| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,614,219 | T→A | 5.3% | W17R (TGG→AGG) | pet → | protein Pet18 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,614,219 | 0 | T | A | 5.3% | 295.4 / 6.1 | 94 | W17R (TGG→AGG) | pet | protein Pet18 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (49/40); new base A (3/2); total (52/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.66e-01 | |||||||||||
GGATGGGGCTTGTAACCTGCCTTTTTGCCGGCCTCACTGCGAGGCCAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTCCAGGACCACCGTTTCCTCGACAGCTTCCTGACCCTGCTGGGCGCGGCCATCGCCACCGCTGACACG > NC_002947/3614073‑3614368 | ggATGGGGCTTGTAACCTGCCTTTTTGCCGGCCTCACTGCGAGGCCAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGt > 1:1689962/1‑150 (MQ=255) ggggCTTGTAACCTGCCTTTTTGCCGGCCTCACTGCGAAGCCATTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTcggc < 2:1955224/150‑1 (MQ=255) gggCTTGTAACCTGCCTTTTTGCCGGCCTCACTGCGAGGCCAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTcggcg < 1:687650/150‑1 (MQ=255) ggCTTGTAACCTGCCTTTTTGTCGGCCTCACTGCGAGGCCAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCAGGTcggctc < 2:317376/150‑3 (MQ=255) ttGTAACCTGCCTTTTTGCCGGCCTCACTGCGAGGCCAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCg > 1:1599561/1‑150 (MQ=255) tAACCTGCCTTTTTGCCGGCCTCACTGCGAGGCCAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTg < 2:657193/150‑1 (MQ=255) tAACCTGCCTTTTTGCCGGCCTCACTGCGAGGCCAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTg < 1:1662562/150‑1 (MQ=255) aaCCTGCCTTTTTGCCGGCCTCACTGCGAGGCCAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCTACATGACCGAACGTTTCAGCAAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTcggcggatgttag > 2:1600004/1‑143 (MQ=255) aCCTGCCTTTTTGCCGGCCTCACTGCGAGGCCAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGc < 1:1713598/150‑1 (MQ=255) gCCTTTTTGCCGGCCTCACTGCGAGGCCAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTTGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCAcc > 2:412047/1‑150 (MQ=255) tttGCCGGCCTCACTGCGAGGCCAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTc < 1:791227/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCCTCACTGCGAGGCCAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGt < 2:1689962/150‑1 (MQ=255) cGGCCTCACTGCGAGGCCAGTCCATGTCAATTGTCAAGGGCTCTCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGAc < 2:572476/150‑1 (MQ=255) cGGCCTCACTGCGAGGCCAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGAc > 1:1760467/1‑150 (MQ=255) cACTGCGAGGCCAGTCCATGTCCATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGAtt > 2:449270/1‑150 (MQ=255) gCGAGGCCAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGc < 2:2247401/150‑1 (MQ=255) gAGGCCAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACATCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGa > 1:305602/1‑150 (MQ=255) gAGGCCAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGa > 1:1367030/1‑150 (MQ=255) gCCAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACgg < 1:1560687/150‑1 (MQ=255) cAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTc < 2:323733/128‑1 (MQ=255) cAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTc > 1:323733/1‑128 (MQ=255) cAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCa > 1:1766124/1‑150 (MQ=255) aGTCCATGTCAATTCCCAAGGCATAGATGTCACCAACATCAAGGACAGCAACATGACCTAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAg > 2:1835825/1‑150 (MQ=255) gTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCAc < 1:879036/114‑1 (MQ=255) gTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCAc > 2:879036/1‑114 (MQ=255) aagtGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGAc > 1:2153352/4‑150 (MQ=255) aaTTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGAc < 2:10978/150‑1 (MQ=255) cAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCAGGTcggctc > 1:2124433/1‑92 (MQ=255) cAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCAGGTcggctc < 2:2124433/94‑3 (MQ=255) aaGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCa > 1:2255746/1‑150 (MQ=255) aaGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCa > 2:289986/1‑150 (MQ=255) ggTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATg < 2:1511279/150‑1 (MQ=255) ggTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATg < 1:997703/150‑1 (MQ=255) tcttGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGt < 1:412047/150‑1 (MQ=255) tcGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGa < 2:1462587/141‑1 (MQ=255) tcGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGa > 1:1462587/1‑141 (MQ=255) gCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTAACCCGATTGTGCTGCGTGAGCCTGCCTGACCCGATCATGTTGGAc > 1:349346/1‑150 (MQ=255) gTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTAc < 1:699004/150‑1 (MQ=255) aCCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTg < 2:1367030/150‑1 (MQ=255) aCCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTg > 1:1319019/1‑150 (MQ=255) cccTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGAGCATGGTCGACTACCTgg > 1:81192/1‑150 (MQ=255) ccTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGt > 2:405915/1‑150 (MQ=255) ccTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGt > 1:432558/1‑150 (MQ=255) cTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTc < 2:1760467/150‑1 (MQ=255) cTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTc < 1:449270/150‑1 (MQ=255) tcatcaAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGAtt < 1:601387/103‑1 (MQ=255) tcatcaAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGAtt > 2:601387/1‑103 (MQ=255) tcatcaAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAgc < 2:289758/116‑1 (MQ=255) tcatcaAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAgc > 1:289758/1‑116 (MQ=255) tcaAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTCCAgg > 1:96172/1‑150 (MQ=255) aCAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCGGGTCCAGGaccacc < 2:2153352/150‑1 (MQ=255) aGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAgcct > 2:407100/1‑107 (MQ=255) aGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAgcct < 1:407100/107‑1 (MQ=255) aGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAgc < 1:389234/105‑1 (MQ=255) aGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAgc > 2:389234/1‑105 (MQ=255) aaCATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTCCAGGACCACCGTTTc > 1:366885/1‑150 (MQ=255) ccGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTCCAGGACCACCGTTTCCTCGACa < 1:405915/150‑1 (MQ=255) cGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTCCAGGACCACCGTTTCCTCGACAg > 2:98158/1‑150 (MQ=255) 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aCGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGAc > 2:524677/1‑100 (MQ=255) aCGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGAc < 1:524695/100‑1 (MQ=255) cGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTCCAGGACCACCGTTTCCTCGACAGCTTc < 1:1600004/150‑1 (MQ=255) gCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGt > 2:1838693/1‑103 (MQ=255) gCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGt < 1:1838693/103‑1 (MQ=255) gCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTCCAGGACCACCGTTTCCTCGACAGCTTCCTGAccc > 1:2018443/1‑150 (MQ=255) ccAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTCCa > 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1:1881257/90‑1 (MQ=255) ccTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTCCAGGACCACCGTTTCCTCGACAGCTTCCTGACCCTGCTggg > 2:1855926/1‑150 (MQ=255) cTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTAcc < 1:1899351/103‑1 (MQ=255) cTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTAcc > 2:1899351/1‑103 (MQ=255) gccAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTCCAGGACCACCGTTTCCTCGACAGCTTCCTGACCCTGCTGGGCGCGGCCa > 1:812895/1‑150 (MQ=255) agcgagcCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGt < 1:442758/83‑1 (MQ=255) agcgagcCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGt > 2:442758/1‑83 (MQ=255) gcgagcCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTAc < 1:2228318/89‑1 (MQ=255) gcgagcCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTAc > 2:2228318/1‑89 (MQ=255) ctagcCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGGCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTCCAGGACGACCGTTTCCTCGACAGCTTCCTGACCCTGCTGGGCGCGGc < 1:102616/139‑1 (MQ=255) cgagcCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTCCAGGACCACCGTTTCCTCGACAGCTTCCTGACCCTGCTGGGCGCGGc > 2:102616/1‑141 (MQ=255) ccgcCGACCAGGTCGGCGGCCGTTGGCTACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTCCAGGACCACCGTTTCCTCGACAGCTTCCTGACCCTGCTGGGCGCGGCCATCGCCAcc > 1:1029184/3‑150 (MQ=255) ccgcCGACCAGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTTGACTACCTGGTCCAGGACCACCGTTTCCTCGACAGCTTCCTGACCCTGCTGGGCGCGGCCATCGCCAcc > 1:1414980/3‑150 (MQ=255) aCCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTc < 1:1622226/75‑1 (MQ=255) aCCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTc > 2:1622226/1‑75 (MQ=255) cTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATg < 1:1361566/70‑1 (MQ=255) cTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATg > 2:1361566/1‑70 (MQ=255) tGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTCCAGGACCACCGTTTCCTCGACAGCTTCCTGACCCTGCTGGGCGCGGCCATCGCCACCGCTGa < 2:1013297/146‑1 (MQ=255) tGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTCCAGGACCACCGTTTCCTCGACAGCTTCCTGACCCTGCTGGGCGCGGCCATCGCCACCGCTGa > 1:1013297/1‑146 (MQ=255) tGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTCCAGGACCACCGTTTCCTCGACAGCTTCCTGACCCTGCTGGGCGCGGCCATCGCCACCGCTGACACg > 2:1533003/1‑150 (MQ=255) | GGATGGGGCTTGTAACCTGCCTTTTTGCCGGCCTCACTGCGAGGCCAGTCCATGTCAATTGCCAAGGTCTCGCTGTCACCCTCATCAAGGACAGCAACATGACCGAACGTTTCAGCCAGTCCCTGCGCCGCCAGAGCGAGCCGACCTGGTCGGCGGCCGTTGGCCACCGTTTCGTGACCCGATTGTGCGACGGCAGCCTGCCTGACCCGATCATGGTCGACTACCTGGTCCAGGACCACCGTTTCCTCGACAGCTTCCTGACCCTGCTGGGCGCGGCCATCGCCACCGCTGACACG > NC_002947/3614073‑3614368 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |