCATCCACCCCAAGTCCAGATGGAACAAACCAGAGCCGGAAGTGGTGCTGGCCGTGTCGGGCAATGGCAGCATCAAGGGCGCCATGCTCGGCAACGACGTCAACCTGCGCGACTTCGa > 2:753949/1‑150 (MQ=255) cTGTCCGCGGTT‑GGCCACGGCGCCGACATCGGCATCCACCCCAAGTCCAGCTGGAACAACCCAGAGCCGGAAGTGGTGCTGGCCGTGTCGAGCAATGGCAGCATCAAGGGCGCCATGCTCGGCAACGACGTCAACCTGCGCGACTTCGaa < 1:1502284/150‑1 (MQ=255) tGTCCGCGGTT‑GGCCACGGCGCCGACATCGGCATCCACCCCAAGTCCAGCTGGAACAACCCAGAGCCGGAAGTGGTGCTGGCCGTGTCGAGCAATGGCAGCATCaa > 2:644748/1‑106 (MQ=255) tGTCCGCGGTT‑GGCCACGGCGCCGACATCGGCATCCACCCCAAGTCCAGCTGGAACAACCCAGAGCCGGAAGTGGTGCTGGCCGTGTCGAGCAATGGCAGCATCaa < 1:644748/106‑1 (MQ=255) | CCGCATCGGCGCCGACCTGTCGCAGATCGTGCCCGGCTCGGCTCAGGCCGAAGCGCTGCGCAAGGTGCTGGTAGAGCAGGGCCTGTGGTCGCAGTACCTGGAGGTGGGTATCGGCCCGGATGCCGAAGTGTTCACCAAGGCCCAACCGCTGTCCGCGGTT‑GGCCACGGCGCCGACATCGGCATCCACCCCAAGTCCAGCTGGAACAACCCAGAGCCGGAAGTGGTGCTGGCCGTGTCGAGCAATGGCAGCATCAAGGGCGCCATGCTCGGCAACGACGTCAACCTGCGCGACTTCGAA > NC_002947/3238039‑3238336 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |