| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,253,880 | A→G | 5.3% | V634A (GTG→GCG) | PP_2852 ← | sulfatase domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,253,880 | 0 | A | G | 5.3% | 466.8 / 10.1 | 151 | V634A (GTG→GCG) | PP_2852 | sulfatase domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (70/72); new base G (6/2); total (77/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.78e-01 | |||||||||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
GAAGCTGAACTCCATCTCCAGTGGCGCGTCGGTGGTGACCTTTACCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCGGGGTTTGCAGCAAGGATTG > NC_002947/3253735‑3254028 | gCTGAACTCCATCTCCAGTGGCGCGTCGGTGGTGACCTTTACCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGgt < 1:2042539/150‑1 (MQ=255) gCTGAACTCCATCTCCAGTGGCGCGTCGGTGGTGACCTTTACCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGgt < 2:2277642/150‑1 (MQ=255) cATCTCCAGTGGCGAGTCGGTGGTGACCTTTACCTCTTCTGGCCGACCCCAAGCCCAAGCCTATTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGcc > 2:1192004/1‑150 (MQ=255) aTCTCCAGTGGCGCGTCGGTGGTGACCTTTACCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCt > 1:50547/1‑150 (MQ=255) aTCTCCAGTGGCGCGTCGGTGGTGACCTTTACCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCt > 1:473499/1‑150 (MQ=255) ccAGTGGCGCGTCGGTGGTGACCTTTACCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGgt > 2:1511993/1‑136 (MQ=255) ccAGTGGCGCGTCGGTGGTGACCTTTACCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGgt < 1:1511993/136‑1 (MQ=255) gcgcGTCGGTGGTGACCTTTACCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGAACTTGAGCCGCACGGGGGTGTGCGGGGCTTCGGGAAttt > 2:1358813/1‑150 (MQ=255) cgTCGGTGGTGACCTTTACCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCa < 2:473499/150‑1 (MQ=255) cgTCGGTGGTGAACTTTAACTCTTCCGGAAGGCCAACTGGAGCGTCCT‑TTCCAACCTTCTTAGCCCTGTGCTTGATGTAGCCCGCACGTTTGTGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCa < 2:2308047/150‑1 (MQ=255) gTCGGTGGTGACCTTTACCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCa > 2:2284018/1‑143 (MQ=255) gTCGGTGGTGACCTTTACCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCa < 1:2284018/143‑1 (MQ=255) gtggtgACCTTTACCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATAc < 1:322147/150‑1 (MQ=255) gtggtgACCTTTACCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATAc > 1:1782921/1‑150 (MQ=255) tggtgACCTTTACCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACt > 1:2249260/1‑150 (MQ=255) gtgACCTTTACCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTgg < 1:2409673/150‑1 (MQ=255) gACCTTTCCCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTCGCGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCCAGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGgc < 2:768088/150‑1 (MQ=255) aCCTTTACCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGa > 2:1294245/1‑141 (MQ=255) 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tACCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CCGCTTGCCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCNCNCNCGGGTGTGCGAGCCNNCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAAt < 1:1358813/150‑1 (MQ=255) ctctTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAAt > 2:1158567/1‑147 (MQ=255) ctctTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAg > 2:313807/1‑150 (MQ=255) ctctTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAg > 2:1443312/1‑150 (MQ=255) ctctTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAg < 1:2367839/150‑1 (MQ=255) 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gcgagcgGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCg < 1:988858/150‑1 (MQ=255) gagcgGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCggg < 1:1192004/150‑1 (MQ=255) gcgGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCGGGGt < 2:1639190/150‑1 (MQ=255) gcgGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCGGGGt < 1:1216869/150‑1 (MQ=255) ggACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCGGGGttt > 2:1391516/1‑150 (MQ=255) tcgcacaCCCGCGTGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCg > 1:27067/7‑142 (MQ=255) tcgcacaCCCGCGTGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCGGGGTTTgc > 2:1137893/7‑150 (MQ=255) aCCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCCGACCCTGGGCGCGTATGAGGTTGTAGGCCCAGTCATTGTCCGTGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCGGGGTTTgc < 2:2078793/150‑1 (MQ=255) aCCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTCGCGCAGGTTGAGCGGGGTTTgc < 1:685994/150‑1 (MQ=255) aCCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCGGGGTTTgc < 2:567462/150‑1 (MQ=255) ccTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCACCTGAAGCGTCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCGGGGTTTgca < 1:1642167/150‑1 (MQ=255) cTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAgcg > 2:1454327/1‑129 (MQ=255) cTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAgcg < 1:1454327/129‑1 (MQ=255) cTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCGGGGTTTgcag > 2:1015502/1‑150 (MQ=255) ttGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGa < 1:1275365/136‑1 (MQ=255) ccGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGCTCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCa > 2:1056124/1‑125 (MQ=255) ccGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGACGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCa < 1:1056124/125‑1 (MQ=255) ccGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCgg > 1:938177/1‑135 (MQ=255) ccGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCgg < 2:938177/135‑1 (MQ=255) ccGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCGGGGTTTGCAGCAAGGa > 2:1563348/1‑150 (MQ=255) ccGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCGGGGTTTGCAGCAAGGa > 1:1350498/1‑150 (MQ=255) cACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCGGGGTTTGCAGCAAGGATTg < 1:1169903/150‑1 (MQ=255) cACGCGGGGGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCGGGGTTTGCAGCAAGGATTg < 2:240629/150‑1 (MQ=255) | GAAGCTGAACTCCATCTCCAGTGGCGCGTCGGTGGTGACCTTTACCTCTTCTGGCAGGCCCAGCGGCACGTCCTGTTCCAA‑CTGCTTGGCCTTGAGCCGGATGTAGGCCGCACGTTTGGGGTCCAGCGAGCGGACCTTGACCCGCACGCGGGTGTGCGAGCCTCCGGGCATTTCCAGATACTGGGCGCCAATGAGGTTGTCGGCCCAGTCATCGTCAATGCGCTTGCGCAACTTGATCGGCGAAGGGCCGCCGAACTGGTAGCGCAGGTTGAGCGGGGTTTGCAGCAAGGATTG > NC_002947/3253735‑3254028 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |