| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,520,127 | T→A | 5.7% | intergenic (+703/‑177) | PP_5580 → / → PP_5582 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,520,127 | 0 | T | A | 5.7% | 286.3 / 5.6 | 87 | intergenic (+703/‑177) | PP_5580/PP_5582 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/47); new base A (3/2); total (38/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
TTTGACGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATTGTTTGTTGTGTCTCAG > NC_002947/3519978‑3520275 | tttGACGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTAt < 1:146487/150‑1 (MQ=255) cGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTAGATAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATgcaag < 1:1230345/150‑1 (MQ=255) tGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATgcaagcaa < 2:100276/150‑1 (MQ=255) gAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAAt > 1:592989/1‑150 (MQ=255) aaGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATa < 1:2140448/150‑1 (MQ=255) ggAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGt > 1:282063/1‑150 (MQ=255) ggAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGt < 2:1081699/150‑1 (MQ=255) cTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCCATAGTGCTCCTg < 2:1842899/150‑1 (MQ=255) cTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTg > 1:1822581/1‑150 (MQ=255) aTTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGt < 1:1031421/150‑1 (MQ=255) ttAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTa < 2:1822581/150‑1 (MQ=255) tAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTAc > 2:2087954/1‑150 (MQ=255) tGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATAtt < 2:968806/150‑1 (MQ=255) gggTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCa < 1:287102/150‑1 (MQ=255) tCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTg < 2:2382181/150‑1 (MQ=255) tatTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGc < 1:2160966/150‑1 (MQ=255) atTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATgcaag > 2:2258917/1‑114 (MQ=255) atTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATgcaag < 1:2258917/114‑1 (MQ=255) tttGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCga > 2:1515370/1‑150 (MQ=255) aaTCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGc > 2:1571139/1‑150 (MQ=255) aaTCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGc < 2:282063/150‑1 (MQ=255) aaTCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGCGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGc > 2:2053318/1‑150 (MQ=255) aTCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATa > 2:1937084/1‑111 (MQ=255) aTCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATa < 1:1937084/111‑1 (MQ=255) aGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATa < 1:806963/107‑1 (MQ=255) aGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATa > 2:806963/1‑107 (MQ=255) aGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTa < 2:1179870/113‑1 (MQ=255) aGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTa > 1:1179870/1‑113 (MQ=255) aGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGt < 1:88429/150‑1 (MQ=255) aGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGGGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGt > 1:2291152/1‑150 (MQ=255) atatatCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTg < 2:2119521/150‑1 (MQ=255) tatatCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAg > 2:1415658/1‑99 (MQ=255) tatatCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAg < 1:1415658/99‑1 (MQ=255) atCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTAc > 2:1827859/1‑108 (MQ=255) atCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTAc < 1:1827859/108‑1 (MQ=255) atCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCtt < 1:1693202/150‑1 (MQ=255) aTGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTc < 1:570856/98‑1 (MQ=255) aTGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTc > 2:570856/1‑98 (MQ=255) ccTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTTGAGATATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTa < 2:592989/150‑1 (MQ=255) cTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTAc > 1:499909/1‑150 (MQ=255) cTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTAc < 1:918650/150‑1 (MQ=255) cTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTAc < 1:2087954/150‑1 (MQ=255) ggaggaCGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGCGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGa < 1:2053318/150‑1 (MQ=255) gTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTAt > 2:37152/1‑131 (MQ=255) gTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTAt < 1:37152/131‑1 (MQ=255) gAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACa < 2:404290/84‑1 (MQ=255) gAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACa > 1:404290/1‑84 (MQ=255) gAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCaaaa < 1:1258091/150‑1 (MQ=255) atTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGc > 2:1255089/1‑150 (MQ=255) gTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCt > 1:2071490/1‑150 (MQ=255) gTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCt > 1:2363666/1‑150 (MQ=255) gTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCt > 2:1281934/1‑150 (MQ=255) gTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCt > 1:919957/1‑150 (MQ=255) gAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACaaa < 1:1515370/150‑1 (MQ=255) aaTATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTAt < 1:17728/113‑1 (MQ=255) aaTATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTAt > 2:17728/1‑113 (MQ=255) atatAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCaaaa > 2:1291734/1‑133 (MQ=255) atatAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCaaaa < 1:1291734/133‑1 (MQ=255) tataGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTc > 1:1189131/1‑150 (MQ=255) tataGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTc > 1:705520/1‑150 (MQ=255) aGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAg < 1:1571139/150‑1 (MQ=255) gtgAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTAc < 1:750565/58‑1 (MQ=255) gtgAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTAc > 2:750565/1‑58 (MQ=255) aaGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAg > 1:1567393/1‑143 (MQ=255) aaGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAg < 2:1567393/143‑1 (MQ=255) agcagcACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGaa < 2:2071490/150‑1 (MQ=255) gcaCGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTa > 2:309746/1‑150 (MQ=255) cGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCa < 1:2266057/119‑1 (MQ=255) cGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCa > 2:2266057/1‑119 (MQ=255) taTAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCTTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGt < 1:1362985/149‑1 (MQ=255) tAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGa < 1:1255089/150‑1 (MQ=255) tATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGAttg > 2:1793427/1‑150 (MQ=255) aTCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAATTATTCATTGAGCGAGATGGCGaaa < 1:1863539/68‑1 (MQ=255) aTCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGaaa > 2:1863539/1‑68 (MQ=255) aTCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGt > 1:2028284/1‑108 (MQ=255) aTCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGt < 2:2028284/108‑1 (MQ=255) aTCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGAttgt > 1:2092176/1‑150 (MQ=255) ctattgcttgcaTAAGCAAGCATTAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAg > 1:68488/5‑126 (MQ=255) ctattgcttgcaTAAGCAAGCATTAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAg < 2:68488/122‑1 (MQ=255) tattgcttgcaTAAGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGAttgttt > 2:1573742/4‑150 (MQ=255) aTGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGAttgtttgt < 2:1189131/150‑1 (MQ=255) gcttgcttATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATTGTttgttg < 2:499909/150‑1 (MQ=255) cttgcttATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATTGTTtgttgt < 2:919957/150‑1 (MQ=255) cttgcatAAGCAAGCATTAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTAc > 2:1820100/1‑84 (MQ=255) cttgcatAAGCAAGCATTAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTAc < 1:1820100/84‑1 (MQ=255) tgcttATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATTGTTTGTTgtgt < 2:2363666/150‑1 (MQ=255) tATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATTGTTTGTTGTGTCTCa < 2:2291152/150‑1 (MQ=255) aTGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATTGTTTGTTGTGTCTCAg < 1:1281934/150‑1 (MQ=255) | TTTGACGATGAAGGAAAGGCTATTAGGGCGTCTGGGGTCATATTTGAGAATCGAGTCCCAGATATATCATGCCGCCTGGAGGACGATGGTGAATATTGGTGCTATGAATATAGGTGTGAAGCAGCACGGATAGTATCAATGCTTGCTTATGCAAGCAATAGTGCTCCTGGTACAGAAATATTCATTGAGCGAGATGGCGAAAGCGTGGTTGGCTTGTATTTTTACGACAAAAATTCAAAAGTGCACCTTTACAAAGTCTAGCTGTCGAATTTATGCGTGATTGTTTGTTGTGTCTCAG > NC_002947/3519978‑3520275 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |