Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,249,705 | A→C | 8.9% | K428Q (AAG→CAG) | ureC → | urease subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,249,705 | 0 | A | C | 8.9% | 310.8 / 17.3 | 109 | K428Q (AAG→CAG) | ureC | urease subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (52/47); new base C (5/5); total (57/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
GCACCAGATGAAGCTGCGTCGCGGGCCGCTGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGACATCAACGGCTCCATACCCACCCCCCAGCCGGTGCACTATCGGCCGATGTT > NC_002947/3249557‑3249853 | gcACCAGATGAAGCTGCGTCGCGGGCCGCTGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCaa > 1:604529/1‑150 (MQ=255) gcACCAGATGAAGCTGCGTCGCGGGCCGCTGGCACCGAACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCaa > 1:1948331/1‑150 (MQ=255) aCCAGATGAAGCTGCGTCGCGGGCCGCTGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGc > 1:1001944/1‑150 (MQ=255) ccAGATGAAGCTGCGTCGCGGGCCGCTGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCt < 2:1287237/150‑1 (MQ=255) cAGATGAAGCTGCGTCGCGGGCCGCTGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTg > 1:909479/1‑150 (MQ=255) cAGATGAAGCTGCGTCGCGGGCCGCTGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTg > 2:1368875/1‑150 (MQ=255) gATGAAGCTGCGTCGCGGGCCGCTGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGc > 2:748308/1‑150 (MQ=255) gATGAAGCTGCGTCGCGGGCCGCTGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGc > 1:1165214/1‑150 (MQ=255) gATGAAGCTGCGTCGCGGGCCGCTGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTAGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGc > 1:532452/1‑150 (MQ=255) gAAGCCGCGGCGCGGGGCGCTGGCACCGGACACCCCGTAAAGCGACAACTTCCGGGTTAAGCGCTAAATCGCCAAGGACACCATCCACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCCAGCTTGCCGa < 2:1214873/150‑1 (MQ=255) aGCTGCGTCGCGGGCCGCTGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCCAGCTTGCCGAcc < 1:2318146/150‑1 (MQ=255) aGCTGCGTCGCGGGCCGCTGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGAcc < 1:1898922/150‑1 (MQ=255) gCTGCGTCGCGGGCCGCTGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGAcc < 1:2216655/149‑1 (MQ=255) gCTGCGTCGCGGGCCGCTGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGAcc > 2:2216655/1‑149 (MQ=255) gCTGCGTCGCGGGCCGCTGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCt < 1:905716/150‑1 (MQ=255) tGCGTCGCGGGCCGCTGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTgg < 1:746676/150‑1 (MQ=255) gcgGGGCGCTGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTGCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCtgt < 2:172158/150‑1 (MQ=255) cGCTGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGc > 2:1910894/1‑150 (MQ=255) tGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAg < 1:748308/150‑1 (MQ=255) tGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCAAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGGCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAg > 2:1290517/1‑150 (MQ=255) gCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCg > 2:1798477/1‑150 (MQ=255) ccGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCCTGCTTGCTGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTc > 1:762387/1‑150 (MQ=255) gACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCttt < 2:1165214/150‑1 (MQ=255) cccGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGcc > 2:2139205/1‑135 (MQ=255) cccGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGcc < 1:2139205/135‑1 (MQ=255) ccGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCtgtg < 1:291720/128‑1 (MQ=255) ccGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGGCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCtgtg > 2:291720/1‑128 (MQ=255) ccGCACAGCGACAACTAACGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCACCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTc > 2:1602819/1‑150 (MQ=255) gTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGAAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCaa < 2:2269160/150‑1 (MQ=255) gACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGATGTGGTCGCAGGAGGTCGTTGCTTTCAAGCCGGcc > 1:1020357/1‑150 (MQ=255) aaCTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCCAGCt > 1:1503586/1‑98 (MQ=255) aaCTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCCAGCt < 2:1503586/98‑1 (MQ=255) cTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGt < 1:506761/150‑1 (MQ=255) ttCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAGCCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTCGCGCACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTg > 1:1954136/1‑150 (MQ=255) ttCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTg > 1:1564390/1‑150 (MQ=255) cGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCTACCCGTCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTc < 1:860037/150‑1 (MQ=255) gTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTc < 2:2052645/110‑1 (MQ=255) gTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTc > 1:2052645/1‑110 (MQ=255) tCATGCCCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAgg > 2:1298214/1‑150 (MQ=255) gcgcTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCtt < 2:1920486/117‑1 (MQ=255) gcgcTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCtt > 1:1920486/1‑117 (MQ=255) gcgcTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCgg > 1:1112503/1‑150 (MQ=255) gcTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGga < 1:613667/150‑1 (MQ=255) cTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGgat > 2:2285896/1‑150 (MQ=255) aTCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACTAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTACTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGgatgccc < 2:1611209/150‑4 (MQ=255) aTCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGt > 1:1556952/1‑131 (MQ=255) aTCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGTATGATc < 2:532452/150‑1 (MQ=255) aTCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATc < 1:927805/150‑1 (MQ=255) aTCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAACCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGt < 2:1556952/131‑1 (MQ=255) ccAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCa < 1:1910894/150‑1 (MQ=255) ccAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGAGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGAGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCACGGGCGGGCTGATCGtaa > 2:134084/1‑148 (MQ=255) cAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCAc < 1:1368875/150‑1 (MQ=255) gTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCaa > 2:82874/1‑129 (MQ=255) gTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCaa < 1:82874/129‑1 (MQ=255) tACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGc < 1:2189334/104‑1 (MQ=255) tACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGc > 2:2189334/1‑104 (MQ=255) cacCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTg > 1:1862716/1‑121 (MQ=255) cacCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTg < 2:1862716/121‑1 (MQ=255) cacCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGgatg > 1:218513/1‑136 (MQ=255) cacCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGgatg < 2:218513/136‑1 (MQ=255) cacCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGcc > 1:1261968/1‑150 (MQ=255) cATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTTCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCAt > 2:1108807/1‑150 (MQ=255) aTCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCAtc < 2:1653395/150‑2 (MQ=255) tCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCAGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATgg > 1:1718304/1‑150 (MQ=255) caCCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGc < 1:1108807/149‑1 (MQ=255) aaCCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCgg > 1:2071726/1‑125 (MQ=255) aaCCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCgg < 2:2071726/125‑1 (MQ=255) aaCCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATggga < 2:604529/150‑2 (MQ=255) aaCCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATgg < 1:1912200/148‑1 (MQ=255) aaCCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATgg > 2:1912200/1‑148 (MQ=255) cGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGt > 2:1034201/1‑109 (MQ=255) cGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGt < 1:1034201/109‑1 (MQ=255) gCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGga > 2:1778500/1‑121 (MQ=255) gCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGga < 1:1778500/121‑1 (MQ=255) gCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATc > 1:432884/1‑126 (MQ=255) gCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATc < 2:432884/126‑1 (MQ=255) cTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGACATCAAc < 1:1162147/150‑1 (MQ=255) cACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGACATCAACgg < 1:1074861/150‑1 (MQ=255) ccATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGACATCAACGGCTc < 2:1001944/150‑1 (MQ=255) cATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGACATCAACGGCTcc < 1:2285896/150‑1 (MQ=255) tCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGa > 2:323712/1‑130 (MQ=255) tCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGACATCAACGGCTCCATacccc > 2:1089540/1‑149 (MQ=255) ggTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGACATCAACGGCTCCATacccacc < 1:715296/150‑1 (MQ=255) tCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGACATCAACGGCTCCATACCCAcccc > 2:1996331/1‑150 (MQ=255) aCGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGACATCAACGGCTCCATACCCAcccccc > 2:2303718/1‑150 (MQ=255) cgtaGTGGGCTCGGTTGAGCTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGTCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGAGATCAACGGCTCCATACCCACCCCCCa < 2:1020357/147‑1 (MQ=255) aGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATgg < 2:217823/116‑1 (MQ=255) aGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATgg > 1:217823/1‑116 (MQ=255) gCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGACATCAACGGCTCCATACCCACCCCCCAGCCGGTGc > 2:1694528/1‑150 (MQ=255) cTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGACATCAACGGCTCCATACCCACCCCCCAGCCGGTGCa > 1:1107244/1‑150 (MQ=255) tGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGACATCAACGGCTCCATACCCACCCCCCAGCCGGTGCACTATc < 2:2401839/150‑1 (MQ=255) caGGTCGGCCAGCTTGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCAc > 2:1980227/2‑92 (MQ=255) caGGTCGGCCAGCTTGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGACAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCAc < 1:1980227/91‑1 (MQ=255) aGGTCGGCCAGCTTGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGACATCAACGGCTCCATACCCACCCCCCAGCCGGTGCACTATCGGc > 1:776156/1‑150 (MQ=255) ggTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATggg > 2:2054632/1‑102 (MQ=255) ggTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATggg < 1:2054632/102‑1 (MQ=255) tCGGCCAGCTTGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCgg > 1:1081606/1‑76 (MQ=255) tCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGACATCAACGGCTCCATACCCACCCCCCAGCCGGTGCACTATCGGCCGa > 2:820727/1‑150 (MQ=255) cGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGACATCAACGGCTCCATACCCACCCCCCAGCCGGTGCACTATCGGCCGAt > 1:2408406/1‑150 (MQ=255) cAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGACATCAACGGCTCCATACCCACCCCCCAGCCGGTGCACTATCGGCCGATGtt > 2:651808/1‑150 (MQ=255) | GCACCAGATGAAGCTGCGTCGCGGGCCGCTGGCACCGGACACCCCGTACAGCGACAACTTCCGGGTCAAGCGCTACATCGCCAAGTACACCATCAACCCGGCACTCACCCATGGCATCGGTCACGAAGTGGGCTCGGTGGAGGTCGGCAAGCTGGCCGACCTGGTGCTGTGGTCGCCAGCGTTCTTTGCGGTCAAGCCGGCCCTGGTGCTCAAGGGCGGGATGATCGTCACCGCGCCCATGGGCGACATCAACGGCTCCATACCCACCCCCCAGCCGGTGCACTATCGGCCGATGTT > NC_002947/3249557‑3249853 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |